More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4160 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  79.27 
 
 
578 aa  876    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  100 
 
 
578 aa  1159    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  75.53 
 
 
575 aa  846    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  54.1 
 
 
580 aa  570  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  52.94 
 
 
585 aa  556  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  53.06 
 
 
566 aa  503  1e-141  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  51.81 
 
 
575 aa  504  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  53.06 
 
 
566 aa  503  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  50.27 
 
 
567 aa  501  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  52.61 
 
 
573 aa  498  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  46.31 
 
 
558 aa  496  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  46.56 
 
 
559 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  48.04 
 
 
553 aa  480  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  49.57 
 
 
563 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  53.93 
 
 
585 aa  475  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  53.72 
 
 
585 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  45.25 
 
 
599 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  46.59 
 
 
553 aa  462  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  45.07 
 
 
599 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  44.44 
 
 
603 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  45.07 
 
 
599 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  43.66 
 
 
555 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  44.01 
 
 
885 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  43.36 
 
 
871 aa  461  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  46.42 
 
 
566 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  44.5 
 
 
553 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  44.26 
 
 
553 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  43.21 
 
 
577 aa  453  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  42.93 
 
 
571 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  47.41 
 
 
575 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  43.32 
 
 
556 aa  448  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  44 
 
 
573 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  44.19 
 
 
568 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  42.01 
 
 
564 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  42.68 
 
 
561 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  43.6 
 
 
557 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  42.43 
 
 
888 aa  445  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  41.92 
 
 
570 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.21 
 
 
568 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.21 
 
 
568 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  39.69 
 
 
787 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.09 
 
 
568 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  41.84 
 
 
568 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  42.52 
 
 
558 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  43.06 
 
 
570 aa  437  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  43.83 
 
 
564 aa  438  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  41.91 
 
 
571 aa  438  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  41.31 
 
 
568 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.61 
 
 
568 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.79 
 
 
568 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  50 
 
 
514 aa  438  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.19 
 
 
571 aa  438  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  42.93 
 
 
561 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  40.88 
 
 
566 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  40.11 
 
 
558 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  47.22 
 
 
521 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  43.48 
 
 
561 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  39.22 
 
 
562 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  43.14 
 
 
554 aa  433  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  46.6 
 
 
520 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  56.68 
 
 
469 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  45.42 
 
 
570 aa  429  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.63 
 
 
568 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  45.18 
 
 
572 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  41.44 
 
 
557 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  56.68 
 
 
469 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.46 
 
 
568 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  43.57 
 
 
610 aa  428  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2210  general secretory pathway protein E  55.67 
 
 
477 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.93 
 
 
568 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  38.6 
 
 
563 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  45.95 
 
 
569 aa  428  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.22 
 
 
563 aa  428  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  45.99 
 
 
503 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  53.92 
 
 
518 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  55.39 
 
 
468 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  41.68 
 
 
576 aa  423  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  43.9 
 
 
559 aa  422  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  42.38 
 
 
577 aa  424  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  41.11 
 
 
565 aa  423  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  46.61 
 
 
498 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  48.77 
 
 
501 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  53.21 
 
 
514 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  50.85 
 
 
499 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  44.64 
 
 
520 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  44.84 
 
 
498 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  48.77 
 
 
500 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  53.73 
 
 
520 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  42.11 
 
 
569 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  42.73 
 
 
577 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  42.88 
 
 
586 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  41.83 
 
 
891 aa  415  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  45.87 
 
 
520 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  53.28 
 
 
509 aa  415  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  40.04 
 
 
568 aa  415  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  52.19 
 
 
523 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  53.9 
 
 
471 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  44.87 
 
 
550 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  54.29 
 
 
477 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  42.6 
 
 
563 aa  415  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>