168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3865 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  100 
 
 		 822 aa  1676    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  41 
 
 		 794 aa  594  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  36.97 
 
 		 799 aa  466  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  33.93 
 
 		 792 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  32.88 
 
 		 636 aa  242  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1078  hypothetical protein  39.87 
 
 		 735 aa  218  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0714016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  38.59 
 
 		 751 aa  207  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  37.24 
 
 		 637 aa  206  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  35.18 
 
 		 1162 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  29.46 
 
 		 1371 aa  140  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  29.85 
 
 		 1389 aa  132  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1059 aa  124  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  29.69 
 
 		 615 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  25.82 
 
 		 2807 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  25.63 
 
 		 2454 aa  114  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  26.39 
 
 		 2421 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  25.72 
 
 		 2411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  25.53 
 
 		 2367 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  27.84 
 
 		 815 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  23.61 
 
 		 886 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  27.68 
 
 		 627 aa  109  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  31.15 
 
 		 1657 aa  107  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  27.42 
 
 		 561 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  28.79 
 
 		 3793 aa  105  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  38.55 
 
 		 1259 aa  104  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  27.18 
 
 		 1620 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  29.25 
 
 		 3227 aa  95.5  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  25.93 
 
 		 2713 aa  95.9  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1064 aa  94.7  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  27.71 
 
 		 1222 aa  92.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  31.15 
 
 		 991 aa  91.7  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  26.71 
 
 		 1602 aa  91.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  24.56 
 
 		 642 aa  90.9  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1547 aa  90.5  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  27.21 
 
 		 1466 aa  89.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  32.5 
 
 		 2772 aa  87  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  26.6 
 
 		 1288 aa  86.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1245 aa  85.5  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  34.07 
 
 		 750 aa  85.5  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1287 aa  85.5  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1329 aa  84.7  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  32.42 
 
 		 2064 aa  84.3  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  26.73 
 
 		 1266 aa  84.3  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  28.42 
 
 		 963 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  25.79 
 
 		 885 aa  82.4  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1163 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  26.28 
 
 		 969 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  36.04 
 
 		 726 aa  79.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1313 aa  78.6  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  43.96 
 
 		 4896 aa  77.8  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  26.49 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  32.3 
 
 		 1526 aa  76.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  29.17 
 
 		 2980 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0981  hypothetical protein  27.16 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1488 aa  74.7  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  40.96 
 
 		 1139 aa  74.7  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  28.85 
 
 		 925 aa  74.3  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  32.77 
 
 		 1140 aa  73.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  24.71 
 
 		 1606 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  29.31 
 
 		 2296 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  30.99 
 
 		 2927 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  36.47 
 
 		 1193 aa  73.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  26.61 
 
 		 652 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  37.82 
 
 		 3602 aa  72  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  37.21 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  36.94 
 
 		 1066 aa  71.6  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  30.19 
 
 		 650 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  35.9 
 
 		 815 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  26.48 
 
 		 1483 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  25.88 
 
 		 1247 aa  69.3  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  23.53 
 
 		 1345 aa  68.6  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  34.78 
 
 		 1295 aa  67.8  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  24.06 
 
 		 890 aa  67.8  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  32.17 
 
 		 662 aa  67.8  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  33.68 
 
 		 6497 aa  67.4  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  34.26 
 
 		 599 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  31.03 
 
 		 1230 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  41.57 
 
 		 2588 aa  67  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  39.56 
 
 		 2377 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  27.02 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  28.84 
 
 		 1414 aa  65.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  33.68 
 
 		 2005 aa  65.5  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  29.6 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  29.78 
 
 		 2270 aa  65.1  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  34.34 
 
 		 3927 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  27.5 
 
 		 1750 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  35.96 
 
 		 3958 aa  64.7  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  24.91 
 
 		 3542 aa  64.7  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  28.26 
 
 		 938 aa  64.3  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  31.4 
 
 		 535 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  30.81 
 
 		 1108 aa  63.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  37.61 
 
 		 2267 aa  63.9  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  37.89 
 
 		 871 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  27.13 
 
 		 968 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  25.83 
 
 		 4071 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  25.35 
 
 		 2833 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  41.98 
 
 		 711 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  28.75 
 
 		 598 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  41.11 
 
 		 694 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  39.02 
 
 		 3737 aa  62  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>