More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2860 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2860  type II secretion system protein E  100 
 
 		 491 aa  987    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.898794  normal  0.474728 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2855  type II secretion system protein E  45.85 
 
 		 490 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.370108  normal  0.352738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0972  type II secretion system protein E  37.12 
 
 		 528 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  33.27 
 
 		 554 aa  261  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  41.14 
 
 		 469 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  40.32 
 
 		 495 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  34.17 
 
 		 553 aa  252  8.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  31.94 
 
 		 560 aa  251  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  32.62 
 
 		 563 aa  249  7e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  34.38 
 
 		 553 aa  249  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  38.83 
 
 		 500 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  40.27 
 
 		 502 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  40.27 
 
 		 502 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0543  type II secretion system protein E  41.08 
 
 		 462 aa  246  9e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1755  general secretory pathway protein E  40.29 
 
 		 462 aa  246  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.571927  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  40.32 
 
 		 518 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  38.83 
 
 		 523 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  38.73 
 
 		 494 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  41.64 
 
 		 499 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  32.37 
 
 		 558 aa  243  7.999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  31.99 
 
 		 553 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  40.82 
 
 		 497 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  40.82 
 
 		 497 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  38.99 
 
 		 494 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  40.82 
 
 		 497 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  40.82 
 
 		 497 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  40.82 
 
 		 497 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  40.82 
 
 		 497 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  40.82 
 
 		 497 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  40.82 
 
 		 497 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.07 
 
 		 571 aa  242  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1072  general secretory pathway protein E  39.77 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.538099  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  32.86 
 
 		 885 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1010  type II secretion system protein E  37.4 
 
 		 598 aa  241  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  40.65 
 
 		 515 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  41.1 
 
 		 498 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  41.92 
 
 		 477 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  41.1 
 
 		 499 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1330  type II secretion system protein E  38.83 
 
 		 474 aa  240  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  38.03 
 
 		 521 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  38.03 
 
 		 521 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  38.03 
 
 		 521 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  38.03 
 
 		 521 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  33.27 
 
 		 575 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0645  general secretory pathway protein E  41.43 
 
 		 462 aa  239  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181851  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0666  general secretory pathway protein E  41.43 
 
 		 462 aa  239  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  38.03 
 
 		 503 aa  239  9e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  30.89 
 
 		 568 aa  239  9e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  41.94 
 
 		 469 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  38.03 
 
 		 521 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  35.97 
 
 		 524 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  36.84 
 
 		 499 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  42.22 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  38.83 
 
 		 523 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  29.08 
 
 		 569 aa  238  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  38.93 
 
 		 486 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  40.82 
 
 		 499 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  38.3 
 
 		 511 aa  237  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  37.5 
 
 		 501 aa  237  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  36.68 
 
 		 574 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  38.93 
 
 		 498 aa  237  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  38.3 
 
 		 514 aa  237  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  40.82 
 
 		 499 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  37.77 
 
 		 521 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  40.82 
 
 		 499 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  38.03 
 
 		 521 aa  238  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2096  type IV pilus assembly protein PilB  37.99 
 
 		 571 aa  237  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  38.73 
 
 		 501 aa  237  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  33.33 
 
 		 575 aa  237  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  29.8 
 
 		 555 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  40.82 
 
 		 499 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  37.77 
 
 		 521 aa  237  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  37.77 
 
 		 521 aa  237  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  33.64 
 
 		 578 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  36.34 
 
 		 585 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  36.41 
 
 		 574 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  38.3 
 
 		 523 aa  236  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  41.21 
 
 		 468 aa  236  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  37.93 
 
 		 520 aa  236  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  38.03 
 
 		 497 aa  236  7e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0775  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.73 
 
 		 567 aa  236  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.621188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  40.6 
 
 		 522 aa  236  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  31.64 
 
 		 573 aa  236  9e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  40.16 
 
 		 495 aa  236  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.3 
 
 		 566 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  37.23 
 
 		 509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  38.03 
 
 		 497 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  39.04 
 
 		 575 aa  236  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  32.48 
 
 		 578 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  38.03 
 
 		 497 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  38.1 
 
 		 514 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0931  type II secretion system protein E  31.74 
 
 		 551 aa  235  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.1993  normal  0.0211669 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  38.03 
 
 		 497 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  37.87 
 
 		 520 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  36.77 
 
 		 494 aa  235  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  38.03 
 
 		 497 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4820  type II secretion system protein E  38.46 
 
 		 566 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0232  general secretory pathway protein E  38.1 
 
 		 525 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.92 
 
 		 572 aa  234  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  31.54 
 
 		 557 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>