More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3151 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  99.32 
 
 		 585 aa  1162    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  100 
 
 		 585 aa  1169    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  69.93 
 
 		 563 aa  748    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  62.01 
 
 		 575 aa  640    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  63.04 
 
 		 573 aa  648    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  61.23 
 
 		 566 aa  629  1e-179  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  61.23 
 
 		 566 aa  629  1e-179  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  58.44 
 
 		 585 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  57.71 
 
 		 580 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  51.17 
 
 		 578 aa  505  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  50.91 
 
 		 575 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  50.09 
 
 		 559 aa  490  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  49.48 
 
 		 578 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  50.38 
 
 		 567 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.13 
 
 		 571 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  43.47 
 
 		 558 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.78 
 
 		 568 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  49.59 
 
 		 521 aa  435  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  46.04 
 
 		 566 aa  435  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  44.6 
 
 		 599 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.93 
 
 		 563 aa  430  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  48.55 
 
 		 520 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  41.83 
 
 		 568 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  44.42 
 
 		 599 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  54.06 
 
 		 514 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  44.58 
 
 		 599 aa  429  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.17 
 
 		 568 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  41.95 
 
 		 568 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.71 
 
 		 568 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  48.55 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.17 
 
 		 568 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.96 
 
 		 568 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  45.05 
 
 		 553 aa  422  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  41.76 
 
 		 565 aa  418  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  41.27 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.88 
 
 		 568 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  43.04 
 
 		 570 aa  416  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.88 
 
 		 568 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  39.9 
 
 		 571 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  45.75 
 
 		 610 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  42.46 
 
 		 570 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  43.05 
 
 		 871 aa  414  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  41.02 
 
 		 568 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  40.3 
 
 		 552 aa  413  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  44.22 
 
 		 603 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  48.54 
 
 		 514 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  46.45 
 
 		 520 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  46.45 
 
 		 520 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  41.99 
 
 		 561 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  41.76 
 
 		 553 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  49.66 
 
 		 495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.24 
 
 		 568 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  49.54 
 
 		 515 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  42.13 
 
 		 557 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  39.71 
 
 		 577 aa  407  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  42.15 
 
 		 573 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  40.25 
 
 		 558 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  42.75 
 
 		 556 aa  405  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  50 
 
 		 522 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  45.96 
 
 		 498 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  45.49 
 
 		 497 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  49.54 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  49.54 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  49.54 
 
 		 497 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  49.54 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  51.92 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  45.39 
 
 		 541 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  49.54 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  47.6 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  49.54 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  49.77 
 
 		 499 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  49.54 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  45.49 
 
 		 544 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  49.77 
 
 		 499 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  49.54 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  42.49 
 
 		 558 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  49.77 
 
 		 499 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  45.49 
 
 		 497 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  43.44 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  44.88 
 
 		 497 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  45.08 
 
 		 497 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  40.92 
 
 		 561 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  40.6 
 
 		 557 aa  398  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  40.04 
 
 		 571 aa  396  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  49.54 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0893  type II secretion system protein E  47.83 
 
 		 557 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0853399  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  51.54 
 
 		 518 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  41.41 
 
 		 553 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  45.38 
 
 		 514 aa  396  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  49.54 
 
 		 499 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  43.4 
 
 		 575 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  48 
 
 		 500 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  40.97 
 
 		 555 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0910  type II secretion system protein E  47.57 
 
 		 561 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.661185 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  43.06 
 
 		 553 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  44.88 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  40.35 
 
 		 571 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  39.36 
 
 		 570 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  50.35 
 
 		 502 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  49.09 
 
 		 499 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>