More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1387 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1387  type II secretion system protein E  100 
 
 
577 aa  1162    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00517077  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  56.77 
 
 
583 aa  638    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  57.63 
 
 
583 aa  614  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  57.36 
 
 
585 aa  608  1e-173  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  57.34 
 
 
583 aa  600  1e-170  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1010  type II secretion system protein E  50.26 
 
 
598 aa  581  1e-164  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  43.11 
 
 
871 aa  415  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  39.23 
 
 
553 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  41.18 
 
 
556 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  43.66 
 
 
558 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  39.86 
 
 
553 aa  402  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  39.5 
 
 
787 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  41.28 
 
 
570 aa  398  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  41.31 
 
 
589 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  38.93 
 
 
557 aa  393  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  39.58 
 
 
587 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  39.96 
 
 
577 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  41.7 
 
 
582 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  39.53 
 
 
586 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  39.96 
 
 
564 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  41.73 
 
 
520 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  40.67 
 
 
586 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  40.48 
 
 
586 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  43.78 
 
 
482 aa  388  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  40.43 
 
 
586 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  40.48 
 
 
586 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  41.18 
 
 
520 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  37.78 
 
 
564 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  40.74 
 
 
586 aa  388  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  39.27 
 
 
584 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  38.79 
 
 
570 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  39.23 
 
 
585 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  41.23 
 
 
520 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  38.64 
 
 
558 aa  385  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  40.66 
 
 
521 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  41.23 
 
 
520 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  42.3 
 
 
546 aa  379  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  40.38 
 
 
573 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  40.76 
 
 
586 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  40.35 
 
 
557 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  40.83 
 
 
575 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  38.43 
 
 
570 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  38.38 
 
 
563 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  43.46 
 
 
514 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  40.04 
 
 
558 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  38.21 
 
 
552 aa  377  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.4 
 
 
568 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  39.65 
 
 
580 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  39.78 
 
 
599 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  41.12 
 
 
561 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3344  type II secretion system protein E  40.8 
 
 
586 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0160309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  36.46 
 
 
559 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  37.19 
 
 
572 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  40.12 
 
 
557 aa  379  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  40.44 
 
 
586 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  40.44 
 
 
586 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0563  type II secretion system protein E  40.24 
 
 
586 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  40.16 
 
 
555 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  40.24 
 
 
586 aa  379  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  39.02 
 
 
561 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  37.99 
 
 
576 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  40.04 
 
 
594 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  38 
 
 
577 aa  374  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  47.15 
 
 
520 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  40.04 
 
 
562 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  38.41 
 
 
559 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  48.25 
 
 
499 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1464  general secretory pathway protein E  41.42 
 
 
519 aa  369  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  39.22 
 
 
599 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  39.22 
 
 
599 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  40.96 
 
 
570 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  43.16 
 
 
500 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  38.32 
 
 
637 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1818  general secretory pathway protein E  40.69 
 
 
519 aa  369  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  37.62 
 
 
565 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  44.16 
 
 
501 aa  369  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  38.86 
 
 
568 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1644  general secretory pathway protein E  41.42 
 
 
519 aa  368  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.161212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  39.05 
 
 
561 aa  368  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  39.22 
 
 
577 aa  369  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  41.13 
 
 
498 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.22 
 
 
563 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  39.02 
 
 
571 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  40.18 
 
 
563 aa  369  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  41.71 
 
 
570 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  40.08 
 
 
553 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.68 
 
 
571 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  38.86 
 
 
603 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  46.35 
 
 
569 aa  365  1e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  39.15 
 
 
574 aa  365  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  47.37 
 
 
498 aa  364  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  39.03 
 
 
561 aa  365  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  36.36 
 
 
567 aa  364  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  44.58 
 
 
487 aa  363  4e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  42.47 
 
 
503 aa  363  4e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  38.98 
 
 
575 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  39.04 
 
 
573 aa  363  4e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  39.25 
 
 
595 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  39.05 
 
 
595 aa  363  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  47.01 
 
 
471 aa  363  6e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>