More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4206 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008738  Maqu_4206  type II secretion system protein E  100 
 
 
621 aa  1289    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2833  type II secretion system protein E  27.92 
 
 
616 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.68865 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5448  type II secretion system protein E  30.33 
 
 
520 aa  177  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40051  normal  0.0905589 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0360  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein T  33.12 
 
 
503 aa  171  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.547799  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0114  ATP-binding protein  29.51 
 
 
517 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5243  type II secretion system protein E  29.2 
 
 
518 aa  167  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62369  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5912  type II secretion system protein E  32.22 
 
 
544 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444946  decreased coverage  0.00648046 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2722  type II secretion system protein E  27.71 
 
 
502 aa  156  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0772  type II/IV secretion system protein  30.86 
 
 
538 aa  152  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182118  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1514  type II secretion system protein E  27.39 
 
 
543 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59290  type IV B pilus protein  27.76 
 
 
526 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00365421  hitchhiker  0.000000107919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4474  hypothetical protein  28.67 
 
 
513 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  26.33 
 
 
563 aa  143  9e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3385  type II secretion system protein E  28.76 
 
 
693 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1867  type II secretion system protein E  28.76 
 
 
693 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.383587  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1607  type II/IV secretion system protein  30.17 
 
 
536 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0464448  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0063  putative type IV secretion system protein PilQ  30.77 
 
 
510 aa  140  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0661  type II/IV secretion system protein  30.17 
 
 
536 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.368751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1982  type II/IV secretion system protein  30.17 
 
 
536 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2170  type IV pilus protein PilQ  30.17 
 
 
536 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284038  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2254  type IV pilus protein PilQ  30.02 
 
 
536 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0653  type II/IV secretion system protein  30.5 
 
 
536 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5877  type II secretion system protein E  29.56 
 
 
506 aa  135  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  33.76 
 
 
541 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  28.06 
 
 
841 aa  133  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5660  type II secretion system protein E  29.33 
 
 
594 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472724  normal  0.0115974 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  28.57 
 
 
554 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  30.49 
 
 
494 aa  130  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  30.77 
 
 
494 aa  130  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  29.06 
 
 
569 aa  130  8.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  30.34 
 
 
523 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  34.44 
 
 
544 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  29.87 
 
 
559 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  31.87 
 
 
523 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  29.93 
 
 
521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3731  type IV secretion system protein  28.27 
 
 
517 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  30.23 
 
 
521 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2141  type II secretion system protein E  34.33 
 
 
569 aa  128  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000466372  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  30.23 
 
 
521 aa  128  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  31.87 
 
 
521 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  31.87 
 
 
514 aa  127  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  25.67 
 
 
885 aa  127  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  28.48 
 
 
557 aa  127  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  31.87 
 
 
514 aa  127  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  27.06 
 
 
577 aa  127  9e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  31.4 
 
 
521 aa  127  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  31.4 
 
 
521 aa  127  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  30.59 
 
 
502 aa  126  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  31.4 
 
 
521 aa  127  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1102  type II secretion system protein E  33.11 
 
 
477 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00726953  unclonable  0.00000000000588635 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0017  type IV pilus biosynthesis protein PilQ  25.3 
 
 
499 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  31.4 
 
 
521 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  31.32 
 
 
521 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  30.42 
 
 
501 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  30.59 
 
 
502 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  29.92 
 
 
871 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  33.89 
 
 
611 aa  125  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  29.02 
 
 
561 aa  125  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  31.4 
 
 
523 aa  125  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03957  Type II secretory pathway, ATPase PulE-like protein  30.57 
 
 
519 aa  124  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  25.99 
 
 
787 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  28.95 
 
 
587 aa  124  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  32.76 
 
 
500 aa  124  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4246  type II secretion system protein E  25.35 
 
 
596 aa  124  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
563 aa  123  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1278  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  33.33 
 
 
549 aa  123  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  25.89 
 
 
554 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  30.06 
 
 
503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  35.86 
 
 
603 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  27.84 
 
 
561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0378  pili biogenesis ATPase  29.72 
 
 
583 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  26.06 
 
 
573 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  28.68 
 
 
499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  29.66 
 
 
524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  30.11 
 
 
511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  27.55 
 
 
568 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
599 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  34.02 
 
 
490 aa  122  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  25.41 
 
 
558 aa  122  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  31.13 
 
 
520 aa  121  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  25.35 
 
 
567 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3576  hypothetical protein  29.5 
 
 
490 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356057  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  33.85 
 
 
578 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  30.9 
 
 
494 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0910  type II secretion system protein E  30.7 
 
 
561 aa  120  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.661185 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  28.84 
 
 
556 aa  120  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0316  type II secretion system protein E  28.17 
 
 
497 aa  120  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218046  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.71 
 
 
574 aa  120  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  26.28 
 
 
568 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  28.48 
 
 
557 aa  120  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3108  type II secretion system protein E  32.37 
 
 
573 aa  120  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.275217  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  34.83 
 
 
599 aa  120  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  27.92 
 
 
601 aa  120  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5162  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  31.93 
 
 
561 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1005  type II secretion system protein E  35.52 
 
 
503 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.16 
 
 
568 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  28.63 
 
 
568 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  27.23 
 
 
568 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.99 
 
 
568 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  24.86 
 
 
573 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>