33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0783 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0783  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 
3323 aa  6538    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  35.76 
 
 
3736 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  35.51 
 
 
3734 aa  370  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  30.43 
 
 
1526 aa  172  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  34.9 
 
 
1699 aa  150  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  29.17 
 
 
2193 aa  144  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  26.71 
 
 
5561 aa  120  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  26.6 
 
 
5559 aa  119  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  26.6 
 
 
5559 aa  119  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  26.3 
 
 
5561 aa  117  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  26.3 
 
 
5561 aa  116  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  29.15 
 
 
4430 aa  116  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  31.47 
 
 
2802 aa  104  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  32.01 
 
 
3314 aa  90.9  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  26.95 
 
 
3204 aa  84.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  23.85 
 
 
2552 aa  78.2  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.04 
 
 
4480 aa  64.7  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  31.63 
 
 
1827 aa  64.3  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  27.94 
 
 
2927 aa  63.2  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  29.2 
 
 
3391 aa  62.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0902  hypothetical protein  24.75 
 
 
545 aa  57.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.440975  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  32.35 
 
 
1092 aa  55.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.31 
 
 
1143 aa  55.5  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  25.16 
 
 
6276 aa  55.5  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  27.34 
 
 
2911 aa  53.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.54 
 
 
5216 aa  52.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  26.48 
 
 
7149 aa  48.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  23.77 
 
 
1764 aa  48.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  33.68 
 
 
492 aa  48.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  27.44 
 
 
6779 aa  47.8  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  27.21 
 
 
6662 aa  47.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.36 
 
 
6683 aa  47  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  26.55 
 
 
3325 aa  46.6  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>