More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1919 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  100 
 
 
1526 aa  2927    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  46.62 
 
 
2156 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  52.57 
 
 
3066 aa  366  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  32.68 
 
 
7434 aa  282  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  32.73 
 
 
4830 aa  266  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  31.87 
 
 
3864 aa  258  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  34.75 
 
 
1196 aa  244  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  36.14 
 
 
918 aa  243  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  35.84 
 
 
5442 aa  214  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  32.14 
 
 
2768 aa  192  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0783  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.25 
 
 
3323 aa  188  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  34.22 
 
 
954 aa  187  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  35.63 
 
 
860 aa  185  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  32.09 
 
 
3734 aa  174  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  35.14 
 
 
3340 aa  168  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  33.21 
 
 
819 aa  164  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  33.7 
 
 
790 aa  162  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  32.61 
 
 
764 aa  161  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  33.27 
 
 
777 aa  159  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  40 
 
 
3977 aa  158  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  34.24 
 
 
781 aa  158  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  35.08 
 
 
873 aa  155  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  32.79 
 
 
846 aa  154  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  32.55 
 
 
770 aa  151  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  35.4 
 
 
2182 aa  151  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  36.04 
 
 
889 aa  150  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  34.24 
 
 
756 aa  147  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  31.59 
 
 
763 aa  145  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  36.13 
 
 
4697 aa  144  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  32.5 
 
 
768 aa  141  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  32.61 
 
 
768 aa  141  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  37.36 
 
 
3736 aa  132  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  53.85 
 
 
768 aa  124  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  34.19 
 
 
2927 aa  120  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  33.89 
 
 
1757 aa  120  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  33.52 
 
 
4430 aa  115  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  37.46 
 
 
1699 aa  115  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  33.53 
 
 
4428 aa  113  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  40.86 
 
 
1424 aa  112  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  34.97 
 
 
2839 aa  110  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  59.05 
 
 
1827 aa  110  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  32.57 
 
 
2886 aa  100  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  49.12 
 
 
260 aa  98.2  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.33 
 
 
1795 aa  97.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44 
 
 
3427 aa  98.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  48.41 
 
 
357 aa  98.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  30.97 
 
 
1902 aa  97.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  54.46 
 
 
946 aa  97.8  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  41.98 
 
 
1151 aa  97.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  46.67 
 
 
2105 aa  97.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  52.25 
 
 
202 aa  95.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  52.25 
 
 
202 aa  95.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  45.31 
 
 
2145 aa  94.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  50.47 
 
 
243 aa  94.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  32.42 
 
 
1359 aa  94.4  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  51.89 
 
 
1499 aa  93.2  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  52 
 
 
2193 aa  93.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  30.95 
 
 
4480 aa  93.2  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  29.82 
 
 
1641 aa  92.8  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  37.44 
 
 
3314 aa  92  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  44.83 
 
 
572 aa  91.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  55.14 
 
 
3619 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  55.14 
 
 
3619 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.05 
 
 
485 aa  90.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.78 
 
 
1236 aa  89.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.93 
 
 
980 aa  89.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  44.72 
 
 
744 aa  89.4  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  49.09 
 
 
595 aa  89.4  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  38.16 
 
 
5171 aa  89.4  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  44.2 
 
 
982 aa  89.4  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.67 
 
 
1963 aa  89.4  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  46.79 
 
 
582 aa  89  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  50.48 
 
 
1156 aa  87.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  46.79 
 
 
679 aa  88.2  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  43.62 
 
 
219 aa  88.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  47.06 
 
 
2329 aa  88.2  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  44.07 
 
 
813 aa  88.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  44.14 
 
 
742 aa  87.8  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  46.79 
 
 
585 aa  88.2  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  41.1 
 
 
2667 aa  87.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  41.1 
 
 
2885 aa  87  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  46.15 
 
 
4798 aa  87.8  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  45.36 
 
 
998 aa  87.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  47.75 
 
 
686 aa  87  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  45.45 
 
 
639 aa  86.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  45.45 
 
 
709 aa  86.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4310  Hemolysin-type calcium-binding region  44.25 
 
 
620 aa  85.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  51.22 
 
 
1895 aa  85.9  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.28 
 
 
2678 aa  85.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  46.43 
 
 
795 aa  85.9  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  44 
 
 
615 aa  85.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  43.66 
 
 
1164 aa  85.1  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  58.02 
 
 
950 aa  84.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  40.15 
 
 
2954 aa  84.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  47.37 
 
 
4334 aa  83.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  46.85 
 
 
757 aa  83.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  44.86 
 
 
1306 aa  83.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  45.54 
 
 
606 aa  83.2  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  36.14 
 
 
724 aa  82.8  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  47.97 
 
 
396 aa  83.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>