92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2912 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  84.4 
 
 		 1588 aa  2544    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  100 
 
 		 1585 aa  3169    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  35.31 
 
 		 2192 aa  245  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  36.56 
 
 		 2042 aa  244  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  28.39 
 
 		 1991 aa  204  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1804 aa  193  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  34.21 
 
 		 2042 aa  183  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  41.9 
 
 		 1439 aa  181  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  30.4 
 
 		 3563 aa  176  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  39.53 
 
 		 777 aa  166  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  33.52 
 
 		 1902 aa  158  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  38.22 
 
 		 2528 aa  155  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  38.22 
 
 		 1951 aa  153  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  37.21 
 
 		 916 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  37.31 
 
 		 549 aa  144  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.94 
 
 		 1183 aa  141  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1280 aa  134  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  37.02 
 
 		 898 aa  133  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  25.14 
 
 		 913 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1027 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  30.47 
 
 		 899 aa  116  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  33.58 
 
 		 1526 aa  105  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  30.26 
 
 		 888 aa  100  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  35.15 
 
 		 937 aa  98.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  35.78 
 
 		 1275 aa  89.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  26.77 
 
 		 3586 aa  86.7  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  40.71 
 
 		 1241 aa  80.5  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  36.36 
 
 		 1848 aa  76.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  47.14 
 
 		 906 aa  74.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0361  hypothetical protein  22.6 
 
 		 857 aa  71.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.687552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  32.28 
 
 		 2927 aa  71.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  24.18 
 
 		 8871 aa  68.6  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.06 
 
 		 4500 aa  68.6  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  30 
 
 		 3544 aa  67  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1100 aa  66.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1796  Fibronectin type III domain protein  46.38 
 
 		 694 aa  65.9  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303311  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  28.03 
 
 		 858 aa  65.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  23.11 
 
 		 1047 aa  62.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.05 
 
 		 2807 aa  62.4  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  33.91 
 
 		 2117 aa  62  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  29.93 
 
 		 889 aa  62  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  45.71 
 
 		 983 aa  61.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  27.24 
 
 		 2522 aa  61.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1176 aa  61.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  25.11 
 
 		 2198 aa  61.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  27.86 
 
 		 665 aa  60.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  27.56 
 
 		 740 aa  60.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  29.5 
 
 		 2503 aa  60.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  24.2 
 
 		 1176 aa  59.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.63 
 
 		 3699 aa  59.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  27.04 
 
 		 2467 aa  59.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  28.24 
 
 		 482 aa  59.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  29.5 
 
 		 3699 aa  59.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  23.67 
 
 		 1332 aa  58.2  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5988  hypothetical protein  34.72 
 
 		 381 aa  57  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 1565 aa  57  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1583  cytochrome c, class I  36.14 
 
 		 475 aa  56.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000740916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1784  hypothetical protein  26.44 
 
 		 523 aa  55.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  34.12 
 
 		 3925 aa  55.5  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  24.81 
 
 		 696 aa  55.5  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  28.66 
 
 		 943 aa  55.5  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  31.39 
 
 		 3089 aa  54.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4062  hypothetical protein  35.86 
 
 		 711 aa  55.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  28.69 
 
 		 2476 aa  54.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  24.83 
 
 		 901 aa  51.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  28.57 
 
 		 864 aa  52  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  30.57 
 
 		 4874 aa  50.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  30.12 
 
 		 6109 aa  50.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  27.6 
 
 		 1009 aa  50.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2365  hypothetical protein  26.68 
 
 		 888 aa  50.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  29.8 
 
 		 1461 aa  50.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1933 aa  50.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  33.85 
 
 		 2716 aa  49.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  34.48 
 
 		 2296 aa  49.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  27.88 
 
 		 2636 aa  48.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1259  hypothetical protein  29.74 
 
 		 734 aa  48.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  28.43 
 
 		 739 aa  48.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5021  hypothetical protein  26.76 
 
 		 569 aa  48.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196755  normal  0.0476496 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  25.69 
 
 		 2350 aa  48.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  29.51 
 
 		 1916 aa  48.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1452 aa  48.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5022  hypothetical protein  31.28 
 
 		 425 aa  48.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  24.4 
 
 		 491 aa  47.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  48.28 
 
 		 1911 aa  47  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2802  hypothetical protein  32.49 
 
 		 841 aa  46.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5293  cytochrome c class I  40 
 
 		 426 aa  46.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  30.63 
 
 		 4689 aa  46.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  32.58 
 
 		 1391 aa  45.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  23.62 
 
 		 1532 aa  45.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  30 
 
 		 429 aa  45.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  27.78 
 
 		 2066 aa  45.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  23.21 
 
 		 1656 aa  45.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>