More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1244 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0295  putative phytochrome sensor protein  49.14 
 
 		 767 aa  752    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.42905  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0923  putative phytochrome sensor protein  45.3 
 
 		 794 aa  666    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3938  putative GAF sensor protein  48.45 
 
 		 806 aa  720    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0279  putative phytochrome sensor protein  48.75 
 
 		 767 aa  745    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1971  putative phytochrome sensor protein  49.67 
 
 		 771 aa  743    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000984823  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1244  putative phytochrome sensor protein  100 
 
 		 772 aa  1597    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000557718  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0467  putative GAF sensor protein  39.92 
 
 		 736 aa  570  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  47.72 
 
 		 644 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00443  type II secretion system protein E:GAF domain  43.23 
 
 		 738 aa  535  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2609  type IV pilus assembly protein, putative  46.04 
 
 		 645 aa  532  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0861  type II secretion system protein E  46.27 
 
 		 642 aa  526  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0421  putative phytochrome sensor protein  38.97 
 
 		 770 aa  525  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0411  type II secretion system protein E  46.11 
 
 		 702 aa  515  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319721  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1659  type II secretion system protein E  46.09 
 
 		 785 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.903835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  43.79 
 
 		 841 aa  473  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1966  type II secretion system protein E  54.71 
 
 		 642 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56575  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3152  type II secretion system protein E  50.36 
 
 		 677 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3153  type II secretion system protein E  50.61 
 
 		 684 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  37.44 
 
 		 871 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3833  type II secretion system protein E  43.12 
 
 		 568 aa  378  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522953 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  38.35 
 
 		 565 aa  363  5.0000000000000005e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  38.53 
 
 		 599 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  40 
 
 		 577 aa  363  1e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.39 
 
 		 568 aa  362  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  38.1 
 
 		 599 aa  362  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  37.91 
 
 		 599 aa  361  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  38.43 
 
 		 556 aa  361  4e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.44 
 
 		 568 aa  360  6e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.44 
 
 		 568 aa  360  7e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  37.06 
 
 		 563 aa  359  8e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  33.64 
 
 		 727 aa  359  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  38.3 
 
 		 578 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  36.27 
 
 		 568 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  40.68 
 
 		 557 aa  357  5e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  37.56 
 
 		 553 aa  356  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.26 
 
 		 568 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.46 
 
 		 571 aa  354  2.9999999999999997e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  36.8 
 
 		 568 aa  353  8.999999999999999e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  36.97 
 
 		 561 aa  352  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.11 
 
 		 568 aa  352  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  37.3 
 
 		 557 aa  352  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  35.71 
 
 		 558 aa  351  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  36.13 
 
 		 553 aa  350  6e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  36.71 
 
 		 553 aa  350  8e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.14 
 
 		 568 aa  349  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  36.46 
 
 		 568 aa  348  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.14 
 
 		 568 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.15 
 
 		 571 aa  346  8e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  36.17 
 
 		 572 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  36.64 
 
 		 555 aa  345  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  36.91 
 
 		 563 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  36.47 
 
 		 787 aa  343  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  38.42 
 
 		 603 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.38 
 
 		 568 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  36.01 
 
 		 558 aa  340  5.9999999999999996e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  40.83 
 
 		 570 aa  339  9e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  39.02 
 
 		 891 aa  339  9.999999999999999e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  37.32 
 
 		 566 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  36.95 
 
 		 885 aa  338  1.9999999999999998e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  35.29 
 
 		 566 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  37.61 
 
 		 567 aa  337  5.999999999999999e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  36.07 
 
 		 571 aa  336  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  38 
 
 		 561 aa  336  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  40.47 
 
 		 562 aa  335  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  43.4 
 
 		 503 aa  332  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  43.72 
 
 		 501 aa  332  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  35.83 
 
 		 585 aa  331  3e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  36.65 
 
 		 574 aa  331  3e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  36.33 
 
 		 579 aa  331  3e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  36.8 
 
 		 559 aa  331  3e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  37.24 
 
 		 580 aa  331  4e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  33 
 
 		 570 aa  331  4e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  37.54 
 
 		 577 aa  330  5.0000000000000004e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  37.99 
 
 		 561 aa  330  5.0000000000000004e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  39.76 
 
 		 574 aa  330  7e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  38.29 
 
 		 514 aa  330  9e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.6 
 
 		 562 aa  330  9e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1620  type II secretion system protein E  41.95 
 
 		 616 aa  328  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  34.7 
 
 		 573 aa  328  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  38.16 
 
 		 520 aa  327  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  38.78 
 
 		 482 aa  327  7e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  37.8 
 
 		 561 aa  326  8.000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  43.24 
 
 		 500 aa  326  8.000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0064  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilB  38.48 
 
 		 591 aa  326  1e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.978792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0069  type II secretion system protein E  38.19 
 
 		 570 aa  324  5e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.73093  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  37.81 
 
 		 552 aa  323  6e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  34.59 
 
 		 561 aa  323  6e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1579  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.87 
 
 		 565 aa  323  6e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  36.11 
 
 		 610 aa  323  6e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  35.04 
 
 		 573 aa  323  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  44.31 
 
 		 499 aa  323  7e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  37.27 
 
 		 888 aa  323  9.000000000000001e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.64 
 
 		 563 aa  322  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  34.26 
 
 		 559 aa  321  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  44.14 
 
 		 560 aa  321  3e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  37.08 
 
 		 569 aa  320  6e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  42.96 
 
 		 561 aa  320  7e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0509  pilus biogenesis ATPase  39.57 
 
 		 572 aa  320  7e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0385141 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  43.03 
 
 		 601 aa  320  9e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  35.87 
 
 		 578 aa  319  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>