More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1455 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 927 aa  1860    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 770 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  45.96 
 
 		 954 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  46.21 
 
 		 1089 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  34.05 
 
 		 708 aa  369  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 		 1031 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  32.6 
 
 		 707 aa  356  8.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  45.96 
 
 		 1030 aa  356  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 699 aa  355  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 702 aa  353  8e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 709 aa  352  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 724 aa  352  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.06 
 
 		 693 aa  349  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  43.83 
 
 		 681 aa  344  4e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 697 aa  344  5.999999999999999e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  40 
 
 		 701 aa  343  7e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  42.19 
 
 		 761 aa  343  8e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  33.29 
 
 		 720 aa  343  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 719 aa  340  8e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 697 aa  337  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 712 aa  336  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  39.85 
 
 		 770 aa  336  1e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 708 aa  335  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  32.77 
 
 		 741 aa  332  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  29.87 
 
 		 887 aa  331  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  38.65 
 
 		 769 aa  331  3e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  38.88 
 
 		 769 aa  331  4e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  38.89 
 
 		 769 aa  331  4e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 598 aa  330  8e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 709 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  31.53 
 
 		 704 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  39.86 
 
 		 774 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  38.74 
 
 		 783 aa  329  2.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  30.43 
 
 		 723 aa  328  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 		 673 aa  326  1e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 713 aa  326  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  29.82 
 
 		 667 aa  325  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  29.82 
 
 		 667 aa  325  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  29.82 
 
 		 667 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2327  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.13 
 
 		 862 aa  324  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.26 
 
 		 677 aa  324  4e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 707 aa  324  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  38.31 
 
 		 785 aa  323  9.000000000000001e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 702 aa  323  9.000000000000001e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 687 aa  323  9.999999999999999e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 604 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 682 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 		 686 aa  322  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 675 aa  321  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  38.29 
 
 		 770 aa  319  1e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 666 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 603 aa  319  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 698 aa  319  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 728 aa  318  3e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 733 aa  318  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 696 aa  316  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 674 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 732 aa  314  3.9999999999999997e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 		 614 aa  314  3.9999999999999997e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  38.79 
 
 		 803 aa  314  4.999999999999999e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  40.83 
 
 		 685 aa  313  6.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  38.01 
 
 		 610 aa  313  7.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  31.27 
 
 		 681 aa  313  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 		 701 aa  312  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 		 660 aa  312  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  33.54 
 
 		 801 aa  312  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 		 666 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  38.98 
 
 		 714 aa  310  8e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 		 679 aa  310  9e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 741 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 696 aa  310  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 607 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  30.89 
 
 		 669 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03242  chemotaxis protein CheA  40.6 
 
 		 913 aa  308  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  38.8 
 
 		 720 aa  308  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 654 aa  307  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 		 655 aa  306  9.000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 606 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 878 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  31.53 
 
 		 601 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 691 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 		 745 aa  304  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 		 729 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 673 aa  303  7.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 934 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 688 aa  303  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 747 aa  302  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 671 aa  302  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 743 aa  302  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 		 691 aa  302  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 747 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  38.54 
 
 		 754 aa  301  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 695 aa  301  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 		 746 aa  301  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 746 aa  301  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 747 aa  301  5e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  31.35 
 
 		 733 aa  301  5e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.93 
 
 		 767 aa  300  6e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 738 aa  300  6e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  41.48 
 
 		 654 aa  300  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>