| Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
| Locus tag | PsycPRwf_1026 |
|---|
| Symbol | |
|---|
| ID | 5205887 |
|---|
| Type | CDS |
|---|
| Is gene spliced | No |
|---|
| Is pseudo gene | No |
|---|
| Organism name | Psychrobacter sp. PRwf-1 |
|---|
| Kingdom | Bacteria |
|---|
| Replicon accession | NC_009524 |
|---|
| Strand | + |
|---|
| Start bp | 1219464 |
|---|
| End bp | 1230014 |
|---|
| Gene Length | 10551 bp |
|---|
| Protein Length | 3516 aa |
|---|
| Translation table | 11 |
|---|
| GC content | 47% |
|---|
| IMG OID | 640599247 |
|---|
| Product | hypothetical protein |
|---|
| Protein accession | YP_001279926 |
|---|
| Protein GI | 148652833 |
|---|
| COG category | |
|---|
| COG ID | |
|---|
| TIGRFAM ID | |
|---|
| 
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Plasmid Coverage information |
| Num covering plasmid clones | 0 |
|---|
| Plasmid unclonability p-value | 1 |
|---|
| Plasmid hitchhiking | No |
|---|
| Plasmid clonability | normal |
|---|
| |
Fosmid Coverage information |
| Num covering fosmid clones | 11 |
|---|
| Fosmid unclonability p-value | 0.301497 |
|---|
| Fosmid Hitchhiker | No |
|---|
| Fosmid clonability | normal |
|---|
| |
Sequence |
| Gene sequence | GTGGCGAAGA TTGAAGATGC CGCTGGTAAC GTGGGTACTG AATCTAATGA GTTTATGCTG
ACGGTAGATA CCCAAGCGCC GACTGATAAC AACAGCATTA GCATTGATAC CTACACCGAT
GATGTTGATC CATTACAAGA TGACTTTGGT AGTGGTACAG ACACCAACGA CACCACACCG
ACCCTAAATG GTACGGTTTC TGGTTTGGCT GCTGATGATA CGGTCGGTAT TTATGATACT
GAGGGTAATC GTTTAGGGGA TGCGGTATTA AATGCAGATC GCACCGGCTT TACCTATACC
TCAGCTGCGC TTGCTGATGG TCCGCATACC TTTGTGGCGA AGATTGAAGA TGCCGCTGGT
AACGTGGGTA CTGAATCTAA TGAGTTTATG CTGACGGTAG ATACCCAAGC GCCGACTGAT
AACAACAGCA TTAGCATTGA TACCTACACC GATGATGTTG ATCCATTACA AGATGACTTT
GGTAGTGGTA CAGACACCAA CGACACCACA CCGACCCTAA ATGGTACGGT TTCTGGTTTG
GCTGCTGATG ATACGGTCGG TATTTATGAT ACTGATGGTA AGCGTTTAGG GGATGCGATA
TTAAATGCAG ATCGCACCGG CTTTACCTAT ACCTCAGCTG CGCTTGCTGA TGGTCCGCAT
ACCTTTGTGG CGAAGATTGA AGATGCCGCT GGTAACGTGG GTACTGAATC TAATGAGTTT
ATGCTGACGG TAGATACCCA AGCGCCAACC GAGAACAACA GCATTAGCAT TGATACCTAC
ACCGATGATG TTGATCCATT ACAAGGTGAC TTTGGTAGTG GTACAGACAC CAACGACACC
ACACCGACCC TAAATGGTAC GGTTTCTGGT TTGGCTGCTG ATGATACGGT CGGTATTTAT
GATACTGATG GTAATCGTTT AGGGGATGCG ATATTAAATG CAGATCGCAC CGGCTTTACC
TATACCTCAG CTGCGCTTGC TGATGGTCCG CATACCTTTG TGGCGAAGAT TGAAGATGCC
GCTGGTAACG TGGGTACTGA ATCTAATGAG TTTATGCTGA CGGTAGATAC CCAAGCGCCG
ACTGATAACA ACAGCATTAG CATTGATACC TACACCGATG ATGTTGATCC ATTACAAGAT
GACTTTGGTA GTGGTACAGA CACCAACGAC ACCACACCGA CCCTAAATGG TACGGTTTCT
GGTTTGGCCA CTGATGATAC GGTCGGTATT TATGATACTG ATGGTAAGCG TTTAGGGGAT
GCGATATTAA ATGCAGATCG CACCGGCTTT ACCTATACCT CAGCTGCGCT TGCTGATGGT
CCGCATACCT TTGTGGCGAA GATTGAAGAT GCCGCTGGTA ACGTGGGTAC TGAATCTAAT
GAGTTTATGC TGACGGTAGA TACCCAAGCG CCGACTGATA ACAACAGCAT TAGCATTGAT
ACCTACACCG ATGATGTTGA TCCATTACAA GGTGACTTTA CTAGTGGCAC AGACACCAAC
GACACCACAC CGACCCTAAA TGGTACGGTT TCTGGTTTGG CTGCTGATGA TACGGTCGGT
ATTTATGATA CTGATGGTAA GCGTTTAGGG GATGCGATAT TAAATGCAGA TCGCACCGGC
TTTACCTATA CCTCAGCTGC GCTTGCTGAT GGTCCGCATA CCTTTGTGGC GAAGATTGAA
GATGCCGCTG GTAACGTGGG TACTGAATCT AATGAGTTTA TGCTGACGGT AGATACCCAA
GCGCCGACTG ATAACAACAG CATTAGCATT GATACCTACA CCGATGATGT TGATCCATTA
CAAGATGACT TTGGTAGTGG TACAGACACC AACGACACCA CACCGACCCT AAATGGTACG
GTTTCTGGTT TGGCTGCTGA TGATACGGTC GGTATTTATG ATACTGATGG TAAGCGTTTA
GGGGATGCGA TATTAAATGC AGATCGCACC GGCTTTACCT ATACCTCAGC TGCGCTTGCT
GATGGTCCGC ATACCTTTGT GGCGAAGATT GAAGATGCCG CTGGTAACGT GGGTACTGAA
TCTAATGAGT TTATGCTGAC GGTAGATACC CAAGCGCCAA CCGAGAACAA CAGCATTAGC
ATTGATACCT ACACCGATGA TGTTGATCCA TTACAAGGTG ACTTTACTAG TGGCACAGAC
ACCAACGACA CCACACCGAC CCTAAATGGT ACGGTTTCTG GTTTGGCTGC TGATGATACG
GTCGGTATTT ATGATACTGA GGGTAATCGT TTAGGGGATG CGGTATTAAA TGCAGATCGC
ACCGGCTTTA CCTATACCTC AGCTGCGCTT GCTGATGGTC CGCATACCTT TGTGGCGAAG
ATTGAAGATG CCGCTGGTAA CGTGGGTACT GAATCTAATG AGTTTATGCT GACGGTAGAT
ACCCAAGCGC CAACCGAGAA CAACAGCATT AGCATTGATA CCTACACCGA TGATGTTGAT
CCATTACAAG ATGACTTTGG TAGTGGTACA GACACCAACG ACACCACACC GACCCTAAAT
GGTACGGTTT CTGGTTTGGC TGCTGATGAT ACGGTCGGTA TTTATGATAC TGATGGTAAT
CGTTTAGGAG ATGCGATATT AAATGCAGAT CGCACCGGCT TTACCTATAC CTCAGCTGCG
CTTGCTGATG GTCCGCATAC CTTTGTGGCG AAGATTGAAG ATGCCGCTGG TAACGTGGGT
ACTGAATCTA ATGAGTTTAT GCTGACGGTA GATACCCAAG CGCCGACTGA TAACAACAGC
ATTAGCATTG ATACCTACAC CGATGATGTT GATCCATTAC AAGATGACTT TGGTAGTGGT
ACAGACACCA ACGACACCAC ACCGACCCTA AATGGTACGG TTTCTGGTTT GGCTGCTGAT
GATACGGTCG GTATTTATGA TACTGAGGGT AATCGTTTAG GGGATGCGGT ATTAAATGCA
GATCGCACCG GCTTTACCTA TACCTCAGCT GCGCTTGCTG ATGGTCCGCA TACCTTTGTG
GCGAAGATTG AAGATGCCGC TGGTAACGTG GGTACTGAAT CTAATGAGTT TATGCTGACG
GTAGATACCC AAGCGCCGAC TGATAACAAC AGCATTAGCA TTGATACCTA CACCGATGAT
GTTGATCCAT TACAAGATGA CTTTGGTAGT GGTACAGACA CCAACGACAC CACACCGACC
CTAAATGGTA CGGTTTCTGG TTTGGCTGCT GATGATACGG TCGGTATTTA TGATACTGAT
GGTAAGCGTT TAGGGGATGC GATATTAAAT GCAGATCGCA CCGGCTTTAC CTATACCTCA
GCTGCGCTTG CTGATGGTCC GCATACCTTT GTGGCGAAGA TTGAAGATGC CGCTGGTAAC
GTGGGTACTG AATCTAATGA GTTTATGCTG ACGGTAGATA CCCAAGCGCC AACCGAGAAC
AACAGCATTA GCATTGATAC CTACACCGAT GATGTTGATC CATTACAAGG TGACTTTGGT
AGTGGTACAG ACACCAACGA CACCACACCG ACCCTAAATG GTACGGTTTC TGGTTTGGCT
GCTGATGATA CGGTCGGTAT TTATGATACT GATGGTAATC GTTTAGGGGA TGCGATATTA
AATGCAGATC GCACCGGCTT TACCTATACC TCAGCTGCGC TTGCTGATGG TCCGCATACC
TTTGTGGCGA AGATTGAAGA TGCCGCTGGT AACGTGGGTA CTGAATCTAA TGAGTTTATG
CTGACGGTAG ATACCCAAGC GCCGACTGAT AACAACAGCA TTAGCATTGA TACCTACACC
GATGATGTTG ATCCATTACA AGGTGACTTT GGTAGTGGTA CAGACACCAA CGACACCACA
CCGACCCTAA ATGGTACGGT TTCTGGTTTG GCTGCTGATG ATACGGTCGG TATTTATGAT
ACTGATGGTA ATCGTTTAGG GGATGCGATA TTAAATGCAG ATCGCACCGG CTTTACCTAT
ACCTCAGCTG CGCTTGCTGA TGGTCCGCAT ACCTTTGTGG CGAAGATTGA AGATGCCGCT
GGTAACGTGG GTACTGAATC TAATGAGTTT ATGCTGACGG TAGATACCCA AGCGCCGACT
GATAACAACA GCATTAGCAT TGATACCTAC ACCGATGATG TTGATCCATT ACAAGATGAC
TTTGGTAGTG GTACAGACAC CAACGACACC ACACCGACCC TAAATGGTAC GGTTTCTGGT
TTGGCCACTG ATGATACGGT CGGTATTTAT GATACTGATG GTAAGCGTTT AGGGGATGCG
ATATTAAATG CAGATCGCAC CGGCTTTACC TATACCTCAG CTGCGCTTGC TGATGGTCCG
CATACCTTTG TGGCGAAGAT TGAAGATGCC GCTGGTAACG TGGGTACTGA ATCTAATGAG
TTTATGCTGA CGGTAGATAC CCAAGCGCCG ACTGATAACA ACAGCATTAG CATTGATACC
TACACCGATG ATGTTGATCC ATTACAAGGT GACTTTACTA GTGGCACAGA CACCAACGAC
ACCACACCGA CCCTAAATGG TACGGTTTCT GGTTTGGCTG CTGATGATAC GGTCGGTATT
TATGATACTG ATGGTAAGCG TTTAGGGGAT GCGATATTAA ATGCAGATCG CACCGGCTTT
ACCTATACCT CAGCTGCGCT TGCTGATGGT CCGCATACCT TTGTGGCGAA GATTGAAGAT
GCCGCTGGTA ACGTGGGTAC TGAATCTAAT GAGTTTATGC TAACGGTAGA TACCCAAGCG
CCAACCGAGA ACAACAGCAT TAGCATTGAT ACCTACACCG ATGATGTTGA TCCATTACAA
GGTGACTTTA CTAGTGGCAC AGACACCAAC GACACCACAC CGACCCTAAA TGGTACGGTT
TCTGGTTTGG CTGCTGATGA TACGGTCGGT ATTTATGATA CTGAGGGTAA TCGTTTAGGG
GATGCGGTAT TAAATGCAGA TCGCACCGGC TTTACCTATA CCTCAGCTGC GCTTGCTGAT
GGTCCGCATA CCTTTGTGGC GAAGATTGAA GATGCCGCTG GTAACGTGGG TACTGAATCT
AATGAGTTTA TGCTGACGGT AGATACCCAA GCGCCAACCG AGAACAACAG CATTAGCATT
GATACCTACA CCGATGATGT TGATCCATTA CAAGATGACT TTGGTAGTGG TACAGACACC
AACGACACCA CACCGACCCT AAATGGTACG GTTTCTGGTT TGGCTGCTGA TGATACGGTC
GGTATTTATG ATACTGATGG TAATCGTTTA GGGGATGCGA TATTAAATGC AGATCGCACC
GGCTTTACCT ATACCTCAGC TGCGCTTGCT GATGGTCCGC ATACCTTTGT GGCGAAGATT
GAAGATGCCG CTGGTAACGT GGGTACTGAA TCTAATGAGT TTATGCTGAC GGTAGATACC
CAAGCGCCGA CTGAGAACAA CAGCATTAGC ATTGATACCT ACACCGATGA TGTTGATCCA
TTACAAGATG ACTTTGGTAG TGGTACAGAC ACCAACGACA CCACACCGAC CCTAAATGGT
ACGGTTTCTG GTTTGGCTGC TGATGATACG GTCGGTATTT ATGATACTGA GGGTAATCGT
TTAGGGGATG CGATATTAAA TGCAGATCGC ACCGGCTTTA CCTATACCTC AGCTGCGCTT
GCTGATGGTC CGCATACCTT TGTGGCGAAG ATTGAAGATG CCGCTGGTAA CGTGGGTACT
GAATCTAATG AGTTTATGCT GACGGTAGAT ACCCAAGCGC CGACTGATAA CAACAGCATT
AGCATTGATA CCTACACCGA TGATGTTGAT CCATTACAAG ATGACTTTGG TAGTGGTACA
GACACCAACG ACACCACACC GACCCTAAAT GGTACGGTTT CTGGTTTGGC TGCTGATGAT
ACGGTCGGTA TTTATGATAC TGATGGTAAG CGTTTAGGGG ATGCGATATT AAATGCAGAT
CGCACCGGCT TTACCTATAC CTCAGCTGCG CTTGCTGATG GTCCGCATAC CTTTGTGGCG
AAGATTGAAG ATGCCGCTGG TAACGTGGGT ACTGAATCTA ATGAGTTTAT GCTGACGGTA
GATACCCAAG CGCCAACCGA GAACAACAGC ATTAGCATTG ATACCTACAC CGATGATGTT
GATCCATTAC AAGGTGACTT TGGTAGTGGT ACAGACACCA ACGACACCAC ACCGACCCTA
AATGGTACGG TTTCTGGTTT GGCTGCTGAT GATACGGTCG GTATTTATGA TACTGATGGT
AATCGTTTAG GGGATGCGGT ATTAAATGCA GATCGCACCG GCTTTACCTA TACCTCAGCT
GCGCTTGCTG ATGGTCCGCA TACCTTTGTG GCGAAGATTG AAGATGCCGC TGGTAACGTG
GGTACTGAAT CTAATGAGTT TATGCTGACG GTAGATACCC AAGCGCCAAC CGAGAACAAC
AGCATTAGCA TTGATACCTA CACCGATGAT GTTGATCCAT TACAAGGTGA CTTTACTAGT
GGCACAGACA CCAACGACAC CACACCGACC CTAAATGGTA CGGTTTCTGG TTTGGCTGCT
GATGATACGG TCGGTATTTA TGATACTGAT GGTAATCGTT TAGGGGATGC GATATTAAAT
GCAGATCGCA CCGGCTTTAC CTATACCTCA GCTGCGCTTG CTGATGGTCC GCATACCTTT
GTGGCGAAGA TTGAAGATGC CGCTGGTAAC GTGGGTACTG AATCTAATGA GTTTATGCTG
ACGGTAGATA CCCAAGCGCC GACTGATAAC AACAGCATTA GCATTGATAC CTACACCGAT
GATGTTGATC CATTACAAGG TGACTTTGGT AGTGGTACAG ACACCAACGA CACCACACCG
ACCCTAAATG GTACAGTTTC TGGTTTGGCT GCTGATGATA CGGTCGGTAT TTATGATACT
GAGGGTAATC GTTTAGGGGA TGCGGTATTA AATGCAGATC GCACCGGCTT TACCTATACC
TCAGCTGCGC TTGCTGATGG TCCGCATACC TTTGTGGCGA AGATTGAAGA TGCCGCTGGT
AACGTGGGTA CTGAATCTAA TGAGTTTATG CTGACGGTAG ATACCCAAGC GCCGACTGAT
AACAACAGCA TTAGCATTGA TACCTACACC GATGATGTTG ATCCATTACA AGATGACTTT
GGTAGTGGTA CAGACACCAA CGACACCACA CCGACCCTAA ATGGTACGGT TTCTGGTTTG
GCTGCTGATG ATACGGTCGG TATTTATGAT ACTGATGGTA ATCGTTTAGG GGATGCGGTA
TTAAATGCAG ATCGCACCGG CTTTACCTAT ACCTCAGCTG CGCTTGCTGA TGGTCCGCAT
ACCTTTGTGG CGAAGATTGA AGATGCCGCT GGTAACGTGG GTACTGAATC TAATGAGTTT
ATGCTGACGG TAGATACCCA AGCGCCAACC GAGAACAACA GCATTAGCAT TGATACCTAC
ACCGATGATG TTGATCCATT ACAAGGTGAC TTTGGTAGTG GTACAGACAC CAACGACACC
ACACCGACCC TAAATGGTAC GGTTTCTGGT TTGGCTGCTG ATGATACGGT CGGTATTTAT
GATACTGATG GTAATCGTTT AGGGGATGCG ATATTAAATG CAGATCGCAC CGGCTTTACC
TATACCTCAG CTGCGCTTGC TGATGGTCCG CATACCTTTG TGGCGAAGAT TGAAGATGCC
GCTGGTAACG TGGGTACTGA ATCTAATGAG TTTATGCTGA CGGTAGATAC CCAAGCGCCG
ACTGATAACA ACAGCATTAG CATTGATACC TACACCGATG ATGTTGATCC ATTACAAGAT
GACTTTGGTA GTGGTACAGA CACCAACGAC ACCACACCGA CCCTAAATGG TACGGTTTCT
GGTTTGGCTG CTGATGATAC GGTCGGTATT TATGATACTG ATGGTAAGCG TTTAGGGGAT
GCGATATTAA ATGCAGATCG CACCGGCTTT ACCTATACCT CAGCTGCGCT TGCTGATGGT
CCGCATACCT TTGTGGCGAA GATTGAAGAT GCCGCTGGTA ACGTGGGTAC TGAATCTAAT
GAGTTTATGC TGACGGTAGA TACCCAAGCG CCGACTGATA ACAACAGCAT TAGCATTGAT
ACCTACACCG ATGATGTTGA TCCATTACAA GATGACTTTG GTAGTGGTAC AGACACCAAC
GACACCACAC CGACCCTAAA TGGTACGGTT TCTGGTTTGG CTGCTGATGA TACGGTCGGT
ATTTATGATA CTGAGGGTAA TCGTTTAGGG GATGCGGTAT TAAATGCAGA TCGCACCGGC
TTTACCTATA CCTCAGCTGC GCTTGCTGAT GGTCCGCATA CCTTTGTGGC GAAGATTGAA
GATGCCGCTG GTAACGTGGG TACTGAATCT AATGAGTTTA TGCTGACGGT AGATACCCAA
GCGCCGACTG ATAACAACAG CATTAGCATT GATACCTACA CCGATGATGT TGATCCATTA
CAAGATGACT TTGGTAGTGG TACAGACACC AACGACACCA CACCGACCCT AAATGGTACG
GTTTCTGGTT TGGCTGCTGA TGATACGGTC GGTATTTATG ATACTGATGG TAATCGTTTA
GGGGATGCGA TATTAAATGC AGATCGCACC GGCTTTACCT ATACCTCAGC TGCGCTTGCT
GATGGTCCGC ATACCTTTGT GGCGAAGATT GAAGATGCCG CTGGTAACGT GGGTACTGAA
TCTAATGAGT TTATGCTGAC GGTAGATACC CAAGCGCCGA CTGATAACAA CAGCATTAGC
ATTGATACCT ACACCGATGA TGTTGATCCA TTACAAGATG ACTTTGGTAG TGGTACAGAC
ACCAACGACA CCACACCGAC CCTAAATGGT ACGGTTTCTG GTTTGGCTGC TGATGATACG
GTCGGTATTT ATGATACTGA TGGTAATCGT TTAGGGGATG CGGTATTAAA TGCAGATCGC
ACCGGCTTTA CCTATACCTC AGCTGCGCTT GCTGATGGTC CGCATACCTT TGTGGCGAAG
ATTGAAGATG CCGCTGGTAA CGTGGGTACT GAATCTAATG AGTTTATGCT GACGGTAGAT
ACCCAAGCGC CGACTGATAA CAACAGCATT AGCATTGATA CCTACACCGA TGATGTTGAT
CCATTACAAG ATGACTTTGG TAGTGGTACA GACACCAACG ACACCACACC GACCCTAAAT
GGTACGGTTT CTGGTTTGGC TGCTGATGAT ACGGTCGGTA TTTATGATAC TGAGGGTAAT
CGTTTAGGGG ATGCGGTATT AAATGCAGAT CGCACCGGCT TTACCTATAC CTCAGCTGCG
CTTGCTGATG GTCCGCATAC CTTTGTGGCG AAGATTGAAG ATGCCGCTGG TAACGTGGGT
ACTGAATCTA ATGAGTTTAT GCTGACGGTA GATACCCAAG CGCCGACTGA TAACAACAGC
ATTAGCATTG ATACCTACAC CGATGATGTT GATCCATTAC AAGGTGACTT TGGTAGTGGT
ACAGACACCA ACGACACCAC ACCGACCCTA AATGGTACAG TTTCTGGTTT GGCTGCTGAT
GATACGGTCG GTATTTATGA TACTGAGGGT AATCGTTTAG GGGATGCGGT ATTAAATGCA
GATCGCACCG GCTTTACCTA TACCTCAGCT GCGCTTGCTG ATGGTCCGCA TACCTTTGTG
GCGAAGATTG AAGATGCCGC TGGTAACGTG GGTACTGAAT CTAATGAGTT TATGCTGACG
GTAGATACCC AAGCGCCGAC TGATAACAAC AGCATTAGCA TTGATACCTA CACCGATGAT
GTTGATCCAT TACAAGATGA CTTTGGTAGT GGTACAGACA CCAACGACAC CACACCGACC
CTAAATGGTA CGGTTTCTGG TTTGGCTGCT GATGATACGG TCGGTATTTA TGATACTGAT
GGTAATCGTT TAGGGGATGC GGTATTAAAT GCAGATCGCA CCGGCTTTAC CTATACCTCA
GCTGCGCTTG CTGATGGTCC GCATACCTTT GTGGCGAAGA TTGAAGATGC CGCTGGTAAC
GTGGGTACTG AATCTAATGA GTTTATGCTG ACGGTAGATA CCCAAGCGCC GACTGATAAC
AACAGCATTA GCATTGATAC CTACACCGAT GATGTTGATC CATTACAAGA TGACTTTGGT
AGTGGTACAG ACACCAACGA CACCACACCG ACCCTAAATG GTACGGTTTC TGGTTTGGCT
GCTGATGATA CGGTCGGTAT TTATGATACT GAGGGTAATC GTTTAGGGGA TGCGGTATTA
AATGCAGATC GCACCGGCTT TACCTATACC TCAGCTGCGC TTGCTGATGG TCCGCATACC
TTTGTGGCGA AGATTGAAGA TGCCGCTGGT AACGTGGGTA CTGAATCTAA TGAGTTTATG
CTGACGGTAG ATACCCAAGC GCCGACTGAT AACAACAGCA TTAGCATTGA TACCTACACC
GATGATGTTG ATCCATTACA AGGTGACTTT GGTAGTGGTA CAGACACCAA CGACACCACA
CCGACCCTAA ATGGTACGGT TTCTGGTTTG GCTGCTGATG ATACGGTCTG A
|
|---|
| Protein sequence | MAKIEDAAGN VGTESNEFML TVDTQAPTDN NSISIDTYTD DVDPLQDDFG SGTDTNDTTP
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TYTDDVDPLQ GDFTSGTDTN DTTPTLNGTV SGLAADDTVG IYDTDGKRLG DAILNADRTG
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