49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2847 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  67.03 
 
 		 4480 aa  1317    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  100 
 
 		 1699 aa  3250    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  37.12 
 
 		 2193 aa  578  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  37.86 
 
 		 2886 aa  448  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  37.04 
 
 		 4830 aa  335  5e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  37.04 
 
 		 3864 aa  333  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  36.56 
 
 		 7434 aa  327  9e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  34.51 
 
 		 5442 aa  327  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.27 
 
 		 2156 aa  261  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  40.59 
 
 		 1902 aa  252  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  33.18 
 
 		 3066 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  30.33 
 
 		 2194 aa  236  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  35.67 
 
 		 1359 aa  222  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  56.36 
 
 		 1092 aa  201  7.999999999999999e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  34.2 
 
 		 1196 aa  159  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0783  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.63 
 
 		 3323 aa  144  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  28.84 
 
 		 3227 aa  142  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  44.31 
 
 		 2839 aa  135  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  29.92 
 
 		 918 aa  129  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  28.27 
 
 		 4697 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  33.18 
 
 		 2768 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  36.86 
 
 		 1526 aa  112  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  30.82 
 
 		 2233 aa  105  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  35.5 
 
 		 860 aa  103  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  41.84 
 
 		 1151 aa  102  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  25.04 
 
 		 3340 aa  96.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  33.43 
 
 		 873 aa  89  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  36.51 
 
 		 852 aa  88.6  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  29.09 
 
 		 2927 aa  87.8  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  32.52 
 
 		 781 aa  88.6  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl444  membrane-associated lipoprotein  29.6 
 
 		 1476 aa  87.8  0.000000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0514731  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  29.52 
 
 		 819 aa  87.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  31.04 
 
 		 954 aa  86.7  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  43 
 
 		 1827 aa  84.7  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  33.56 
 
 		 756 aa  81.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  30.23 
 
 		 790 aa  80.5  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  31.34 
 
 		 768 aa  77  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  30.87 
 
 		 763 aa  75.5  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  28.96 
 
 		 889 aa  73.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  30.36 
 
 		 846 aa  72.4  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  41.44 
 
 		 3562 aa  71.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  29.67 
 
 		 777 aa  66.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  26.35 
 
 		 2456 aa  63.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  29.55 
 
 		 768 aa  59.3  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  30.52 
 
 		 770 aa  58.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  34.3 
 
 		 764 aa  58.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  26.87 
 
 		 2625 aa  56.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  31.94 
 
 		 2802 aa  52.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3429  hypothetical protein  33.77 
 
 		 397 aa  51.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0691884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>