More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3009 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3009  type II secretion system protein E  100 
 
 		 561 aa  1127    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2611  putative general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  69.35 
 
 		 517 aa  715    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2107  type II secretion system protein E  68.34 
 
 		 606 aa  733    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0741  type II secretion system protein E  64.3 
 
 		 569 aa  714    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0910  type II secretion system protein E  63.81 
 
 		 561 aa  719    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.661185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1278  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  65.77 
 
 		 549 aa  679    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  53 
 
 		 538 aa  514  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  49.06 
 
 		 544 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  48.49 
 
 		 541 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  46.53 
 
 		 585 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  45.18 
 
 		 580 aa  422  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  46.48 
 
 		 559 aa  405  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  45.4 
 
 		 567 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  46.68 
 
 		 575 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  42.01 
 
 		 575 aa  388  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  45.71 
 
 		 566 aa  388  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  44.01 
 
 		 603 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  45.71 
 
 		 566 aa  388  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  43.53 
 
 		 520 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  41.37 
 
 		 578 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  43.28 
 
 		 514 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  43.76 
 
 		 520 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  41.95 
 
 		 599 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  39.86 
 
 		 871 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  42.69 
 
 		 599 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  38.41 
 
 		 558 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  41.97 
 
 		 514 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  44.47 
 
 		 566 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  42.12 
 
 		 563 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  42.69 
 
 		 599 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  41.8 
 
 		 520 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  45.96 
 
 		 573 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  41.8 
 
 		 520 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  40.89 
 
 		 521 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  41.12 
 
 		 568 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  41.16 
 
 		 577 aa  371  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  44.42 
 
 		 585 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  44.42 
 
 		 585 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  38.3 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  43.1 
 
 		 553 aa  369  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  43.44 
 
 		 515 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  42.44 
 
 		 561 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  42.62 
 
 		 570 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  39.17 
 
 		 563 aa  365  2e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  38.02 
 
 		 571 aa  363  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  47.74 
 
 		 513 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  46.91 
 
 		 569 aa  363  3e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.91 
 
 		 571 aa  363  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  39.45 
 
 		 520 aa  363  4e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  41.63 
 
 		 787 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  38.92 
 
 		 553 aa  363  6e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  44.09 
 
 		 495 aa  362  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  43.87 
 
 		 497 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  43.87 
 
 		 497 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  43.62 
 
 		 494 aa  361  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  43.87 
 
 		 497 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  43.87 
 
 		 497 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  43.87 
 
 		 497 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  43.87 
 
 		 497 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  44.09 
 
 		 499 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  43.87 
 
 		 497 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  43.87 
 
 		 499 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  44.09 
 
 		 499 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  39.62 
 
 		 555 aa  360  4e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1621  type II secretion system protein E  47.72 
 
 		 586 aa  360  4e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  37.35 
 
 		 576 aa  360  5e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  44.5 
 
 		 493 aa  359  6e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  44.5 
 
 		 493 aa  359  6e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  44.5 
 
 		 493 aa  359  6e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  40.66 
 
 		 888 aa  359  9e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  43.62 
 
 		 494 aa  359  9e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  38.32 
 
 		 557 aa  358  9.999999999999999e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  44.09 
 
 		 522 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  43.87 
 
 		 498 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  38.52 
 
 		 558 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  44.27 
 
 		 493 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  40.21 
 
 		 553 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  42.64 
 
 		 586 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  40.12 
 
 		 556 aa  358  1.9999999999999998e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  43.66 
 
 		 497 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  44.27 
 
 		 493 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.23 
 
 		 571 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  43.87 
 
 		 499 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  38.29 
 
 		 564 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  48.48 
 
 		 468 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  42.39 
 
 		 546 aa  357  3.9999999999999996e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  41.19 
 
 		 561 aa  357  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  38.75 
 
 		 514 aa  356  5e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  43.87 
 
 		 499 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  43.87 
 
 		 499 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  40.78 
 
 		 482 aa  355  1e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3232  type II secretion system protein E  49.23 
 
 		 545 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.17007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4179  type II secretion system protein E  46.58 
 
 		 482 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.262241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  47.38 
 
 		 575 aa  355  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.67 
 
 		 568 aa  353  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  39.85 
 
 		 559 aa  353  4e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  44.76 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  43.06 
 
 		 499 aa  353  5e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  42.8 
 
 		 569 aa  353  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  43.36 
 
 		 578 aa  353  5e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>