More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0923 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1244  putative phytochrome sensor protein  45.17 
 
 		 772 aa  660    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000557718  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3938  putative GAF sensor protein  55.47 
 
 		 806 aa  866    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0923  putative phytochrome sensor protein  100 
 
 		 794 aa  1623    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0295  putative phytochrome sensor protein  44.1 
 
 		 767 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.42905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0279  putative phytochrome sensor protein  43.58 
 
 		 767 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1971  putative phytochrome sensor protein  41.87 
 
 		 771 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000984823  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  47.97 
 
 		 841 aa  497  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1966  type II secretion system protein E  58.1 
 
 		 642 aa  490  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56575  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0411  type II secretion system protein E  44.22 
 
 		 702 aa  479  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319721  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0421  putative phytochrome sensor protein  38.22 
 
 		 770 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2609  type IV pilus assembly protein, putative  43.74 
 
 		 645 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  43.49 
 
 		 644 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0861  type II secretion system protein E  53.35 
 
 		 642 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1659  type II secretion system protein E  43.2 
 
 		 785 aa  445  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.903835 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0467  putative GAF sensor protein  37.2 
 
 		 736 aa  446  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116791  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00443  type II secretion system protein E:GAF domain  38.11 
 
 		 738 aa  427  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3153  type II secretion system protein E  50.12 
 
 		 684 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3152  type II secretion system protein E  50.36 
 
 		 677 aa  399  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  38.35 
 
 		 885 aa  368  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  38.37 
 
 		 888 aa  355  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  36.36 
 
 		 871 aa  353  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1620  type II secretion system protein E  39.17 
 
 		 616 aa  348  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  37.44 
 
 		 891 aa  339  9.999999999999999e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.55 
 
 		 569 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.2 
 
 		 569 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  36.04 
 
 		 578 aa  335  1e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.72 
 
 		 569 aa  335  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.48 
 
 		 562 aa  334  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  36.15 
 
 		 568 aa  334  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.15 
 
 		 568 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  37.8 
 
 		 553 aa  332  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3833  type II secretion system protein E  37.81 
 
 		 568 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522953 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.32 
 
 		 570 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.15 
 
 		 568 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.85 
 
 		 569 aa  332  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.57 
 
 		 569 aa  331  4e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.99 
 
 		 569 aa  331  4e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.32 
 
 		 570 aa  330  6e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.08 
 
 		 568 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  36.11 
 
 		 563 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.97 
 
 		 570 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.97 
 
 		 570 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.71 
 
 		 568 aa  328  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  36.16 
 
 		 561 aa  328  3e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  44.17 
 
 		 727 aa  326  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.06 
 
 		 578 aa  325  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  35.35 
 
 		 568 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0841  type II secretion system protein E  42.89 
 
 		 578 aa  325  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0657263  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.33 
 
 		 569 aa  325  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  38.47 
 
 		 559 aa  324  4e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.42 
 
 		 568 aa  323  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3680  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.03 
 
 		 578 aa  323  6e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1579  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.62 
 
 		 565 aa  323  6e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58750  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  41.1 
 
 		 567 aa  323  8e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.497058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0766  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.65 
 
 		 578 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.59759  normal  0.16115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.02 
 
 		 574 aa  323  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0509  pilus biogenesis ATPase  40.76 
 
 		 572 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0385141 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  36.79 
 
 		 574 aa  322  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  34.85 
 
 		 568 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.33 
 
 		 568 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  41.81 
 
 		 560 aa  321  3e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  36.01 
 
 		 563 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.27 
 
 		 569 aa  320  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  42.82 
 
 		 574 aa  320  7e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0064  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilB  34.98 
 
 		 591 aa  320  7e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.978792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.16 
 
 		 568 aa  319  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0069  type II secretion system protein E  34.58 
 
 		 570 aa  318  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.73093  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.9 
 
 		 555 aa  319  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.762326  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5488  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.08 
 
 		 580 aa  318  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.388204  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  34.09 
 
 		 558 aa  318  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  34.6 
 
 		 558 aa  318  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.14 
 
 		 563 aa  318  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1636  type II secretion system protein E  38.46 
 
 		 673 aa  318  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  34.92 
 
 		 571 aa  317  4e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  35.99 
 
 		 571 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0805  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.91 
 
 		 577 aa  317  6e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1124  general secretion pathway protein E  39.16 
 
 		 1017 aa  317  7e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.553401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0768  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.91 
 
 		 577 aa  317  7e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  35.7 
 
 		 556 aa  317  8e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1610  type II secretion system protein E  38.27 
 
 		 673 aa  316  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  34.94 
 
 		 553 aa  316  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2902  type II secretion system protein E  42.68 
 
 		 577 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.91 
 
 		 568 aa  316  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  36.73 
 
 		 569 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.73 
 
 		 569 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.51 
 
 		 549 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  37.2 
 
 		 577 aa  315  2.9999999999999996e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  41.15 
 
 		 557 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.28 
 
 		 572 aa  314  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.38 
 
 		 568 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0926  type IV pilus biogenesis protein PilB  35.87 
 
 		 564 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3585  type II secretion system protein E  36.19 
 
 		 832 aa  313  7.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  35.68 
 
 		 567 aa  313  9e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  36.29 
 
 		 557 aa  312  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3389  type II secretion system protein E  43.24 
 
 		 569 aa  312  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.74 
 
 		 571 aa  312  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  35.59 
 
 		 568 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.39 
 
 		 568 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  35.16 
 
 		 566 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5162  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  43 
 
 		 561 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>