More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0741 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2611  putative general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  70.98 
 
 		 517 aa  711    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2107  type II secretion system protein E  65.38 
 
 		 606 aa  709    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3009  type II secretion system protein E  67.24 
 
 		 561 aa  714    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0910  type II secretion system protein E  65.9 
 
 		 561 aa  691    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.661185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0741  type II secretion system protein E  100 
 
 		 569 aa  1132    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1278  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  71.16 
 
 		 549 aa  742    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  50.7 
 
 		 538 aa  480  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  49.14 
 
 		 544 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  49.62 
 
 		 541 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  43.26 
 
 		 585 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  48.23 
 
 		 580 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  48.77 
 
 		 559 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  42.4 
 
 		 578 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  45.38 
 
 		 567 aa  398  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  44.87 
 
 		 566 aa  392  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  44.89 
 
 		 566 aa  392  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  42.89 
 
 		 558 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  42.55 
 
 		 566 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  49.5 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  44.32 
 
 		 575 aa  383  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  45.42 
 
 		 573 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  44.29 
 
 		 575 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  42.16 
 
 		 570 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  49.49 
 
 		 497 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  49.49 
 
 		 497 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  49.49 
 
 		 497 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  49.49 
 
 		 497 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  49.49 
 
 		 497 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  50.25 
 
 		 499 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  50 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  49.49 
 
 		 497 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43 
 
 		 571 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  50 
 
 		 499 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  49.49 
 
 		 497 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  49.49 
 
 		 497 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  50.25 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  50 
 
 		 498 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  50 
 
 		 499 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  50 
 
 		 499 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  41.63 
 
 		 577 aa  378  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  41.42 
 
 		 563 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  46.28 
 
 		 515 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  41.06 
 
 		 521 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  44.56 
 
 		 585 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  44.65 
 
 		 585 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  44.88 
 
 		 553 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  42.4 
 
 		 522 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  42.4 
 
 		 495 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  48.61 
 
 		 513 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.4 
 
 		 571 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  42.73 
 
 		 578 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  39.61 
 
 		 568 aa  369  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  42.55 
 
 		 546 aa  366  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  40.88 
 
 		 576 aa  368  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  42.57 
 
 		 599 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  42.3 
 
 		 561 aa  369  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  46.68 
 
 		 486 aa  364  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  38.95 
 
 		 568 aa  365  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  46.95 
 
 		 520 aa  364  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  40.35 
 
 		 520 aa  364  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  42.57 
 
 		 599 aa  364  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  42.45 
 
 		 599 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  42.44 
 
 		 514 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  46.97 
 
 		 493 aa  362  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  46.97 
 
 		 493 aa  362  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  49.37 
 
 		 471 aa  362  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  46.97 
 
 		 493 aa  362  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  46.97 
 
 		 493 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  40.16 
 
 		 520 aa  361  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  46.97 
 
 		 493 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  43.02 
 
 		 563 aa  361  2e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  49.24 
 
 		 474 aa  360  4e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  40.19 
 
 		 520 aa  360  5e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  44.57 
 
 		 498 aa  360  5e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  38.76 
 
 		 569 aa  359  6e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  41.73 
 
 		 550 aa  359  8e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  48.48 
 
 		 468 aa  359  8e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  39.68 
 
 		 562 aa  359  9e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  47.59 
 
 		 487 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  39.15 
 
 		 558 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  48.61 
 
 		 491 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  41.53 
 
 		 603 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.61 
 
 		 568 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  45.19 
 
 		 482 aa  358  1.9999999999999998e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  39.09 
 
 		 574 aa  357  2.9999999999999997e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.55 
 
 		 568 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  42.77 
 
 		 521 aa  356  5e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  38.45 
 
 		 574 aa  356  5e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.96 
 
 		 568 aa  356  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  38.43 
 
 		 564 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  47.37 
 
 		 561 aa  355  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  39.77 
 
 		 568 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.96 
 
 		 568 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.55 
 
 		 562 aa  354  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.41 
 
 		 563 aa  355  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  42.33 
 
 		 564 aa  354  2.9999999999999997e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  42.14 
 
 		 521 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  48.64 
 
 		 533 aa  353  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.21 
 
 		 568 aa  353  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  45.14 
 
 		 503 aa  353  4e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>