267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3928 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  100 
 
 		 345 aa  683    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  91.55 
 
 		 345 aa  624  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  40.11 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  38.15 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1037  general secretion pathway protein E  33.33 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  34.46 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  33.76 
 
 		 391 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2279  general secretion pathway protein E  28.91 
 
 		 378 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000949561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3615  general secretion pathway protein E  30 
 
 		 368 aa  136  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22078  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  38.85 
 
 		 566 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3077  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly  27.04 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0718124  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  38.03 
 
 		 571 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1347  General secretory system II protein E domain protein  38.8 
 
 		 426 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1246  General secretory system II protein E domain protein  39.47 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  40.15 
 
 		 553 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4274  General secretory system II protein E domain protein  34.03 
 
 		 479 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.532323  normal  0.0350224 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  35.51 
 
 		 573 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  35.46 
 
 		 568 aa  93.6  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  35.71 
 
 		 558 aa  92.8  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  35.17 
 
 		 568 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  35.77 
 
 		 554 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.86 
 
 		 568 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.14 
 
 		 568 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.48 
 
 		 568 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.48 
 
 		 568 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 568 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1259  general secretion pathway protein E  39.47 
 
 		 451 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.79 
 
 		 568 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.06 
 
 		 563 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  32.64 
 
 		 564 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.29 
 
 		 568 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.29 
 
 		 568 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  35.04 
 
 		 885 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  37.23 
 
 		 561 aa  87  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.75 
 
 		 568 aa  86.3  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  36.5 
 
 		 564 aa  86.3  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  32.88 
 
 		 567 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  37.32 
 
 		 572 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  35.71 
 
 		 571 aa  83.2  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.78 
 
 		 571 aa  82.8  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  34.31 
 
 		 888 aa  82.4  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  36.5 
 
 		 891 aa  82.4  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  37.41 
 
 		 553 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3335  general secretory system II, protein E-like  34.97 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0137168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3723  General secretory system II protein E domain protein  31.97 
 
 		 866 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3480  General secretory system II protein E domain protein  34.27 
 
 		 181 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  30.5 
 
 		 561 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  34.96 
 
 		 563 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  31.21 
 
 		 562 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  30.29 
 
 		 570 aa  80.5  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  30.43 
 
 		 787 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3416  General secretory system II protein E domain protein  33.57 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  32.37 
 
 		 555 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  28.87 
 
 		 554 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  36.17 
 
 		 559 aa  78.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  32.16 
 
 		 637 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  36.51 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  32.37 
 
 		 553 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  35.04 
 
 		 556 aa  78.2  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  28.42 
 
 		 574 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  31.65 
 
 		 561 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0099  General secretory system II protein E domain protein  31.08 
 
 		 768 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  31.39 
 
 		 558 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  32.17 
 
 		 568 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0066  General secretory system II protein E domain protein  35.59 
 
 		 552 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.364280000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  34.85 
 
 		 578 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0022  General secretory system II protein E domain protein  30.18 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  30.22 
 
 		 573 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  36.84 
 
 		 612 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0083  General secretory system II protein E domain protein  34.75 
 
 		 552 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  34.82 
 
 		 570 aa  73.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  35.04 
 
 		 557 aa  73.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  33.33 
 
 		 587 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  29.92 
 
 		 558 aa  73.6  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  30.5 
 
 		 586 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  32.77 
 
 		 574 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2281  response regulator receiver protein  29.93 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.217898  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  37.6 
 
 		 603 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  32.61 
 
 		 582 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4175  General secretory system II protein E domain protein  34.4 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.417025  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  31.43 
 
 		 569 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  31.62 
 
 		 561 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  33.83 
 
 		 578 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 577 aa  70.5  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  35.34 
 
 		 575 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1942  response regulator receiver protein  29.93 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  32.12 
 
 		 589 aa  70.1  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  31.39 
 
 		 871 aa  69.7  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4032  general secretory system II, protein E-like  33.6 
 
 		 478 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304039  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  30.16 
 
 		 577 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  30.4 
 
 		 570 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  27.78 
 
 		 585 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4148  General secretory system II protein E domain protein  33.6 
 
 		 499 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00811827  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2457  type II secretion system protein E  39.5 
 
 		 623 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  31.88 
 
 		 568 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  29.93 
 
 		 823 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  31.11 
 
 		 557 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  29.93 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  30.7 
 
 		 577 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  30.66 
 
 		 574 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>