More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0910 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0910  type II secretion system protein E  100 
 
 		 561 aa  1112    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.661185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1278  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  64.55 
 
 		 549 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3009  type II secretion system protein E  67.3 
 
 		 561 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2107  type II secretion system protein E  68.29 
 
 		 606 aa  719    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0741  type II secretion system protein E  65.9 
 
 		 569 aa  691    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2611  putative general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  67.64 
 
 		 517 aa  693    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  55.24 
 
 		 538 aa  525  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  50.85 
 
 		 544 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  50.77 
 
 		 541 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  47.36 
 
 		 585 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  48.76 
 
 		 580 aa  433  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  46.06 
 
 		 559 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  44.98 
 
 		 567 aa  401  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  47.35 
 
 		 585 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  47.46 
 
 		 585 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  44.4 
 
 		 520 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  43.58 
 
 		 520 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  37.72 
 
 		 558 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  43.58 
 
 		 520 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  46.91 
 
 		 566 aa  391  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  46.91 
 
 		 566 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  48.88 
 
 		 514 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  44.36 
 
 		 578 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  43.55 
 
 		 603 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  46.57 
 
 		 573 aa  382  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  46.79 
 
 		 575 aa  385  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  44.35 
 
 		 599 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  44.56 
 
 		 575 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  44.35 
 
 		 599 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  43.88 
 
 		 520 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  44.56 
 
 		 599 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  49.26 
 
 		 566 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1621  type II secretion system protein E  50.76 
 
 		 586 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  42.55 
 
 		 521 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  42.34 
 
 		 570 aa  376  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  43.24 
 
 		 563 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  43.49 
 
 		 514 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  49.25 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  38.69 
 
 		 577 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  46.1 
 
 		 518 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  47.34 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  47.34 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  47.34 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  49.24 
 
 		 515 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  47.09 
 
 		 493 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  47.62 
 
 		 520 aa  365  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  48.77 
 
 		 486 aa  365  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  47.09 
 
 		 493 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  49.5 
 
 		 533 aa  364  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  50.25 
 
 		 468 aa  363  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  38.58 
 
 		 571 aa  363  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.84 
 
 		 571 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  49.49 
 
 		 522 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  49.49 
 
 		 495 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  41.13 
 
 		 568 aa  362  9e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  41.44 
 
 		 568 aa  362  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  42.77 
 
 		 561 aa  362  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  48.74 
 
 		 497 aa  361  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  49.24 
 
 		 499 aa  360  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  39.36 
 
 		 562 aa  360  4e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  49.87 
 
 		 491 aa  360  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  48.99 
 
 		 498 aa  360  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  49.24 
 
 		 499 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  49.24 
 
 		 499 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  48.99 
 
 		 499 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  49.24 
 
 		 499 aa  359  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  36.76 
 
 		 553 aa  359  7e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  48.76 
 
 		 518 aa  359  8e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.07 
 
 		 571 aa  359  8e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  48.99 
 
 		 499 aa  359  9e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  45.98 
 
 		 494 aa  358  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  39.62 
 
 		 557 aa  358  9.999999999999999e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  49.37 
 
 		 471 aa  358  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  48.76 
 
 		 518 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  48.74 
 
 		 497 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  46.79 
 
 		 546 aa  357  1.9999999999999998e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  48.74 
 
 		 497 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  48.74 
 
 		 497 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  37.59 
 
 		 871 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  48.74 
 
 		 497 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  48.74 
 
 		 497 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  44.4 
 
 		 572 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  48.74 
 
 		 497 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  48.74 
 
 		 497 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  41.63 
 
 		 553 aa  357  2.9999999999999997e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  42.71 
 
 		 553 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  36.94 
 
 		 564 aa  356  5e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  49.75 
 
 		 469 aa  356  5e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  41.13 
 
 		 561 aa  356  5e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  42.89 
 
 		 489 aa  356  6.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  38.26 
 
 		 577 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  45.73 
 
 		 494 aa  355  7.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  43.42 
 
 		 578 aa  355  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  46.4 
 
 		 514 aa  355  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  47.59 
 
 		 523 aa  355  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  48.23 
 
 		 490 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  47.1 
 
 		 524 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  47.09 
 
 		 569 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  49.75 
 
 		 469 aa  355  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  44.68 
 
 		 499 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>