70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3385 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  100 
 
 		 1792 aa  3442    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  31.01 
 
 		 1278 aa  100  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  26.95 
 
 		 4689 aa  92  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  33.62 
 
 		 3325 aa  89  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  25.11 
 
 		 2344 aa  87.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  28.74 
 
 		 1795 aa  84.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  36.16 
 
 		 2927 aa  82  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  39.52 
 
 		 4106 aa  77.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  42.11 
 
 		 2039 aa  72.4  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  29.33 
 
 		 3586 aa  72  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  25.12 
 
 		 2552 aa  69.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.36 
 
 		 3552 aa  67.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  48.48 
 
 		 3734 aa  66.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  36.21 
 
 		 2775 aa  64.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  30 
 
 		 2704 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  46.94 
 
 		 3736 aa  64.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  34.02 
 
 		 3824 aa  63.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  34.02 
 
 		 3824 aa  63.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  34.44 
 
 		 3721 aa  63.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  34.02 
 
 		 3739 aa  63.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  32.46 
 
 		 3824 aa  62.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  33.56 
 
 		 5080 aa  60.5  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  34.48 
 
 		 1712 aa  60.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  30.92 
 
 		 1152 aa  60.1  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  34.48 
 
 		 2885 aa  58.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  34.48 
 
 		 2667 aa  57.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  28.63 
 
 		 3204 aa  55.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  33.9 
 
 		 3562 aa  54.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.62 
 
 		 1236 aa  55.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  28.63 
 
 		 2911 aa  55.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  31.25 
 
 		 635 aa  53.5  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.59 
 
 		 3314 aa  53.5  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  30.26 
 
 		 1047 aa  53.5  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  28.57 
 
 		 5743 aa  52.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  30.14 
 
 		 744 aa  51.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.35 
 
 		 2812 aa  51.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  31.28 
 
 		 739 aa  50.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  22.83 
 
 		 653 aa  50.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.43 
 
 		 1505 aa  49.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  24.9 
 
 		 1951 aa  49.7  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2987  Fibronectin type III domain protein  25.89 
 
 		 1301 aa  49.3  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0839301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5663  hypothetical protein  38.1 
 
 		 846 aa  48.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198442  normal  0.529152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  35 
 
 		 8064 aa  48.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  35.71 
 
 		 899 aa  48.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  38.89 
 
 		 1827 aa  48.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  27.77 
 
 		 1657 aa  48.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  34.17 
 
 		 5451 aa  48.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5612  hypothetical protein  38.27 
 
 		 809 aa  48.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352581  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  30.3 
 
 		 1219 aa  48.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  36.04 
 
 		 747 aa  47.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  23.61 
 
 		 3699 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  42.64 
 
 		 4430 aa  47.8  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  29.83 
 
 		 4120 aa  47  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  28.25 
 
 		 513 aa  47  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.06 
 
 		 3699 aa  47  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6493  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  30.65 
 
 		 1102 aa  47  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  31.86 
 
 		 678 aa  47  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6263  hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 		 260 aa  47  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  31.11 
 
 		 820 aa  47  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  25 
 
 		 1332 aa  47  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  34.17 
 
 		 6310 aa  46.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  37.3 
 
 		 3923 aa  46.6  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1406 aa  46.6  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  32.52 
 
 		 3516 aa  46.2  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  25.45 
 
 		 1570 aa  45.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  30.67 
 
 		 2890 aa  45.8  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  32.22 
 
 		 482 aa  45.8  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  35.8 
 
 		 675 aa  45.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  26.64 
 
 		 4214 aa  45.4  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  38.89 
 
 		 2456 aa  45.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>