More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0563 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  65.49 
 
 
570 aa  748    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  61.04 
 
 
574 aa  677    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  60.21 
 
 
575 aa  645    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  94.71 
 
 
586 aa  1107    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  64.85 
 
 
570 aa  748    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  95.73 
 
 
586 aa  1119    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  86.51 
 
 
585 aa  1034    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  57.8 
 
 
574 aa  647    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  95.05 
 
 
586 aa  1114    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  86.46 
 
 
577 aa  1028    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  95.9 
 
 
586 aa  1122    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  85.81 
 
 
584 aa  1022    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  83.79 
 
 
586 aa  1012    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  60 
 
 
574 aa  670    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3344  type II secretion system protein E  83.28 
 
 
586 aa  987    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0160309  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  95.9 
 
 
586 aa  1122    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  57.61 
 
 
589 aa  669    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  63.75 
 
 
637 aa  741    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0563  type II secretion system protein E  100 
 
 
586 aa  1191    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  95.22 
 
 
586 aa  1118    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  95.22 
 
 
586 aa  1118    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  85.45 
 
 
586 aa  1043    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  82.96 
 
 
587 aa  1001    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  95.56 
 
 
586 aa  1120    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  55.06 
 
 
594 aa  622  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  53.75 
 
 
582 aa  616  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  52.54 
 
 
612 aa  597  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  52.21 
 
 
585 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  48.78 
 
 
569 aa  551  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  49.22 
 
 
578 aa  544  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  48.4 
 
 
577 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  44.4 
 
 
558 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  43.04 
 
 
553 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  42.12 
 
 
558 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  41.61 
 
 
567 aa  435  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.02 
 
 
568 aa  433  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.87 
 
 
568 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  40.79 
 
 
871 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.15 
 
 
568 aa  428  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  41.49 
 
 
568 aa  425  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  40.32 
 
 
553 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  42.05 
 
 
573 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.89 
 
 
571 aa  425  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.19 
 
 
568 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  41.59 
 
 
568 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  39.58 
 
 
564 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  41.26 
 
 
571 aa  420  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  41.22 
 
 
559 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  39.15 
 
 
562 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  39.79 
 
 
563 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.85 
 
 
563 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  40.57 
 
 
566 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.78 
 
 
568 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  42.58 
 
 
568 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.88 
 
 
568 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  39.86 
 
 
591 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  40.93 
 
 
553 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.78 
 
 
568 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  38.92 
 
 
577 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  39.43 
 
 
557 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  38.58 
 
 
570 aa  411  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  38.53 
 
 
570 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  40.46 
 
 
571 aa  408  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  39.24 
 
 
577 aa  409  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  42.1 
 
 
578 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  41.04 
 
 
572 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  41.29 
 
 
561 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  39.79 
 
 
555 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  38.3 
 
 
568 aa  400  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  39.11 
 
 
571 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  38.93 
 
 
557 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  40.88 
 
 
599 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  39.96 
 
 
554 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  39.41 
 
 
568 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  40.71 
 
 
599 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  40.53 
 
 
599 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.43 
 
 
568 aa  393  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  38.5 
 
 
787 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  41.95 
 
 
603 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  39.58 
 
 
573 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1387  type II secretion system protein E  40.46 
 
 
577 aa  389  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00517077  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  41.03 
 
 
578 aa  392  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  38.49 
 
 
885 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  38.86 
 
 
556 aa  392  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  42.23 
 
 
575 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  39.22 
 
 
553 aa  386  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  38.45 
 
 
558 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  40.39 
 
 
564 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  42.83 
 
 
550 aa  382  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  38.52 
 
 
565 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  37.17 
 
 
583 aa  380  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  41.14 
 
 
521 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  38.5 
 
 
610 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  40.54 
 
 
546 aa  379  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  40.19 
 
 
520 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  38.1 
 
 
561 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  41.04 
 
 
520 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  37.14 
 
 
583 aa  374  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  38.48 
 
 
569 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2090  type II secretion system protein E  38.26 
 
 
573 aa  373  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>