More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0467 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  56.57 
 
 
701 aa  718    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  52.42 
 
 
697 aa  669    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  53.28 
 
 
698 aa  676    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  56.17 
 
 
702 aa  697    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  63.79 
 
 
709 aa  847    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  54.58 
 
 
709 aa  714    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  52.71 
 
 
696 aa  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  56.86 
 
 
686 aa  733    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  53.36 
 
 
702 aa  681    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
724 aa  1426    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  56.65 
 
 
682 aa  725    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  54.57 
 
 
707 aa  706    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  68.73 
 
 
708 aa  954    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  53.17 
 
 
712 aa  685    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  52.11 
 
 
708 aa  672    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  50.29 
 
 
693 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  46.54 
 
 
694 aa  585  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  47.07 
 
 
679 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  43.93 
 
 
681 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 
688 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  43.74 
 
 
691 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 
679 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  42.94 
 
 
686 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  41.44 
 
 
733 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  41.83 
 
 
720 aa  513  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  46.16 
 
 
652 aa  514  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  44.55 
 
 
685 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 
732 aa  490  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 
733 aa  487  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  41.18 
 
 
741 aa  485  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  41.86 
 
 
700 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 
654 aa  475  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  41.08 
 
 
705 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  37.02 
 
 
714 aa  468  9.999999999999999e-131  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
699 aa  464  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
750 aa  458  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0619  CheA signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 
794 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110186 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1209  CheA signal transduction histidine kinases  41.19 
 
 
697 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  40.36 
 
 
720 aa  449  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 
707 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 
756 aa  448  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 
686 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
688 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
739 aa  428  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
677 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 
747 aa  418  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
682 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 
695 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  36.83 
 
 
681 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
694 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  37.27 
 
 
703 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
675 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 
760 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
702 aa  387  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  36.54 
 
 
669 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 
759 aa  385  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2478  CheA signal transduction histidine kinase  57.07 
 
 
660 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
684 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2574  CheA signal transduction histidine kinase  56.79 
 
 
661 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.12503  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  36.98 
 
 
729 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  34.92 
 
 
736 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  35.06 
 
 
736 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  36.27 
 
 
704 aa  382  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 
735 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  55.98 
 
 
658 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
751 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
684 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5775  CheA signal transduction histidine kinase  54.5 
 
 
714 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  36.5 
 
 
717 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4815  CheA signal transduction histidine kinase  54.81 
 
 
702 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  36.13 
 
 
727 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  35.92 
 
 
717 aa  371  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  36.29 
 
 
758 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.65 
 
 
806 aa  368  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.47 
 
 
927 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  52.22 
 
 
654 aa  365  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1584  chemotaxis histidine protein kinase  52.22 
 
 
654 aa  365  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.678464  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
713 aa  364  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  32.53 
 
 
715 aa  356  8.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
681 aa  355  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  36.23 
 
 
748 aa  355  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
751 aa  355  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  34.92 
 
 
685 aa  350  5e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  47.88 
 
 
672 aa  350  5e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
691 aa  350  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  31.03 
 
 
692 aa  350  5e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  47.54 
 
 
674 aa  350  6e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  34.24 
 
 
711 aa  349  1e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  48.96 
 
 
784 aa  348  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  47.76 
 
 
724 aa  348  3e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 
666 aa  348  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  49.09 
 
 
761 aa  347  6e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  48.96 
 
 
662 aa  345  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
673 aa  345  1e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
697 aa  345  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  44.21 
 
 
702 aa  345  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  32.89 
 
 
736 aa  345  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
655 aa  345  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  46.52 
 
 
654 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  32.38 
 
 
714 aa  345  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>