More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00443 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00443  type II secretion system protein E:GAF domain  100 
 
 		 738 aa  1517    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0467  putative GAF sensor protein  69.66 
 
 		 736 aa  1090    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116791  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0421  putative phytochrome sensor protein  41.6 
 
 		 770 aa  593  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1244  putative phytochrome sensor protein  42.86 
 
 		 772 aa  554  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000557718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0279  putative phytochrome sensor protein  41.85 
 
 		 767 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0295  putative phytochrome sensor protein  41.58 
 
 		 767 aa  528  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.42905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1971  putative phytochrome sensor protein  41.76 
 
 		 771 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000984823  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3938  putative GAF sensor protein  38.67 
 
 		 806 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0411  type II secretion system protein E  46.59 
 
 		 702 aa  465  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319721  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0923  putative phytochrome sensor protein  38.11 
 
 		 794 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1659  type II secretion system protein E  44.85 
 
 		 785 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.903835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0861  type II secretion system protein E  42.96 
 
 		 642 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2609  type IV pilus assembly protein, putative  41.71 
 
 		 645 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  39.24 
 
 		 644 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1966  type II secretion system protein E  48.43 
 
 		 642 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56575  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3152  type II secretion system protein E  48.68 
 
 		 677 aa  392  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3153  type II secretion system protein E  46.68 
 
 		 684 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  46.26 
 
 		 841 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  39.82 
 
 		 563 aa  383  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  45.52 
 
 		 871 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  39.46 
 
 		 580 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  47.12 
 
 		 569 aa  366  1e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  41.44 
 
 		 558 aa  362  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  41.88 
 
 		 553 aa  361  3e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  43.84 
 
 		 553 aa  360  6e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  38.75 
 
 		 599 aa  360  7e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  38.66 
 
 		 599 aa  358  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  38.75 
 
 		 599 aa  358  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  41.09 
 
 		 565 aa  355  1e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  38.55 
 
 		 603 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3009  type II secretion system protein E  38.43 
 
 		 561 aa  353  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  39.61 
 
 		 520 aa  351  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  43.58 
 
 		 574 aa  351  3e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  45.75 
 
 		 518 aa  351  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  38.3 
 
 		 577 aa  351  3e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  45.5 
 
 		 518 aa  350  7e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  44.35 
 
 		 888 aa  350  7e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  43.07 
 
 		 559 aa  350  7e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  37.37 
 
 		 561 aa  349  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  44.36 
 
 		 563 aa  349  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  41.14 
 
 		 471 aa  348  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  42.74 
 
 		 885 aa  348  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  40.62 
 
 		 585 aa  348  3e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  43.16 
 
 		 574 aa  347  4e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  36.76 
 
 		 578 aa  347  4e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  39.63 
 
 		 556 aa  346  8.999999999999999e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  34.94 
 
 		 727 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  38.87 
 
 		 520 aa  344  2.9999999999999997e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  38.97 
 
 		 500 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  39.07 
 
 		 557 aa  343  8e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3833  type II secretion system protein E  36.11 
 
 		 568 aa  342  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522953 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  45.25 
 
 		 533 aa  342  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  45.23 
 
 		 491 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  40.04 
 
 		 520 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  39.66 
 
 		 589 aa  342  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.21 
 
 		 577 aa  342  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  45.43 
 
 		 520 aa  342  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  39.84 
 
 		 487 aa  342  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  44.97 
 
 		 514 aa  342  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  42.79 
 
 		 499 aa  341  2.9999999999999998e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  39.22 
 
 		 571 aa  341  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  42.82 
 
 		 566 aa  341  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.98 
 
 		 549 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  44.22 
 
 		 513 aa  341  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  36.95 
 
 		 591 aa  340  5.9999999999999996e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  45.41 
 
 		 566 aa  339  9e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  36.59 
 
 		 555 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.07 
 
 		 577 aa  339  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  37.98 
 
 		 610 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  43.61 
 
 		 469 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  44.39 
 
 		 469 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.35 
 
 		 562 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  45.12 
 
 		 585 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  36.52 
 
 		 553 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  43.97 
 
 		 502 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  40.77 
 
 		 515 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  44.16 
 
 		 553 aa  337  5.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  37.96 
 
 		 501 aa  337  7e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  41.57 
 
 		 503 aa  337  7e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  38.3 
 
 		 559 aa  336  9e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  40.33 
 
 		 497 aa  336  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  40.33 
 
 		 497 aa  336  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  40.33 
 
 		 497 aa  336  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  40.33 
 
 		 497 aa  336  9e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  40.33 
 
 		 497 aa  336  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  40.33 
 
 		 497 aa  336  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  40.33 
 
 		 497 aa  336  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  37.28 
 
 		 558 aa  336  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  45.16 
 
 		 585 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0841  type II secretion system protein E  37.75 
 
 		 578 aa  336  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0657263  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  43.97 
 
 		 502 aa  336  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  39.87 
 
 		 557 aa  335  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  35.99 
 
 		 561 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  40.17 
 
 		 561 aa  335  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  44.55 
 
 		 499 aa  334  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  40.12 
 
 		 497 aa  334  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2107  type II secretion system protein E  37.43 
 
 		 606 aa  334  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  38.61 
 
 		 514 aa  333  9e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  40.31 
 
 		 670 aa  332  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.07 
 
 		 568 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>