More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3152 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3152  type II secretion system protein E  100 
 
 		 677 aa  1378    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3153  type II secretion system protein E  84.37 
 
 		 684 aa  1102    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1966  type II secretion system protein E  54.63 
 
 		 642 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56575  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0295  putative phytochrome sensor protein  50.48 
 
 		 767 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.42905  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  40.87 
 
 		 841 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  50.72 
 
 		 644 aa  425  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0279  putative phytochrome sensor protein  50.24 
 
 		 767 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1244  putative phytochrome sensor protein  51.36 
 
 		 772 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000557718  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3938  putative GAF sensor protein  49.64 
 
 		 806 aa  405  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2609  type IV pilus assembly protein, putative  47.22 
 
 		 645 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0923  putative phytochrome sensor protein  50.36 
 
 		 794 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0861  type II secretion system protein E  49.28 
 
 		 642 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1971  putative phytochrome sensor protein  49.04 
 
 		 771 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000984823  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0411  type II secretion system protein E  50.61 
 
 		 702 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319721  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0467  putative GAF sensor protein  45.84 
 
 		 736 aa  381  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116791  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1659  type II secretion system protein E  50.62 
 
 		 785 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.903835 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00443  type II secretion system protein E:GAF domain  48.56 
 
 		 738 aa  371  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0421  putative phytochrome sensor protein  47.12 
 
 		 770 aa  352  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.46 
 
 		 568 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  35.04 
 
 		 787 aa  320  6e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.47 
 
 		 571 aa  320  7e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  44.58 
 
 		 521 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  35.41 
 
 		 571 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  43.31 
 
 		 544 aa  317  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1620  type II secretion system protein E  42.15 
 
 		 616 aa  317  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  36.16 
 
 		 563 aa  317  5e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  43.44 
 
 		 871 aa  317  6e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  43.22 
 
 		 577 aa  317  7e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.03 
 
 		 568 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.03 
 
 		 568 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  36.27 
 
 		 562 aa  314  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.57 
 
 		 568 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  35.37 
 
 		 573 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  43.75 
 
 		 563 aa  313  9e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  34.72 
 
 		 568 aa  312  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  41.45 
 
 		 561 aa  312  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  35.93 
 
 		 578 aa  312  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  35.47 
 
 		 568 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.36 
 
 		 578 aa  312  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4820  type II secretion system protein E  35.84 
 
 		 566 aa  311  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  35.12 
 
 		 570 aa  310  5.9999999999999995e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.41 
 
 		 568 aa  310  8e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  43.1 
 
 		 566 aa  309  9e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  38.13 
 
 		 520 aa  309  9e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  42.72 
 
 		 515 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  42.17 
 
 		 520 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  44.17 
 
 		 522 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.17 
 
 		 569 aa  308  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  42.82 
 
 		 541 aa  308  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.85 
 
 		 568 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  36.11 
 
 		 571 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  34.89 
 
 		 568 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58750  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  36.64 
 
 		 567 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.497058 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  41.89 
 
 		 553 aa  306  7e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  39.27 
 
 		 599 aa  306  7e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.6 
 
 		 568 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  34.88 
 
 		 569 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  42.62 
 
 		 501 aa  306  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.89 
 
 		 569 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  35.69 
 
 		 566 aa  305  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1579  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.63 
 
 		 565 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  43.37 
 
 		 520 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  43.34 
 
 		 520 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  35.18 
 
 		 566 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  41.19 
 
 		 520 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5162  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  35 
 
 		 561 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.72 
 
 		 569 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  43.34 
 
 		 520 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.23 
 
 		 570 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  42.96 
 
 		 585 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  43.11 
 
 		 491 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.26 
 
 		 568 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.9 
 
 		 562 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  39.66 
 
 		 599 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  34.85 
 
 		 558 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  41.55 
 
 		 885 aa  303  6.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  39.08 
 
 		 599 aa  303  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  43.11 
 
 		 533 aa  303  9e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  42.12 
 
 		 888 aa  303  9e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  42.61 
 
 		 518 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.23 
 
 		 570 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  42.61 
 
 		 513 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  42.37 
 
 		 500 aa  302  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3833  type II secretion system protein E  35.86 
 
 		 568 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522953 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.23 
 
 		 570 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  35.52 
 
 		 562 aa  302  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0766  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.87 
 
 		 578 aa  301  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.59759  normal  0.16115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  42.36 
 
 		 518 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2611  putative general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  43.2 
 
 		 517 aa  301  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  43.38 
 
 		 494 aa  300  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  42.27 
 
 		 503 aa  300  6e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  42.36 
 
 		 494 aa  300  8e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2096  type IV pilus assembly protein PilB  42.41 
 
 		 571 aa  299  9e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  35.56 
 
 		 575 aa  299  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  42.36 
 
 		 494 aa  299  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.47 
 
 		 572 aa  299  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  43.04 
 
 		 566 aa  299  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  32.68 
 
 		 561 aa  299  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  33.17 
 
 		 561 aa  299  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  33 
 
 		 564 aa  299  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>