93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2061 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2061  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  712    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1307  Allergen V5/Tpx-1 family protein  55.12 
 
 		 440 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000813036  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  52.91 
 
 		 1141 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2691  hypothetical protein  31.39 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204829 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2573  hypothetical protein  38.41 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  54.55 
 
 		 553 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2742  CheC domain protein  33.87 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00482165  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  55.1 
 
 		 575 aa  57.4  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  43.64 
 
 		 554 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  32 
 
 		 885 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  50.91 
 
 		 555 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  29.36 
 
 		 888 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  42.37 
 
 		 574 aa  53.1  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  44.44 
 
 		 559 aa  52  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1172  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  44.23 
 
 		 247 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  43.4 
 
 		 574 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  36.67 
 
 		 554 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  40 
 
 		 564 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  44.44 
 
 		 558 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2605  hypothetical protein  32.48 
 
 		 218 aa  50.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.103693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3898  type II secretion system protein E  38.26 
 
 		 648 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000434114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  49.09 
 
 		 553 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  41.82 
 
 		 570 aa  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.1 
 
 		 571 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  49.15 
 
 		 574 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  29.76 
 
 		 891 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  47.37 
 
 		 553 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3397  hypothetical protein  43.94 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  55.1 
 
 		 594 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  42.11 
 
 		 578 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  50 
 
 		 578 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  50.88 
 
 		 570 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  27.35 
 
 		 644 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  50 
 
 		 570 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3331  hypothetical protein  33.08 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1194  bacteriophage N4 adsorption protein B  25.6 
 
 		 706 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  25.54 
 
 		 398 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  40 
 
 		 561 aa  47  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1011  hypothetical protein  32.56 
 
 		 249 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.823882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2922  hypothetical protein  35.77 
 
 		 265 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0126105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  43.33 
 
 		 586 aa  46.6  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2985  hypothetical protein  35.77 
 
 		 249 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0275079  hitchhiker  0.000737309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  46.94 
 
 		 637 aa  46.6  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  47.17 
 
 		 578 aa  46.2  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4205  heat shock protein DnaJ domain protein  29.25 
 
 		 270 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2860  type II secretion system protein E  42.59 
 
 		 491 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.898794  normal  0.474728 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1225  hypothetical protein  28.69 
 
 		 176 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1030  bacteriophage N4 adsorption protein B  26.09 
 
 		 706 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1255  hypothetical protein  28.69 
 
 		 191 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  46.15 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  45.28 
 
 		 585 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  41.54 
 
 		 567 aa  46.2  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  40 
 
 		 577 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4230  heat shock protein DnaJ domain protein  29.25 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0473127  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.49 
 
 		 927 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  29.66 
 
 		 841 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1606  hypothetical protein  27.46 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000014118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1135  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 283 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  39.29 
 
 		 563 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  45.28 
 
 		 584 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0858  Beta-ketoacyl synthase  39.39 
 
 		 2725 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  46 
 
 		 569 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 		 724 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0972  type II secretion system protein E  43.75 
 
 		 528 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3127  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 283 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0368  type II secretion system protein E  29.93 
 
 		 638 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  53.19 
 
 		 557 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1379  hypothetical protein  39.62 
 
 		 240 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0373776  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  31.97 
 
 		 478 aa  43.9  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  34.21 
 
 		 561 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  39.62 
 
 		 570 aa  43.5  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  31.67 
 
 		 562 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2090  type II secretion system protein E  46.15 
 
 		 573 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2665  type II secretion system protein E  51.11 
 
 		 545 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  47.92 
 
 		 564 aa  43.5  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  39.66 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  45.24 
 
 		 558 aa  43.9  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1124  general secretion pathway protein E  35.87 
 
 		 1017 aa  43.9  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.553401 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  39.66 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  37.74 
 
 		 566 aa  43.5  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4206  type II secretion system protein E  38.1 
 
 		 621 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  44.23 
 
 		 566 aa  43.5  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  31.67 
 
 		 563 aa  43.1  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  37.5 
 
 		 568 aa  43.1  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3835  hypothetical protein  30.56 
 
 		 206 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.916575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3960  hypothetical protein  30.36 
 
 		 168 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4157  hypothetical protein  34 
 
 		 366 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4184  hypothetical protein  31.78 
 
 		 366 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  33.33 
 
 		 345 aa  42.7  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  40.68 
 
 		 575 aa  42.7  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>