27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3835 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3835  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  417  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.916575  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1972  hypothetical protein  55.88 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4788  hypothetical protein  44.44 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.175046  normal  0.341296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3007  hypothetical protein  42.7 
 
 
134 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.117805  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0054  hypothetical protein  51.67 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2605  hypothetical protein  30.97 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.103693 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1225  hypothetical protein  40 
 
 
176 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1255  hypothetical protein  40 
 
 
191 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  44.44 
 
 
554 aa  51.6  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  45.28 
 
 
561 aa  49.7  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4551  hypothetical protein  50 
 
 
188 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  44.19 
 
 
559 aa  47  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2860  type II secretion system protein E  39.22 
 
 
491 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.898794  normal  0.474728 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2855  type II secretion system protein E  50 
 
 
490 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.370108  normal  0.352738 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
624 aa  45.1  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3960  hypothetical protein  31.13 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1172  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  45.45 
 
 
247 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  35.16 
 
 
570 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  36.11 
 
 
553 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2061  hypothetical protein  30.56 
 
 
356 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  41.07 
 
 
560 aa  43.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0972  type II secretion system protein E  40 
 
 
528 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  35.62 
 
 
575 aa  42.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  37.04 
 
 
566 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  34.48 
 
 
573 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  40.38 
 
 
582 aa  41.6  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  41.82 
 
 
561 aa  41.2  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>