170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2201 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  100 
 
 
2911 aa  5702    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  93.42 
 
 
3204 aa  4763    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  34.42 
 
 
4106 aa  482  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  33.53 
 
 
3562 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  32.63 
 
 
3325 aa  422  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  29.66 
 
 
3824 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  29.51 
 
 
3824 aa  410  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.39 
 
 
3552 aa  410  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  29.28 
 
 
3824 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  37.06 
 
 
2927 aa  397  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  30.93 
 
 
3739 aa  390  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  30.71 
 
 
3721 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  28.99 
 
 
5559 aa  354  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  29.05 
 
 
5559 aa  354  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  29.02 
 
 
5561 aa  354  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  28.9 
 
 
5561 aa  352  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  28.76 
 
 
5561 aa  350  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  31.6 
 
 
2704 aa  338  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  31.73 
 
 
4430 aa  331  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  30.54 
 
 
2625 aa  310  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  31.42 
 
 
2456 aa  302  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  29.6 
 
 
3516 aa  260  3e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  25.81 
 
 
5080 aa  230  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  29.41 
 
 
6662 aa  229  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.24 
 
 
6683 aa  229  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  29.29 
 
 
6779 aa  226  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.84 
 
 
4480 aa  206  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  36.63 
 
 
1278 aa  191  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  28.65 
 
 
3736 aa  180  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  27.44 
 
 
7149 aa  175  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  26.87 
 
 
3734 aa  162  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.59 
 
 
3314 aa  134  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  28.67 
 
 
4689 aa  127  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.81 
 
 
5216 aa  116  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.78 
 
 
5839 aa  112  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  26.67 
 
 
6310 aa  109  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  26.93 
 
 
5451 aa  108  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  33.49 
 
 
2839 aa  104  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  27.77 
 
 
4791 aa  105  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  26.97 
 
 
8064 aa  103  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  27.98 
 
 
3923 aa  97.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  30.02 
 
 
3586 aa  96.7  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  25.98 
 
 
5442 aa  95.1  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  26.35 
 
 
4874 aa  94.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.63 
 
 
1586 aa  86.3  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  33.68 
 
 
635 aa  83.2  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  28.01 
 
 
1461 aa  81.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.75 
 
 
2507 aa  80.5  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  29.83 
 
 
2802 aa  79.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.21 
 
 
2812 aa  79  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2271  Hemolysin-type calcium-binding region  29.49 
 
 
272 aa  77.8  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.820331  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  33.02 
 
 
1597 aa  77.4  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  29.47 
 
 
1219 aa  76.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  28.76 
 
 
6715 aa  75.9  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3150  hypothetical protein  34.5 
 
 
959 aa  75.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  31.08 
 
 
606 aa  74.3  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  30.82 
 
 
1529 aa  70.9  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  29.69 
 
 
3758 aa  70.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  33.43 
 
 
3391 aa  68.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  25.84 
 
 
2768 aa  66.2  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  35 
 
 
739 aa  65.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  36.75 
 
 
1869 aa  65.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  32.31 
 
 
1526 aa  65.1  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.67 
 
 
5098 aa  62.4  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  38.12 
 
 
747 aa  61.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0783  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.21 
 
 
3323 aa  60.1  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  24.6 
 
 
1695 aa  59.7  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  27.88 
 
 
500 aa  57.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  26.46 
 
 
5444 aa  57  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.9 
 
 
1919 aa  56.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  28.63 
 
 
1792 aa  55.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  26.17 
 
 
499 aa  55.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  29.03 
 
 
352 aa  54.3  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  31.2 
 
 
850 aa  53.5  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  41.33 
 
 
1079 aa  53.5  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.71 
 
 
3038 aa  53.5  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  65.22 
 
 
1217 aa  53.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  45.57 
 
 
2537 aa  52.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2987  Fibronectin type III domain protein  26.82 
 
 
1301 aa  52.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0839301 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  32.47 
 
 
1092 aa  52.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  26.07 
 
 
2064 aa  52.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  27.27 
 
 
1096 aa  52.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  23.91 
 
 
5899 aa  51.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  32.95 
 
 
1538 aa  51.6  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  26.38 
 
 
1434 aa  51.6  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0729  hemolysin-type calcium-binding region  36.05 
 
 
7072 aa  52  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.971517 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2545  hemolysin-type calcium-binding region  36.05 
 
 
4451 aa  52  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.15154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  61.9 
 
 
588 aa  50.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  55.81 
 
 
1394 aa  51.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.46 
 
 
11716 aa  51.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1799  hypothetical protein  37.89 
 
 
562 aa  50.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0122  hemolysin-type calcium-binding region  55.56 
 
 
534 aa  50.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589398  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  50 
 
 
942 aa  50.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25 
 
 
3822 aa  50.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  26.46 
 
 
621 aa  50.1  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  26.75 
 
 
2836 aa  50.1  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  60.47 
 
 
448 aa  50.1  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  57.14 
 
 
867 aa  50.1  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0418  hypothetical protein  27.37 
 
 
670 aa  50.1  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  52.38 
 
 
1164 aa  50.1  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>