More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0879 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  100 
 
 		 569 aa  1154    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  59.04 
 
 		 577 aa  671    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  57.75 
 
 		 585 aa  658    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  65.8 
 
 		 578 aa  752    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  55.03 
 
 		 589 aa  620  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  54.31 
 
 		 594 aa  621  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  55.5 
 
 		 574 aa  611  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  51.69 
 
 		 637 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  51.15 
 
 		 570 aa  575  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  51.4 
 
 		 582 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  50.88 
 
 		 612 aa  565  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  49.82 
 
 		 577 aa  560  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  49.91 
 
 		 570 aa  557  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3344  type II secretion system protein E  50.7 
 
 		 586 aa  555  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0160309  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  49.29 
 
 		 586 aa  548  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  48.87 
 
 		 587 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  48.6 
 
 		 584 aa  548  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  49.21 
 
 		 585 aa  549  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  48.6 
 
 		 586 aa  548  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  48.95 
 
 		 586 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  48.78 
 
 		 586 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  48.78 
 
 		 586 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  48.78 
 
 		 586 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  50.72 
 
 		 574 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  48.78 
 
 		 586 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  48.78 
 
 		 586 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0563  type II secretion system protein E  48.78 
 
 		 586 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  48.78 
 
 		 586 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  47.9 
 
 		 586 aa  531  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  49.64 
 
 		 574 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  49.55 
 
 		 575 aa  498  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  44.74 
 
 		 558 aa  472  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  45.28 
 
 		 553 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  44.8 
 
 		 558 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  44.9 
 
 		 553 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  42.76 
 
 		 571 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  43.23 
 
 		 591 aa  450  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  44.01 
 
 		 559 aa  449  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  41.29 
 
 		 871 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  41.49 
 
 		 562 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.88 
 
 		 571 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  40.59 
 
 		 568 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  41.87 
 
 		 563 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.74 
 
 		 563 aa  436  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.27 
 
 		 568 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  40.78 
 
 		 566 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  40.63 
 
 		 568 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.37 
 
 		 568 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  41.5 
 
 		 570 aa  435  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.48 
 
 		 568 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  38.66 
 
 		 787 aa  430  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  42.01 
 
 		 561 aa  432  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  40.57 
 
 		 565 aa  429  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  45.02 
 
 		 564 aa  430  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.07 
 
 		 568 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.65 
 
 		 568 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  41.25 
 
 		 568 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.25 
 
 		 568 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  40.49 
 
 		 553 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  42.1 
 
 		 557 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  41.22 
 
 		 564 aa  427  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  40.04 
 
 		 561 aa  424  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  41.04 
 
 		 556 aa  422  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  40.56 
 
 		 573 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  41.25 
 
 		 557 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  39.72 
 
 		 570 aa  425  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  39.82 
 
 		 555 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  40.67 
 
 		 571 aa  425  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  42.42 
 
 		 554 aa  419  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  43.26 
 
 		 561 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  40.88 
 
 		 568 aa  421  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  43.82 
 
 		 521 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  43.01 
 
 		 572 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.78 
 
 		 568 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  44.15 
 
 		 520 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  44.19 
 
 		 520 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  43.63 
 
 		 553 aa  415  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  40.57 
 
 		 563 aa  411  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  45.88 
 
 		 514 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  41.32 
 
 		 578 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  38.41 
 
 		 577 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  39.9 
 
 		 577 aa  406  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.3 
 
 		 568 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  37.03 
 
 		 561 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  40.87 
 
 		 575 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  36.64 
 
 		 558 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  39.54 
 
 		 580 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  41.19 
 
 		 577 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  45.65 
 
 		 520 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  40.98 
 
 		 578 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  38.68 
 
 		 552 aa  397  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  45.22 
 
 		 520 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  38.16 
 
 		 567 aa  395  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  39.12 
 
 		 573 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  39.08 
 
 		 568 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.28 
 
 		 570 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.28 
 
 		 570 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.28 
 
 		 570 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.11 
 
 		 570 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  39.35 
 
 		 573 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>