228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3673 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 
2170 aa  4315    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  48.96 
 
 
1656 aa  697    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4606  hypothetical protein  38.79 
 
 
1574 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4492  hypothetical protein  38.02 
 
 
1853 aa  420  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.664727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4124  hypothetical protein  38.02 
 
 
1853 aa  421  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.888798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1231  NHL repeat-containing protein  31.96 
 
 
1049 aa  260  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.001634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.91 
 
 
6885 aa  196  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  31.34 
 
 
1462 aa  185  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  31.71 
 
 
1221 aa  166  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  53.67 
 
 
743 aa  152  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  34.64 
 
 
680 aa  150  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  38.21 
 
 
1887 aa  140  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  43.89 
 
 
455 aa  133  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  43.89 
 
 
455 aa  133  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  46.33 
 
 
973 aa  133  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  42.7 
 
 
455 aa  129  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  33.1 
 
 
455 aa  129  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  41.67 
 
 
455 aa  128  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  41.2 
 
 
662 aa  128  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  41.67 
 
 
455 aa  127  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  42.7 
 
 
455 aa  127  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  38.1 
 
 
459 aa  127  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  41.67 
 
 
455 aa  126  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  42.22 
 
 
455 aa  126  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  35.63 
 
 
455 aa  125  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  41.11 
 
 
455 aa  124  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  40.45 
 
 
456 aa  122  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  39.06 
 
 
458 aa  121  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.4 
 
 
809 aa  119  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  40.41 
 
 
458 aa  118  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  32.07 
 
 
1762 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  38.31 
 
 
456 aa  116  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.01 
 
 
1448 aa  112  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.93 
 
 
729 aa  109  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  31.72 
 
 
1628 aa  109  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  27.99 
 
 
2706 aa  108  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  31.57 
 
 
1004 aa  108  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  38.51 
 
 
464 aa  103  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  37.93 
 
 
465 aa  101  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  42.41 
 
 
1170 aa  100  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  29.72 
 
 
803 aa  100  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  32.18 
 
 
480 aa  97.8  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  30.62 
 
 
667 aa  96.7  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  42.35 
 
 
768 aa  94  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  36.6 
 
 
561 aa  93.2  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  37.22 
 
 
3802 aa  93.2  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  43.1 
 
 
648 aa  92  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_011654  BCAH187_D0017  fibronectin type III domain protein  26.67 
 
 
481 aa  92  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  35.75 
 
 
749 aa  90.5  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  35.71 
 
 
524 aa  90.1  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  35.08 
 
 
660 aa  90.1  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  34.69 
 
 
1667 aa  89.7  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  35.67 
 
 
970 aa  89.7  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  30.8 
 
 
2286 aa  89.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  35.58 
 
 
1461 aa  89.7  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 
787 aa  89.4  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  35.16 
 
 
762 aa  89.4  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  33.85 
 
 
598 aa  87.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  34.52 
 
 
445 aa  86.3  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  40.21 
 
 
1050 aa  86.3  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  31.4 
 
 
1238 aa  85.9  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  30.63 
 
 
836 aa  85.9  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  38.5 
 
 
854 aa  85.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  35.54 
 
 
1171 aa  84.7  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  36.92 
 
 
2334 aa  84  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  26.17 
 
 
903 aa  84  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  38.42 
 
 
997 aa  83.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  29.5 
 
 
1193 aa  82.8  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  34.22 
 
 
539 aa  82.4  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  51.81 
 
 
1209 aa  81.3  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  51.81 
 
 
1137 aa  80.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  37.97 
 
 
1175 aa  81.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  31.49 
 
 
841 aa  80.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  53.01 
 
 
1121 aa  80.5  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  57.14 
 
 
649 aa  80.1  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  28.57 
 
 
1880 aa  80.1  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4034  fibronectin type III domain-containing protein  26 
 
 
454 aa  79.3  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  40.58 
 
 
614 aa  79  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  55.91 
 
 
655 aa  78.2  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  34.93 
 
 
448 aa  77.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.45 
 
 
998 aa  77.4  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.08 
 
 
795 aa  77.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  54.55 
 
 
608 aa  76.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  41.94 
 
 
674 aa  76.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  50 
 
 
1139 aa  75.9  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  34.2 
 
 
1160 aa  75.9  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  34.65 
 
 
703 aa  75.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  45.61 
 
 
900 aa  74.7  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  50 
 
 
460 aa  74.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  38.15 
 
 
1154 aa  73.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  40.65 
 
 
674 aa  74.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  35.91 
 
 
938 aa  73.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  40.87 
 
 
847 aa  72.8  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  39.52 
 
 
674 aa  72.8  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  50.6 
 
 
1298 aa  71.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  31.41 
 
 
1141 aa  70.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  35.52 
 
 
658 aa  70.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  33.9 
 
 
680 aa  70.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  45.36 
 
 
523 aa  70.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 
916 aa  70.5  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>