More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1621 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1621  type II secretion system protein E  100 
 
 
586 aa  1184    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143192  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  48.13 
 
 
585 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  49.75 
 
 
871 aa  400  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  43.19 
 
 
580 aa  395  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  39.06 
 
 
570 aa  390  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  49.11 
 
 
563 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  49.63 
 
 
566 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  48.28 
 
 
558 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  49.87 
 
 
550 aa  388  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  46.1 
 
 
557 aa  384  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  48.74 
 
 
553 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  48.99 
 
 
571 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  48.36 
 
 
577 aa  379  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  40.89 
 
 
572 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  47.09 
 
 
557 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.78 
 
 
571 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  48.32 
 
 
514 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0910  type II secretion system protein E  50.76 
 
 
561 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.661185 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  46.98 
 
 
520 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  41.79 
 
 
558 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  46.53 
 
 
520 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  43.01 
 
 
557 aa  378  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  41.39 
 
 
568 aa  375  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  46.72 
 
 
556 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  45.98 
 
 
561 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  42.76 
 
 
514 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  42.1 
 
 
553 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  48.35 
 
 
577 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  50.25 
 
 
575 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  49.36 
 
 
573 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  48.6 
 
 
546 aa  370  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2611  putative general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  48.22 
 
 
517 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  48.72 
 
 
603 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  46.47 
 
 
787 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  48.24 
 
 
564 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  46.43 
 
 
515 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  47.24 
 
 
558 aa  372  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.23 
 
 
568 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  40.36 
 
 
568 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  42.83 
 
 
552 aa  372  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  49.62 
 
 
599 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  49.62 
 
 
599 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  49.23 
 
 
538 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  47.71 
 
 
521 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.69 
 
 
568 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.01 
 
 
571 aa  371  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.06 
 
 
568 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.69 
 
 
568 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  48.08 
 
 
520 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  48.08 
 
 
520 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  46.35 
 
 
585 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  46.74 
 
 
585 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  46.53 
 
 
569 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.57 
 
 
568 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  49.74 
 
 
559 aa  369  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  49.62 
 
 
599 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  48.37 
 
 
561 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  46.45 
 
 
482 aa  367  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  47.18 
 
 
471 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  46.75 
 
 
575 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  44.3 
 
 
575 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  46.89 
 
 
561 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  46.08 
 
 
497 aa  365  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  46.34 
 
 
573 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  46.1 
 
 
523 aa  364  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  46.37 
 
 
578 aa  365  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  41.22 
 
 
573 aa  364  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  46.92 
 
 
568 aa  365  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  46.53 
 
 
566 aa  365  2e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  42.05 
 
 
474 aa  364  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  43.01 
 
 
555 aa  365  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47 
 
 
568 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  46.32 
 
 
497 aa  363  4e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  48.33 
 
 
469 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  46.53 
 
 
566 aa  363  4e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  43.61 
 
 
523 aa  363  4e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  46.56 
 
 
497 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  45.21 
 
 
562 aa  363  5.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  46.56 
 
 
497 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  48.23 
 
 
503 aa  363  6e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  42.17 
 
 
567 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  45.81 
 
 
468 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  50 
 
 
579 aa  362  9e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  46.38 
 
 
553 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2210  general secretory pathway protein E  47.78 
 
 
477 aa  362  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  46.17 
 
 
513 aa  362  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  42.03 
 
 
576 aa  362  1e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1278  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  47.19 
 
 
549 aa  362  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  45.5 
 
 
523 aa  361  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  46.43 
 
 
495 aa  361  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  45.61 
 
 
521 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  45.04 
 
 
499 aa  361  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  46.17 
 
 
497 aa  361  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  47.18 
 
 
544 aa  361  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  45.61 
 
 
521 aa  361  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  48.07 
 
 
469 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  47.99 
 
 
497 aa  360  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  45.37 
 
 
521 aa  360  3e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3009  type II secretion system protein E  47.72 
 
 
561 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  46.37 
 
 
491 aa  360  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>