More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2107 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2611  putative general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  67.89 
 
 		 517 aa  683    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0910  type II secretion system protein E  68.29 
 
 		 561 aa  719    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.661185 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3009  type II secretion system protein E  69.13 
 
 		 561 aa  731    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2107  type II secretion system protein E  100 
 
 		 606 aa  1190    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0741  type II secretion system protein E  65.38 
 
 		 569 aa  709    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1278  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  66.48 
 
 		 549 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  50.09 
 
 		 538 aa  495  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  51.43 
 
 		 544 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  50.67 
 
 		 541 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  44.56 
 
 		 585 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  46.48 
 
 		 580 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  49.03 
 
 		 559 aa  418  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  46.67 
 
 		 567 aa  401  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  43.69 
 
 		 514 aa  396  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  44.2 
 
 		 520 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  44.96 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  44.55 
 
 		 575 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  44.4 
 
 		 520 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  44.96 
 
 		 566 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  45.83 
 
 		 575 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  43.44 
 
 		 578 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  39.62 
 
 		 558 aa  386  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  42.69 
 
 		 566 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  44.47 
 
 		 514 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  43.18 
 
 		 520 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  44.08 
 
 		 520 aa  385  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  43.58 
 
 		 570 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  44.36 
 
 		 573 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  45.98 
 
 		 585 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  45.77 
 
 		 585 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  43.36 
 
 		 521 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  40.85 
 
 		 577 aa  380  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  44.16 
 
 		 603 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  41.25 
 
 		 563 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  41.33 
 
 		 568 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  43.57 
 
 		 553 aa  379  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  50.12 
 
 		 513 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  41.51 
 
 		 568 aa  375  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  50.25 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  50.25 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  51.01 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  50.25 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  50.25 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  50.76 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  50.25 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  50.25 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  50.25 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  42.37 
 
 		 599 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  39.67 
 
 		 599 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  50.76 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  42.91 
 
 		 561 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  50.76 
 
 		 498 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  43.52 
 
 		 561 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  50.25 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  51.01 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  50.76 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  50.76 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  50.61 
 
 		 518 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  38.78 
 
 		 546 aa  371  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  50.61 
 
 		 518 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  50 
 
 		 495 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  49.75 
 
 		 522 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  42.66 
 
 		 599 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.54 
 
 		 571 aa  371  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  43.93 
 
 		 572 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  44.39 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  49.26 
 
 		 515 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  40.66 
 
 		 563 aa  367  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  51.09 
 
 		 533 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.66 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  42.8 
 
 		 561 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  43.98 
 
 		 500 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.84 
 
 		 571 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  49.75 
 
 		 491 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  47.36 
 
 		 498 aa  364  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  43.76 
 
 		 514 aa  364  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  42.82 
 
 		 499 aa  364  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.78 
 
 		 568 aa  364  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  46.84 
 
 		 518 aa  364  3e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  41.13 
 
 		 557 aa  364  3e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  43.98 
 
 		 501 aa  363  4e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  42.19 
 
 		 561 aa  363  4e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  40.12 
 
 		 558 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  48.23 
 
 		 471 aa  363  6e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  41.47 
 
 		 562 aa  363  6e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  47.16 
 
 		 493 aa  362  9e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  47.16 
 
 		 493 aa  362  9e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  47.16 
 
 		 493 aa  362  9e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  41.16 
 
 		 577 aa  362  9e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  40.04 
 
 		 576 aa  362  1e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  45.5 
 
 		 482 aa  362  1e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  39.72 
 
 		 571 aa  362  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.86 
 
 		 569 aa  362  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  40.11 
 
 		 569 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  46.91 
 
 		 493 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  46.91 
 
 		 493 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  43.46 
 
 		 578 aa  360  5e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  49.37 
 
 		 468 aa  360  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  41.38 
 
 		 568 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  47.14 
 
 		 498 aa  359  8e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>