More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0421 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0421  putative phytochrome sensor protein  100 
 
 		 770 aa  1581    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0467  putative GAF sensor protein  42.21 
 
 		 736 aa  609  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116791  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00443  type II secretion system protein E:GAF domain  41.46 
 
 		 738 aa  575  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1244  putative phytochrome sensor protein  39.23 
 
 		 772 aa  525  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000557718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0295  putative phytochrome sensor protein  38.4 
 
 		 767 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.42905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1971  putative phytochrome sensor protein  38.55 
 
 		 771 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000984823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0279  putative phytochrome sensor protein  37.67 
 
 		 767 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3938  putative GAF sensor protein  37.39 
 
 		 806 aa  479  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0923  putative phytochrome sensor protein  38.35 
 
 		 794 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1659  type II secretion system protein E  42.17 
 
 		 785 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.903835 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0411  type II secretion system protein E  40.23 
 
 		 702 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0861  type II secretion system protein E  41.07 
 
 		 642 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2609  type IV pilus assembly protein, putative  40.43 
 
 		 645 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  40.43 
 
 		 644 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  36.48 
 
 		 871 aa  375  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1966  type II secretion system protein E  38.17 
 
 		 642 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56575  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  38.52 
 
 		 841 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  36.23 
 
 		 553 aa  361  3e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  46.58 
 
 		 560 aa  357  3.9999999999999996e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  45.68 
 
 		 577 aa  357  5e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  46.55 
 
 		 559 aa  355  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3153  type II secretion system protein E  45.03 
 
 		 684 aa  353  7e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  35.79 
 
 		 885 aa  352  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3152  type II secretion system protein E  43.01 
 
 		 677 aa  352  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  36.06 
 
 		 580 aa  351  4e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  38.12 
 
 		 585 aa  349  9e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  38.05 
 
 		 520 aa  348  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  44.55 
 
 		 552 aa  347  6e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  38.7 
 
 		 514 aa  345  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  46.55 
 
 		 578 aa  345  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  36.23 
 
 		 563 aa  345  1e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  47.57 
 
 		 563 aa  346  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  38.39 
 
 		 521 aa  343  7e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1278  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  45.63 
 
 		 549 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  36.01 
 
 		 599 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  37.27 
 
 		 578 aa  342  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  35.08 
 
 		 565 aa  342  1e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  36.86 
 
 		 553 aa  342  1e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  46.84 
 
 		 888 aa  342  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  36.4 
 
 		 599 aa  342  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  36.73 
 
 		 578 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3833  type II secretion system protein E  36.73 
 
 		 568 aa  341  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522953 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  45.52 
 
 		 520 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  36.4 
 
 		 599 aa  341  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  43.42 
 
 		 514 aa  340  5e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  45.52 
 
 		 520 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  35.06 
 
 		 891 aa  340  5.9999999999999996e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  43.3 
 
 		 575 aa  340  7e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  34.21 
 
 		 561 aa  339  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  35.07 
 
 		 787 aa  339  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  35.31 
 
 		 603 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2611  putative general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  45.52 
 
 		 517 aa  337  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  41.94 
 
 		 520 aa  337  7e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  45.96 
 
 		 575 aa  336  7.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  37.81 
 
 		 520 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  37.45 
 
 		 570 aa  336  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  44.22 
 
 		 524 aa  336  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  34.41 
 
 		 558 aa  334  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  43.09 
 
 		 533 aa  334  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  34.33 
 
 		 561 aa  334  4e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  35.91 
 
 		 557 aa  334  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  44.36 
 
 		 514 aa  334  4e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  44.06 
 
 		 569 aa  333  6e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  44.67 
 
 		 604 aa  332  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  41.85 
 
 		 491 aa  332  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  43.17 
 
 		 487 aa  333  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  43.61 
 
 		 523 aa  332  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  40.23 
 
 		 493 aa  331  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  40.23 
 
 		 493 aa  331  3e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  40.23 
 
 		 493 aa  331  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  45.53 
 
 		 511 aa  331  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  43.18 
 
 		 727 aa  330  5.0000000000000004e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  40.82 
 
 		 482 aa  330  5.0000000000000004e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  40.23 
 
 		 493 aa  330  6e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  40.23 
 
 		 493 aa  330  6e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2107  type II secretion system protein E  44.99 
 
 		 606 aa  330  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  34.8 
 
 		 558 aa  330  8e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  43.97 
 
 		 523 aa  330  8e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0232  general secretory pathway protein E  43.99 
 
 		 525 aa  330  8e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  41.56 
 
 		 518 aa  329  9e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  41.38 
 
 		 518 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.7 
 
 		 568 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0741  type II secretion system protein E  36.54 
 
 		 569 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  44.1 
 
 		 573 aa  329  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.87 
 
 		 568 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  35.6 
 
 		 823 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  42.72 
 
 		 556 aa  328  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  43.88 
 
 		 566 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  43.91 
 
 		 520 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  33.39 
 
 		 553 aa  328  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  40.84 
 
 		 515 aa  328  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0910  type II secretion system protein E  45.43 
 
 		 561 aa  328  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.661185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  40.86 
 
 		 513 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  42.23 
 
 		 571 aa  327  4.0000000000000003e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  33.9 
 
 		 555 aa  327  5e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3009  type II secretion system protein E  42.36 
 
 		 561 aa  327  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.6 
 
 		 568 aa  327  5e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  42.73 
 
 		 471 aa  327  5e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  43.86 
 
 		 523 aa  327  6e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  35.7 
 
 		 571 aa  326  8.000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>