62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1194 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0567  bacteriophage N4 adsorption protein B  59.51 
 
 		 715 aa  789    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1194  bacteriophage N4 adsorption protein B  100 
 
 		 706 aa  1455    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1030  bacteriophage N4 adsorption protein B  95.33 
 
 		 706 aa  1379    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1734  bacteriophage N4 adsorption protein B  56.32 
 
 		 713 aa  744    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2943  bacteriophage N4 adsorption protein B  63.27 
 
 		 573 aa  712    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493194  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  44.18 
 
 		 703 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  44.18 
 
 		 703 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  43.63 
 
 		 698 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2659  bacteriophage N4 adsorption protein B  41.83 
 
 		 653 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2524  bacteriophage N4 adsorption protein B  41.55 
 
 		 736 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0586  bacteriophage N4 adsorption protein B  43.04 
 
 		 745 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437214  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3060  General secretory system II protein E domain protein  43.04 
 
 		 745 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0642  bacteriophage N4 adsorption protein B  43.04 
 
 		 745 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3083  bacteriophage N4 adsorption protein B  43.04 
 
 		 745 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2488  bacteriophage N4 adsorption protein B  37.55 
 
 		 724 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3448  bacteriophage N4 adsorption protein B  37.83 
 
 		 724 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1710  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.28 
 
 		 724 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2932  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.74 
 
 		 724 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748397  normal  0.174215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2724  bacteriophage N4 adsorption protein B  42.89 
 
 		 497 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2242  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.28 
 
 		 502 aa  320  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0150202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2152  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.28 
 
 		 502 aa  319  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.518068  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0601  bacteriophage N4 adsorption protein B  35.67 
 
 		 483 aa  242  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1309  bacteriophage N4 receptor, inner membrane subunit  33.4 
 
 		 542 aa  216  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2644  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.63 
 
 		 488 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3312  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.14 
 
 		 442 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2548  general secretion pathway protein E  31.9 
 
 		 442 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1755  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.03 
 
 		 670 aa  196  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660131  normal  0.0589931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1600  bacteriophage N4 adsorption protein B  27.8 
 
 		 711 aa  176  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.443209  hitchhiker  0.00000043363 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.41 
 
 		 532 aa  57  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  28.95 
 
 		 547 aa  56.6  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  33.08 
 
 		 559 aa  56.6  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  30.37 
 
 		 891 aa  56.6  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  23.19 
 
 		 698 aa  55.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2989  type II secretion system protein E  31.82 
 
 		 636 aa  53.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  26.67 
 
 		 644 aa  51.6  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  30 
 
 		 610 aa  50.8  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  25.84 
 
 		 885 aa  50.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  29.58 
 
 		 569 aa  49.7  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  28.17 
 
 		 558 aa  48.9  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  23.93 
 
 		 626 aa  48.5  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  28.03 
 
 		 570 aa  48.5  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  26.17 
 
 		 888 aa  48.1  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 		 683 aa  47.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  26.87 
 
 		 553 aa  47.4  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2061  hypothetical protein  25.6 
 
 		 356 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  34.65 
 
 		 587 aa  47  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  30.08 
 
 		 553 aa  47  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  22.75 
 
 		 461 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  35.62 
 
 		 578 aa  45.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  25.74 
 
 		 553 aa  45.8  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  34.92 
 
 		 554 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  28.68 
 
 		 568 aa  45.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  24.51 
 
 		 561 aa  45.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  28.89 
 
 		 582 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  34.41 
 
 		 573 aa  45.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  21.21 
 
 		 442 aa  44.7  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0886  type II secretion system protein E  35.58 
 
 		 571 aa  44.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  22.38 
 
 		 464 aa  44.3  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  22.38 
 
 		 464 aa  44.3  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  34.48 
 
 		 567 aa  44.3  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  34.48 
 
 		 566 aa  44.3  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  21.47 
 
 		 417 aa  43.9  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>