111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6371 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  100 
 
 		 3736 aa  7178    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  30.67 
 
 		 4430 aa  897    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  89.37 
 
 		 3734 aa  6450    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  27.65 
 
 		 5561 aa  562  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  27.76 
 
 		 5561 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  27.62 
 
 		 5559 aa  550  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  27.59 
 
 		 5559 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  27.62 
 
 		 5561 aa  542  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  56.7 
 
 		 4120 aa  519  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  55.32 
 
 		 3439 aa  474  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0783  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.58 
 
 		 3323 aa  390  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.69 
 
 		 6683 aa  232  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  26.68 
 
 		 6662 aa  232  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  27.79 
 
 		 3325 aa  231  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  26.74 
 
 		 6779 aa  229  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  29.57 
 
 		 2704 aa  229  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.78 
 
 		 4106 aa  214  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  28.17 
 
 		 3204 aa  182  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  29.46 
 
 		 2911 aa  166  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  28.91 
 
 		 2802 aa  155  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  27.63 
 
 		 3824 aa  155  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  27.64 
 
 		 3824 aa  150  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  26.97 
 
 		 3562 aa  141  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  27.24 
 
 		 3824 aa  136  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  26.48 
 
 		 7149 aa  136  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  26.26 
 
 		 3739 aa  134  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  45.85 
 
 		 1526 aa  127  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  26.21 
 
 		 2552 aa  120  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  26.92 
 
 		 4791 aa  119  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  28.42 
 
 		 2927 aa  116  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  27.59 
 
 		 3721 aa  113  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.74 
 
 		 5216 aa  109  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.07 
 
 		 2812 aa  107  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.75 
 
 		 3552 aa  100  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  30.77 
 
 		 4480 aa  97.1  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2987  Fibronectin type III domain protein  27.27 
 
 		 1301 aa  94.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0839301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  28.96 
 
 		 3699 aa  93.6  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  26.17 
 
 		 8064 aa  93.2  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  30.78 
 
 		 3314 aa  93.2  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.86 
 
 		 5839 aa  85.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  24.8 
 
 		 1951 aa  84  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  39.88 
 
 		 1206 aa  83.2  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.8 
 
 		 3699 aa  82.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  25.53 
 
 		 6310 aa  79  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  28.07 
 
 		 898 aa  75.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  27.4 
 
 		 2670 aa  74.3  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  30.22 
 
 		 3391 aa  73.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  27.95 
 
 		 3586 aa  72.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  27.6 
 
 		 5442 aa  67.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  26 
 
 		 5451 aa  67  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  25.46 
 
 		 5743 aa  66.6  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  26.74 
 
 		 913 aa  66.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  25.61 
 
 		 653 aa  65.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  35.71 
 
 		 1827 aa  65.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  29.47 
 
 		 2839 aa  64.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  30.7 
 
 		 5171 aa  64.3  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  25.74 
 
 		 937 aa  63.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  29.47 
 
 		 1428 aa  61.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  28.97 
 
 		 899 aa  60.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1538 aa  60.8  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0729  hemolysin-type calcium-binding region  50.67 
 
 		 7072 aa  59.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.971517 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2545  hemolysin-type calcium-binding region  50.67 
 
 		 4451 aa  59.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  26.58 
 
 		 2625 aa  59.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  24.96 
 
 		 1219 aa  59.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  25.78 
 
 		 2042 aa  58.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  28.72 
 
 		 1141 aa  58.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  27.43 
 
 		 1424 aa  58.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  49.38 
 
 		 1792 aa  58.2  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0957  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 716 aa  57.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0225193  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  26.64 
 
 		 2768 aa  57  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1354  hypothetical protein  38.38 
 
 		 359 aa  56.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  27.74 
 
 		 1096 aa  56.6  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  28.8 
 
 		 549 aa  56.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  38.46 
 
 		 313 aa  55.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1061 aa  54.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  28.59 
 
 		 916 aa  54.7  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.15 
 
 		 1143 aa  54.3  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  37.36 
 
 		 313 aa  54.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  28.39 
 
 		 1278 aa  53.5  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  28.89 
 
 		 1332 aa  53.1  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  25.51 
 
 		 3923 aa  53.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  33.96 
 
 		 686 aa  52.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  41.67 
 
 		 8682 aa  52.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  35.82 
 
 		 1390 aa  52  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2709  BNR domain-containing protein  21.65 
 
 		 1554 aa  51.6  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  35.79 
 
 		 460 aa  51.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  38.46 
 
 		 757 aa  51.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  26.74 
 
 		 2456 aa  51.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  28.24 
 
 		 1806 aa  50.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  40.83 
 
 		 9030 aa  50.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.79 
 
 		 2668 aa  50.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.28 
 
 		 4836 aa  50.1  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  32.28 
 
 		 2039 aa  49.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.58 
 
 		 980 aa  48.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  26.74 
 
 		 1461 aa  48.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  36.19 
 
 		 510 aa  48.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  33.02 
 
 		 615 aa  48.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  29.03 
 
 		 2117 aa  47.8  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.26 
 
 		 2667 aa  47.8  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  29.26 
 
 		 2145 aa  47.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>