157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3022 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3019  hypothetical protein  66.34 
 
 		 861 aa  1168    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  100 
 
 		 3586 aa  7256    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  28.96 
 
 		 1951 aa  185  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  32.03 
 
 		 3925 aa  176  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  32.27 
 
 		 3562 aa  163  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  33.6 
 
 		 913 aa  149  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  28.69 
 
 		 3325 aa  143  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3017  hypothetical protein  63.21 
 
 		 110 aa  142  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  27.42 
 
 		 3739 aa  142  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  27.7 
 
 		 3824 aa  140  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  27.5 
 
 		 3824 aa  139  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  27.36 
 
 		 3721 aa  139  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  31.61 
 
 		 2704 aa  134  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  27.5 
 
 		 3824 aa  133  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  29.72 
 
 		 4106 aa  131  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  29.07 
 
 		 2927 aa  131  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  25.65 
 
 		 2552 aa  130  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  29.27 
 
 		 2625 aa  127  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  29.66 
 
 		 1219 aa  120  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  33.11 
 
 		 2528 aa  118  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  29.14 
 
 		 2456 aa  115  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  27.1 
 
 		 1332 aa  115  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  27.82 
 
 		 5743 aa  114  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.53 
 
 		 3552 aa  113  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  30.98 
 
 		 898 aa  109  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  26.64 
 
 		 6109 aa  107  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4062  hypothetical protein  33.21 
 
 		 711 aa  106  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  31.16 
 
 		 3204 aa  100  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  30.18 
 
 		 2911 aa  99.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  27.17 
 
 		 4430 aa  98.6  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  36 
 
 		 1804 aa  97.8  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1902 aa  97.1  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  33.08 
 
 		 888 aa  96.3  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  28.85 
 
 		 1096 aa  93.6  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  30.32 
 
 		 549 aa  93.2  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  30.1 
 
 		 916 aa  92.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1278 aa  92  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  34.29 
 
 		 906 aa  91.3  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  36.32 
 
 		 2042 aa  90.9  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  32.2 
 
 		 899 aa  90.5  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  28.81 
 
 		 4689 aa  90.5  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  26.18 
 
 		 2350 aa  90.5  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.19 
 
 		 1919 aa  90.1  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  27.09 
 
 		 744 aa  88.6  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  29.14 
 
 		 937 aa  88.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  33.46 
 
 		 777 aa  87  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1457 aa  86.7  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  28.57 
 
 		 3314 aa  84.3  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  28.84 
 
 		 2117 aa  84  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1585 aa  83.6  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  26.28 
 
 		 1461 aa  83.6  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  23.11 
 
 		 1224 aa  82  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  26.01 
 
 		 4874 aa  82  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.79 
 
 		 5216 aa  80.1  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  25.57 
 
 		 5561 aa  79.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  25.67 
 
 		 5561 aa  79.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  28.08 
 
 		 3736 aa  79.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  24.79 
 
 		 1695 aa  78.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  26.13 
 
 		 5559 aa  78.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  27.27 
 
 		 3734 aa  77  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1588 aa  77.4  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.25 
 
 		 4480 aa  76.3  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  25.61 
 
 		 5559 aa  76.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  30 
 
 		 1792 aa  75.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  25.06 
 
 		 5561 aa  74.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  37.84 
 
 		 635 aa  73.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0418  hypothetical protein  30.77 
 
 		 670 aa  73.6  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  29.22 
 
 		 1152 aa  73.2  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  27.96 
 
 		 5080 aa  73.2  0.00000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  22.86 
 
 		 1570 aa  71.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  25.71 
 
 		 6662 aa  71.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  25.67 
 
 		 6779 aa  70.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  27.98 
 
 		 2839 aa  70.9  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.57 
 
 		 6683 aa  70.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  31.08 
 
 		 739 aa  69.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1657 aa  69.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  23.28 
 
 		 1570 aa  68.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  34.18 
 
 		 499 aa  66.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  29 
 
 		 5451 aa  65.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  30.66 
 
 		 1047 aa  63.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  27.03 
 
 		 3923 aa  63.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  32.11 
 
 		 1141 aa  63.5  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  30.84 
 
 		 1222 aa  62.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  35.14 
 
 		 1621 aa  62  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1618  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  32.63 
 
 		 1710 aa  61.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  27.59 
 
 		 675 aa  61.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  29.83 
 
 		 1787 aa  61.2  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  25.24 
 
 		 7149 aa  60.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  29.73 
 
 		 827 aa  60.5  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  27.99 
 
 		 6310 aa  60.1  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  32.49 
 
 		 696 aa  60.5  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  29.29 
 
 		 4761 aa  59.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  31.94 
 
 		 8064 aa  59.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1796  Fibronectin type III domain protein  32.64 
 
 		 694 aa  58.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303311  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2046  tryptophan synthase, beta chain  25.86 
 
 		 1369 aa  58.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1061 aa  58.2  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  26.52 
 
 		 1424 aa  58.2  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1068  hypothetical protein  33.33 
 
 		 500 aa  57.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  29.22 
 
 		 2802 aa  57.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  28.27 
 
 		 895 aa  57.4  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>