More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0931 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0931  type II secretion system protein E  100 
 
 
551 aa  1135    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.1993  normal  0.0211669 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  40.22 
 
 
553 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  38.42 
 
 
558 aa  362  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  37.21 
 
 
871 aa  355  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  37.63 
 
 
591 aa  355  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  37.84 
 
 
553 aa  351  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  36.93 
 
 
573 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  34.41 
 
 
558 aa  343  5.999999999999999e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  37.03 
 
 
553 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  35.83 
 
 
557 aa  340  5.9999999999999996e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  34.77 
 
 
561 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  36.54 
 
 
556 aa  340  5.9999999999999996e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  36.09 
 
 
553 aa  339  9e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  34.68 
 
 
787 aa  339  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  36.04 
 
 
565 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  35.89 
 
 
560 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  34.87 
 
 
570 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  37.52 
 
 
564 aa  336  7e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  36.27 
 
 
555 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  47.58 
 
 
521 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  34.05 
 
 
562 aa  333  6e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  35.61 
 
 
559 aa  332  8e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  36.27 
 
 
563 aa  332  1e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  34.82 
 
 
564 aa  332  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  36.96 
 
 
561 aa  332  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  37.8 
 
 
599 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  33.99 
 
 
563 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  36.84 
 
 
603 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  37.63 
 
 
599 aa  330  6e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  37.72 
 
 
561 aa  329  9e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  36.14 
 
 
558 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  45.48 
 
 
489 aa  327  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  33.87 
 
 
568 aa  326  6e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  37.84 
 
 
563 aa  325  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  33.57 
 
 
563 aa  325  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  37.46 
 
 
599 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  35.41 
 
 
557 aa  323  6e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  36.76 
 
 
589 aa  322  9.000000000000001e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  42.71 
 
 
577 aa  322  9.999999999999999e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  35.64 
 
 
573 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  44.57 
 
 
560 aa  321  1.9999999999999998e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.88 
 
 
568 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.88 
 
 
568 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  43.77 
 
 
515 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  35.27 
 
 
561 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  35.9 
 
 
571 aa  320  3e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  45.8 
 
 
520 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  46.34 
 
 
520 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  46.34 
 
 
520 aa  320  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  34.09 
 
 
568 aa  320  6e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0078  type II secretion system protein E  35.45 
 
 
554 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  34.4 
 
 
577 aa  319  9e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  34.52 
 
 
568 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  35.7 
 
 
578 aa  317  4e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.94 
 
 
568 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  42.4 
 
 
583 aa  316  5e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  36.25 
 
 
554 aa  316  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  34.9 
 
 
579 aa  316  8e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  41.92 
 
 
503 aa  316  8e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  33.39 
 
 
561 aa  315  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  34.99 
 
 
569 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  43.26 
 
 
518 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  33.81 
 
 
568 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  37.5 
 
 
482 aa  315  1.9999999999999998e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  35.38 
 
 
578 aa  314  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  33.45 
 
 
568 aa  313  3.9999999999999997e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  43.49 
 
 
520 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  41.33 
 
 
583 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  43.23 
 
 
514 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  42.36 
 
 
494 aa  313  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.38 
 
 
569 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  34.85 
 
 
578 aa  312  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  33.39 
 
 
570 aa  312  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.51 
 
 
569 aa  311  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  34.9 
 
 
575 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  36.94 
 
 
577 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  35.4 
 
 
566 aa  310  4e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  36.24 
 
 
574 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  45.83 
 
 
514 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  34.35 
 
 
566 aa  309  8e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  33.85 
 
 
569 aa  309  9e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  46.09 
 
 
503 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  34.68 
 
 
572 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  42.97 
 
 
569 aa  308  1.0000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  33.57 
 
 
567 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  44.72 
 
 
500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.03 
 
 
570 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  42.05 
 
 
520 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  41.1 
 
 
585 aa  307  4.0000000000000004e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.85 
 
 
569 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.64 
 
 
569 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  42.13 
 
 
583 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.68 
 
 
570 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.68 
 
 
569 aa  306  6e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  34.98 
 
 
568 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  35.48 
 
 
610 aa  306  8.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  42.13 
 
 
670 aa  306  8.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  43.95 
 
 
566 aa  306  8.000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  41.93 
 
 
595 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  34.95 
 
 
885 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>