More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1620 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1620  type II secretion system protein E  100 
 
 		 616 aa  1231    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1966  type II secretion system protein E  43.11 
 
 		 642 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56575  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  42.04 
 
 		 841 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0279  putative phytochrome sensor protein  42.61 
 
 		 767 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  37.29 
 
 		 644 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0295  putative phytochrome sensor protein  42.5 
 
 		 767 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.42905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0861  type II secretion system protein E  38.7 
 
 		 642 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3938  putative GAF sensor protein  35.39 
 
 		 806 aa  361  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0923  putative phytochrome sensor protein  39.17 
 
 		 794 aa  360  5e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1971  putative phytochrome sensor protein  41.01 
 
 		 771 aa  356  7.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000984823  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2609  type IV pilus assembly protein, putative  37.52 
 
 		 645 aa  346  7e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1244  putative phytochrome sensor protein  43.69 
 
 		 772 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000557718  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0411  type II secretion system protein E  40.15 
 
 		 702 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319721  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3152  type II secretion system protein E  42.15 
 
 		 677 aa  330  6e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3153  type II secretion system protein E  43.35 
 
 		 684 aa  327  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1659  type II secretion system protein E  36.47 
 
 		 785 aa  312  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.903835 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0467  putative GAF sensor protein  40.5 
 
 		 736 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  34.88 
 
 		 553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  33.23 
 
 		 885 aa  300  7e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  32.72 
 
 		 568 aa  297  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  34.3 
 
 		 891 aa  297  4e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  33.23 
 
 		 888 aa  296  5e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  32.24 
 
 		 568 aa  296  9e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  32.44 
 
 		 558 aa  293  5e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  33.78 
 
 		 553 aa  293  6e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  33.12 
 
 		 871 aa  293  7e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.95 
 
 		 571 aa  293  8e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  32.73 
 
 		 568 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.22 
 
 		 568 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  35.51 
 
 		 556 aa  291  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.22 
 
 		 568 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.22 
 
 		 568 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.39 
 
 		 568 aa  291  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  33.78 
 
 		 557 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  34.84 
 
 		 553 aa  290  6e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.89 
 
 		 568 aa  289  9e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  35.77 
 
 		 561 aa  289  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.06 
 
 		 568 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  34.26 
 
 		 559 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  32.51 
 
 		 571 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0421  putative phytochrome sensor protein  41.49 
 
 		 770 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  32.39 
 
 		 566 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.11 
 
 		 563 aa  283  6.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.22 
 
 		 568 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  32.83 
 
 		 561 aa  282  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  33.08 
 
 		 558 aa  282  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  32.78 
 
 		 561 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  32.16 
 
 		 558 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00443  type II secretion system protein E:GAF domain  38.9 
 
 		 738 aa  278  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  32.46 
 
 		 570 aa  276  9e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  35.29 
 
 		 572 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  32.3 
 
 		 571 aa  274  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  32.83 
 
 		 557 aa  273  7e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  32.07 
 
 		 563 aa  271  4e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  32.35 
 
 		 566 aa  270  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  34.55 
 
 		 559 aa  270  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  32.61 
 
 		 553 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  32.11 
 
 		 555 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  32.63 
 
 		 567 aa  269  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  33.39 
 
 		 570 aa  268  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  36.01 
 
 		 514 aa  267  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  30.93 
 
 		 578 aa  266  8e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  31.77 
 
 		 564 aa  265  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.28 
 
 		 568 aa  265  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  33.95 
 
 		 586 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  32.31 
 
 		 562 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  33.44 
 
 		 599 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  30.15 
 
 		 570 aa  263  6e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  33.52 
 
 		 577 aa  263  6e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  41.08 
 
 		 511 aa  263  8.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3833  type II secretion system protein E  35.06 
 
 		 568 aa  263  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522953 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  33.28 
 
 		 599 aa  263  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  33 
 
 		 599 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  32.82 
 
 		 554 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  32.79 
 
 		 568 aa  263  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  32.95 
 
 		 554 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  34.39 
 
 		 520 aa  261  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  32.62 
 
 		 563 aa  261  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2665  type II secretion system protein E  31.52 
 
 		 545 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  38.83 
 
 		 503 aa  260  5.0000000000000005e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  38.64 
 
 		 500 aa  259  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  34.54 
 
 		 585 aa  259  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  31.24 
 
 		 787 aa  258  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  30.78 
 
 		 564 aa  258  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  31.67 
 
 		 577 aa  258  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  31.51 
 
 		 573 aa  258  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  34.92 
 
 		 520 aa  257  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.21 
 
 		 571 aa  256  9e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  34.98 
 
 		 520 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  38.41 
 
 		 501 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  34.98 
 
 		 520 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  33.55 
 
 		 575 aa  255  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  40.29 
 
 		 502 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  32.45 
 
 		 563 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  32.19 
 
 		 565 aa  255  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  35.13 
 
 		 571 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  32.45 
 
 		 569 aa  254  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  34.77 
 
 		 521 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  33.46 
 
 		 637 aa  254  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  33.66 
 
 		 603 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>