More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2570 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  100 
 
 		 562 aa  1117    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  92.18 
 
 		 563 aa  1037    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  52.12 
 
 		 570 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  52.94 
 
 		 558 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  50.89 
 
 		 564 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  48.06 
 
 		 573 aa  551  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  47.99 
 
 		 787 aa  543  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  46.5 
 
 		 558 aa  498  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  45.47 
 
 		 553 aa  491  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  44.4 
 
 		 553 aa  487  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  45.95 
 
 		 553 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  43.68 
 
 		 554 aa  482  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  43.53 
 
 		 568 aa  484  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  47.08 
 
 		 571 aa  477  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  46.57 
 
 		 559 aa  473  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  46.1 
 
 		 555 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  43.46 
 
 		 568 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  42.5 
 
 		 568 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  41.56 
 
 		 564 aa  462  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  43.39 
 
 		 561 aa  457  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  42.22 
 
 		 553 aa  456  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  42.07 
 
 		 561 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  42.29 
 
 		 557 aa  456  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  43.67 
 
 		 871 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  41.86 
 
 		 557 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  42.21 
 
 		 603 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.11 
 
 		 568 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.75 
 
 		 568 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  42.96 
 
 		 556 aa  453  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.93 
 
 		 568 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.21 
 
 		 563 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  42.86 
 
 		 599 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  42.68 
 
 		 599 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.35 
 
 		 571 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  41.77 
 
 		 570 aa  447  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  42.42 
 
 		 566 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  43.03 
 
 		 599 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.15 
 
 		 568 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  41.49 
 
 		 569 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  41.49 
 
 		 571 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  41.31 
 
 		 558 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.5 
 
 		 568 aa  435  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  40.97 
 
 		 561 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  41.02 
 
 		 575 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  39.36 
 
 		 568 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.54 
 
 		 568 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.54 
 
 		 568 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  40.97 
 
 		 561 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  41.2 
 
 		 577 aa  431  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  41.18 
 
 		 561 aa  429  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.56 
 
 		 571 aa  428  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  41.46 
 
 		 885 aa  428  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  38.9 
 
 		 578 aa  425  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  39.35 
 
 		 560 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  42.06 
 
 		 561 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.82 
 
 		 568 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  41.59 
 
 		 570 aa  422  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  39.4 
 
 		 582 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  42.07 
 
 		 554 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  38.49 
 
 		 578 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  38.89 
 
 		 891 aa  419  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  40.65 
 
 		 586 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  39.71 
 
 		 568 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  37.39 
 
 		 567 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  40.07 
 
 		 574 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  39.46 
 
 		 577 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  43.35 
 
 		 520 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  39.61 
 
 		 584 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  41.26 
 
 		 546 aa  413  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  38.32 
 
 		 586 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  39.29 
 
 		 577 aa  415  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  40.17 
 
 		 573 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  37.48 
 
 		 572 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  39.79 
 
 		 591 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 806 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  40.39 
 
 		 586 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  39.25 
 
 		 585 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  39.43 
 
 		 589 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  39.68 
 
 		 586 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  39.68 
 
 		 586 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  38.83 
 
 		 577 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  39.68 
 
 		 586 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  40.43 
 
 		 637 aa  412  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  40.6 
 
 		 586 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  38.48 
 
 		 573 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  40.6 
 
 		 586 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  38.97 
 
 		 586 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  44.28 
 
 		 514 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2090  type II secretion system protein E  38.2 
 
 		 573 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  39.34 
 
 		 565 aa  407  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  44.28 
 
 		 520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  41.41 
 
 		 823 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  36.54 
 
 		 576 aa  408  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  38.82 
 
 		 612 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  38.35 
 
 		 570 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  38.37 
 
 		 578 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  39.5 
 
 		 586 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  39.68 
 
 		 586 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  40.59 
 
 		 573 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  37.61 
 
 		 585 aa  405  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>