66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2350 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  100 
 
 
478 aa  977    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  45.24 
 
 
469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  44.77 
 
 
468 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  41.98 
 
 
480 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  44.08 
 
 
453 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  44.57 
 
 
458 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  45.03 
 
 
459 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  44.68 
 
 
456 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  43.4 
 
 
432 aa  364  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  43.16 
 
 
432 aa  362  7.0000000000000005e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  43.28 
 
 
519 aa  352  1e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  39.29 
 
 
536 aa  338  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  40.71 
 
 
538 aa  332  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  40.95 
 
 
452 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  39.76 
 
 
538 aa  325  8.000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  39.52 
 
 
538 aa  324  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  40.52 
 
 
578 aa  323  4e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  39.72 
 
 
441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  38.61 
 
 
440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  39.9 
 
 
472 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  39.59 
 
 
470 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  38.44 
 
 
436 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  38.68 
 
 
436 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  38.68 
 
 
436 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  37.94 
 
 
435 aa  293  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  37.17 
 
 
441 aa  292  9e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  38.13 
 
 
427 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  40.55 
 
 
434 aa  289  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  35.31 
 
 
435 aa  286  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  37.41 
 
 
438 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  37.67 
 
 
499 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  38.1 
 
 
466 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  38.1 
 
 
466 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  36.9 
 
 
466 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  35.95 
 
 
460 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  37.86 
 
 
466 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  35.95 
 
 
460 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  35.95 
 
 
460 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  36.43 
 
 
466 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  36.43 
 
 
460 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  35.95 
 
 
466 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  31.88 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  47.37 
 
 
575 aa  53.9  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  43.86 
 
 
637 aa  50.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4274  General secretory system II protein E domain protein  42.86 
 
 
479 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.532323  normal  0.0350224 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  44.07 
 
 
566 aa  50.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.62 
 
 
571 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  40.35 
 
 
574 aa  47.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  41.07 
 
 
586 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  42 
 
 
554 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  41.07 
 
 
594 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  38.46 
 
 
570 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  37.5 
 
 
570 aa  44.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  36.84 
 
 
574 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  36.49 
 
 
568 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  40 
 
 
571 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.46 
 
 
568 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.46 
 
 
568 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2061  hypothetical protein  31.97 
 
 
356 aa  43.9  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.46 
 
 
568 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  30.7 
 
 
892 aa  43.9  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  41.67 
 
 
568 aa  43.5  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3480  General secretory system II protein E domain protein  57.5 
 
 
181 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3335  general secretory system II, protein E-like  57.5 
 
 
182 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0137168  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3416  General secretory system II protein E domain protein  57.5 
 
 
181 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.83 
 
 
563 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>