More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1345 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  59.47 
 
 		 568 aa  711    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  55.61 
 
 		 565 aa  662    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  100 
 
 		 563 aa  1140    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0078  type II secretion system protein E  56.06 
 
 		 554 aa  668    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  53.57 
 
 		 560 aa  612  9.999999999999999e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0886  type II secretion system protein E  49.37 
 
 		 571 aa  561  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0113  type II secretion system protein E  48.65 
 
 		 688 aa  545  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00290435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  40 
 
 		 558 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  39.53 
 
 		 558 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  37.86 
 
 		 554 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  39.86 
 
 		 553 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  39.96 
 
 		 563 aa  397  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  39.6 
 
 		 553 aa  398  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.61 
 
 		 568 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  37.21 
 
 		 564 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  37.52 
 
 		 787 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  36.74 
 
 		 562 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  39.08 
 
 		 568 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  36.49 
 
 		 563 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  38.46 
 
 		 564 aa  389  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  39.06 
 
 		 553 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  38.61 
 
 		 573 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  38.98 
 
 		 568 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  37.59 
 
 		 571 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  36.59 
 
 		 577 aa  385  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  37.3 
 
 		 570 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  38.96 
 
 		 569 aa  384  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  37.37 
 
 		 556 aa  382  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  39.5 
 
 		 559 aa  384  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  37.37 
 
 		 568 aa  383  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.23 
 
 		 571 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  38.97 
 
 		 553 aa  385  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  38.7 
 
 		 555 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  38.6 
 
 		 568 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.67 
 
 		 568 aa  379  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.42 
 
 		 568 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.42 
 
 		 568 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  38.08 
 
 		 561 aa  379  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  37.14 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  36.96 
 
 		 557 aa  369  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.21 
 
 		 568 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  36.57 
 
 		 566 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  36.11 
 
 		 567 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  38.88 
 
 		 589 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  35.68 
 
 		 577 aa  366  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.9 
 
 		 563 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  36.51 
 
 		 569 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  37.89 
 
 		 565 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  36.33 
 
 		 573 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  38.34 
 
 		 599 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  36.9 
 
 		 571 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  36.48 
 
 		 871 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  38.94 
 
 		 599 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  37.32 
 
 		 570 aa  364  2e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  37.85 
 
 		 572 aa  364  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  38.16 
 
 		 599 aa  365  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  36.64 
 
 		 561 aa  363  6e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  37.25 
 
 		 603 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  38.08 
 
 		 561 aa  362  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  37.48 
 
 		 591 aa  362  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.35 
 
 		 568 aa  361  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  37.01 
 
 		 823 aa  361  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  34.51 
 
 		 637 aa  361  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  35.83 
 
 		 567 aa  360  5e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  35.65 
 
 		 577 aa  359  9e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.17 
 
 		 568 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  36.51 
 
 		 586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  38.8 
 
 		 574 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  35.37 
 
 		 566 aa  356  5e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  37 
 
 		 610 aa  355  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  37.85 
 
 		 575 aa  354  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  35.71 
 
 		 587 aa  354  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  35.87 
 
 		 577 aa  353  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  34.49 
 
 		 568 aa  353  5e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  36.13 
 
 		 885 aa  353  5.9999999999999994e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  38.09 
 
 		 806 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  35.91 
 
 		 578 aa  352  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  38.22 
 
 		 574 aa  352  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  36.13 
 
 		 584 aa  351  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.82 
 
 		 568 aa  352  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  35.66 
 
 		 558 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  38.95 
 
 		 520 aa  350  4e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  35.57 
 
 		 576 aa  350  6e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  36.91 
 
 		 746 aa  349  7e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  47.12 
 
 		 518 aa  349  8e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  34.69 
 
 		 612 aa  349  9e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  38.99 
 
 		 520 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  43.85 
 
 		 500 aa  348  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  35.15 
 
 		 585 aa  348  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  37.69 
 
 		 574 aa  348  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  44.76 
 
 		 503 aa  347  3e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  35.63 
 
 		 586 aa  347  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  36.22 
 
 		 586 aa  347  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  34.42 
 
 		 585 aa  347  3e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0563  type II secretion system protein E  35.12 
 
 		 586 aa  347  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  31.99 
 
 		 561 aa  346  6e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  35.23 
 
 		 561 aa  346  8e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  35.66 
 
 		 583 aa  346  8e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  38.99 
 
 		 575 aa  345  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  43.33 
 
 		 501 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>