More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1586 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  100 
 
 
538 aa  1077    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0910  type II secretion system protein E  55.24 
 
 
561 aa  525  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.661185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2611  putative general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  52.62 
 
 
517 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3009  type II secretion system protein E  53 
 
 
561 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2107  type II secretion system protein E  50.09 
 
 
606 aa  495  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1278  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  51.41 
 
 
549 aa  491  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0741  type II secretion system protein E  50.7 
 
 
569 aa  480  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  48.79 
 
 
544 aa  458  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  47.18 
 
 
541 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  46.53 
 
 
580 aa  425  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  43.95 
 
 
585 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  44.97 
 
 
520 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  48.68 
 
 
559 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  45.04 
 
 
520 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  44.4 
 
 
520 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  45.04 
 
 
520 aa  405  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  43.7 
 
 
553 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  40.5 
 
 
871 aa  395  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  45.28 
 
 
575 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  44.7 
 
 
514 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  44.06 
 
 
521 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  43.27 
 
 
566 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  44.14 
 
 
578 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  44.23 
 
 
567 aa  388  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  43.28 
 
 
575 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  39.72 
 
 
565 aa  385  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  41.25 
 
 
577 aa  383  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  42.83 
 
 
599 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  44.81 
 
 
566 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  42.83 
 
 
599 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  45.01 
 
 
566 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  44.95 
 
 
489 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  39.41 
 
 
568 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  41.77 
 
 
603 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  42.54 
 
 
553 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  43.23 
 
 
599 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  40.2 
 
 
558 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  41.99 
 
 
563 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  48.26 
 
 
520 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  47.74 
 
 
518 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  38.63 
 
 
568 aa  379  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  42.97 
 
 
554 aa  375  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  41.65 
 
 
553 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  43.04 
 
 
557 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  50 
 
 
477 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  44.58 
 
 
578 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  41.93 
 
 
561 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  47 
 
 
498 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.62 
 
 
571 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  42.16 
 
 
557 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  47.55 
 
 
569 aa  369  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  42.24 
 
 
573 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1621  type II secretion system protein E  49.23 
 
 
586 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143192  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  47.59 
 
 
495 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  42 
 
 
561 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  47.85 
 
 
522 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  48.45 
 
 
498 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0316  type II secretion system protein E  43.21 
 
 
497 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218046  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  42.17 
 
 
563 aa  372  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  38.89 
 
 
564 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  47.86 
 
 
502 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  46.35 
 
 
503 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  49.24 
 
 
499 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  40.12 
 
 
552 aa  371  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  42.28 
 
 
556 aa  371  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  47.34 
 
 
515 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  42.03 
 
 
585 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.17 
 
 
568 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  41.79 
 
 
585 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  46 
 
 
497 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  47.93 
 
 
498 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  46.1 
 
 
501 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  48.23 
 
 
497 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  41.29 
 
 
570 aa  366  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  48.48 
 
 
499 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  49.48 
 
 
486 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  48.48 
 
 
499 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  40.24 
 
 
555 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  48.99 
 
 
499 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  48.1 
 
 
502 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  48.48 
 
 
499 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  39.84 
 
 
514 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  47.98 
 
 
497 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.42 
 
 
568 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  47.98 
 
 
497 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  39.8 
 
 
561 aa  365  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  47.98 
 
 
497 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  47.68 
 
 
497 aa  365  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  47.98 
 
 
497 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  42.28 
 
 
572 aa  365  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  47.98 
 
 
497 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  42.68 
 
 
557 aa  365  1e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  47.98 
 
 
497 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  47.98 
 
 
497 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  46.89 
 
 
498 aa  364  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.63 
 
 
568 aa  364  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  42.54 
 
 
610 aa  364  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  40.08 
 
 
500 aa  363  3e-99  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  48.23 
 
 
498 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  46.62 
 
 
497 aa  363  4e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.827332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>