12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3331 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3331  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  497  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1011  hypothetical protein  87.95 
 
 		 249 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.823882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2985  hypothetical protein  51.64 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0275079  hitchhiker  0.000737309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2922  hypothetical protein  52.87 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0126105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2573  hypothetical protein  40.77 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  28.04 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  37.36 
 
 		 574 aa  49.7  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  29.22 
 
 		 1141 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2061  hypothetical protein  33.08 
 
 		 356 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0378  pili biogenesis ATPase  35.37 
 
 		 583 aa  45.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  29.46 
 
 		 841 aa  42.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1255  hypothetical protein  32.84 
 
 		 191 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>