More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3083 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  100 
 
 		 550 aa  1093    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  49.51 
 
 		 546 aa  501  1e-140  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  47.59 
 
 		 565 aa  481  1e-134  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  44.79 
 
 		 558 aa  455  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  47.95 
 
 		 603 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  48.49 
 
 		 599 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  44.32 
 
 		 571 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  44.96 
 
 		 552 aa  451  1e-125  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  48.11 
 
 		 599 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  48.11 
 
 		 599 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  42.67 
 
 		 570 aa  446  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  45.27 
 
 		 520 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  44.91 
 
 		 871 aa  440  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.72 
 
 		 568 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  43.37 
 
 		 577 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  45.44 
 
 		 520 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  45.44 
 
 		 520 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  45.08 
 
 		 553 aa  438  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  44.85 
 
 		 573 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  42.77 
 
 		 568 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  44.19 
 
 		 558 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  42.99 
 
 		 568 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  45.77 
 
 		 520 aa  435  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.62 
 
 		 568 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  48.49 
 
 		 563 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  43.21 
 
 		 570 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  43.38 
 
 		 570 aa  430  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  43.87 
 
 		 553 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  45.06 
 
 		 553 aa  428  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  43.12 
 
 		 555 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  46.08 
 
 		 553 aa  428  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.2 
 
 		 568 aa  428  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.81 
 
 		 568 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  43.54 
 
 		 556 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.73 
 
 		 568 aa  425  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  42.48 
 
 		 610 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  44.19 
 
 		 521 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  45.07 
 
 		 557 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  46.47 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  43.12 
 
 		 585 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  42 
 
 		 564 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  48.87 
 
 		 477 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  42.45 
 
 		 787 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  45.09 
 
 		 575 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  42.58 
 
 		 573 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  46.04 
 
 		 563 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  53.33 
 
 		 487 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42 
 
 		 563 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  43.07 
 
 		 557 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  44.11 
 
 		 564 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  48.54 
 
 		 567 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  46.53 
 
 		 566 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  43.52 
 
 		 559 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  46.53 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  51.91 
 
 		 503 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3085  type II secretion system protein E  46.44 
 
 		 560 aa  412  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  47.13 
 
 		 502 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  41.35 
 
 		 566 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  44.82 
 
 		 503 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  44.23 
 
 		 559 aa  413  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  46.05 
 
 		 554 aa  415  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  47.13 
 
 		 502 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  40.5 
 
 		 567 aa  415  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  43.08 
 
 		 577 aa  410  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  41.84 
 
 		 571 aa  409  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  46.15 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  47.31 
 
 		 518 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  43.36 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  51.15 
 
 		 580 aa  411  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  41.35 
 
 		 568 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  55.36 
 
 		 469 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  43.09 
 
 		 591 aa  412  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  46.23 
 
 		 575 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  55.36 
 
 		 469 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  46.17 
 
 		 489 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  45.76 
 
 		 515 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.35 
 
 		 568 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  45.07 
 
 		 578 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.35 
 
 		 568 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  45.47 
 
 		 522 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  43.96 
 
 		 514 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  42.83 
 
 		 568 aa  405  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  43.71 
 
 		 566 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.84 
 
 		 568 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  43.26 
 
 		 577 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  43.34 
 
 		 561 aa  405  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  45.98 
 
 		 497 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  45.98 
 
 		 497 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  43.23 
 
 		 586 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  45.98 
 
 		 497 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  45.98 
 
 		 497 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  45.98 
 
 		 497 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  45.98 
 
 		 497 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  45.98 
 
 		 497 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  45.98 
 
 		 497 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  45.26 
 
 		 495 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  44.66 
 
 		 520 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  41.39 
 
 		 823 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  37.94 
 
 		 561 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.63 
 
 		 571 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>