299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1039 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  70.18 
 
 
2296 aa  977    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
2927 aa  5540    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  36.87 
 
 
4430 aa  446  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  36.7 
 
 
4106 aa  443  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  35.97 
 
 
3325 aa  423  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  38.13 
 
 
3204 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  36.15 
 
 
3562 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  36.68 
 
 
2911 aa  386  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  38.65 
 
 
2704 aa  360  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  36.8 
 
 
2456 aa  357  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  32.83 
 
 
3824 aa  333  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  33.6 
 
 
2625 aa  331  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  33 
 
 
3739 aa  331  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  32.58 
 
 
3824 aa  328  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  32.81 
 
 
3824 aa  327  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  33.11 
 
 
3721 aa  318  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.91 
 
 
3552 aa  308  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  29.08 
 
 
4480 aa  281  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  43.15 
 
 
3227 aa  276  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  32.34 
 
 
5561 aa  271  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  32.27 
 
 
5561 aa  270  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  32.17 
 
 
5561 aa  270  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  32.17 
 
 
5559 aa  269  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  32.08 
 
 
5559 aa  268  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  33.2 
 
 
1526 aa  261  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  43.31 
 
 
1278 aa  249  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  31.44 
 
 
3516 aa  246  6e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  40.23 
 
 
2716 aa  237  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  47.93 
 
 
4697 aa  220  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  43.67 
 
 
3089 aa  207  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  80.53 
 
 
1066 aa  205  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  26.76 
 
 
5080 aa  199  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  32.92 
 
 
3314 aa  197  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.06 
 
 
6683 aa  197  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  32.06 
 
 
6779 aa  196  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  30.13 
 
 
5451 aa  194  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  30.69 
 
 
6310 aa  194  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  30.89 
 
 
6662 aa  190  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  29.53 
 
 
8064 aa  188  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  50.22 
 
 
3699 aa  182  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  50.22 
 
 
3699 aa  178  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  50.22 
 
 
2503 aa  177  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  27.68 
 
 
3923 aa  172  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  66.23 
 
 
3544 aa  171  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
5216 aa  158  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.06 
 
 
2744 aa  149  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  28.95 
 
 
4830 aa  145  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  29.46 
 
 
3864 aa  139  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  31.82 
 
 
1461 aa  139  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  35.66 
 
 
1275 aa  123  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  28.94 
 
 
3586 aa  119  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  28.71 
 
 
7149 aa  119  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.83 
 
 
4855 aa  117  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.73 
 
 
3589 aa  115  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  31.87 
 
 
1994 aa  115  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  28.39 
 
 
3736 aa  114  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  29.63 
 
 
2271 aa  111  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  31.82 
 
 
3920 aa  110  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.35 
 
 
4500 aa  109  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  33.47 
 
 
6715 aa  108  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  36.83 
 
 
635 aa  106  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  32.03 
 
 
1371 aa  106  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  27.9 
 
 
4874 aa  105  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1799  hypothetical protein  37.99 
 
 
562 aa  105  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  30.38 
 
 
2421 aa  104  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  30.8 
 
 
2454 aa  103  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  30.49 
 
 
2367 aa  103  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  30.49 
 
 
2411 aa  103  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  36.41 
 
 
2064 aa  102  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  30.8 
 
 
2807 aa  102  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  34.52 
 
 
1439 aa  101  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  30.86 
 
 
4791 aa  100  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  35.16 
 
 
3066 aa  100  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  28.61 
 
 
7434 aa  100  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  32.85 
 
 
2772 aa  96.3  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  31.44 
 
 
5442 aa  96.3  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  36.02 
 
 
750 aa  95.9  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.81 
 
 
1586 aa  94.7  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  30.37 
 
 
3193 aa  93.2  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  40.38 
 
 
4896 aa  92.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3383  conserved repeat domain protein  29.47 
 
 
888 aa  91.3  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466034  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  33.02 
 
 
1526 aa  91.3  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  27.56 
 
 
1389 aa  90.5  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  28.72 
 
 
1059 aa  90.9  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  28.99 
 
 
1699 aa  89.7  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  40.35 
 
 
3737 aa  89.7  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  26.84 
 
 
3734 aa  89.4  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  33.12 
 
 
6497 aa  89  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  33.08 
 
 
1219 aa  88.6  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  55.86 
 
 
2042 aa  88.6  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  43.02 
 
 
3602 aa  88.6  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  28.79 
 
 
2839 aa  88.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.86 
 
 
5839 aa  88.2  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.51 
 
 
5613 aa  85.9  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  31.8 
 
 
1092 aa  85.5  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  42 
 
 
1064 aa  84.7  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  29.91 
 
 
792 aa  84.7  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  32.44 
 
 
1529 aa  83.2  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  30.99 
 
 
822 aa  82.8  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  30.73 
 
 
1162 aa  82  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>