121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4512 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  28.8 
 
 		 4106 aa  737    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  30.96 
 
 		 4430 aa  943    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  98.45 
 
 		 5559 aa  10830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  99.41 
 
 		 5561 aa  11010    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  100 
 
 		 5561 aa  11080    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  97.61 
 
 		 5561 aa  10730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  98.4 
 
 		 5559 aa  10810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  28.73 
 
 		 6779 aa  609  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.98 
 
 		 6683 aa  596  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  29.07 
 
 		 6662 aa  598  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  28.12 
 
 		 7149 aa  587  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  27.62 
 
 		 3736 aa  543  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  27.01 
 
 		 3734 aa  526  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  29.01 
 
 		 3562 aa  473  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  28.16 
 
 		 3739 aa  461  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  27.7 
 
 		 3325 aa  442  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  27.05 
 
 		 3721 aa  437  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  27.1 
 
 		 3824 aa  421  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  27.16 
 
 		 3824 aa  418  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  27.89 
 
 		 2704 aa  414  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  27.13 
 
 		 3824 aa  415  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  25.79 
 
 		 4689 aa  410  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.17 
 
 		 3552 aa  392  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  28.42 
 
 		 3204 aa  355  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  28.73 
 
 		 2911 aa  334  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  26.51 
 
 		 3516 aa  333  6e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  25.64 
 
 		 4874 aa  328  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  32.27 
 
 		 2927 aa  271  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  26.59 
 
 		 2625 aa  257  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  25.68 
 
 		 2456 aa  241  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.12 
 
 		 3314 aa  221  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  27.38 
 
 		 5171 aa  221  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  25.92 
 
 		 4678 aa  200  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.61 
 
 		 5839 aa  194  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  25.45 
 
 		 5080 aa  183  8e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  31.21 
 
 		 5442 aa  146  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  30.87 
 
 		 4791 aa  145  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.39 
 
 		 5216 aa  136  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  25.9 
 
 		 1461 aa  135  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  23.76 
 
 		 5451 aa  133  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1278 aa  130  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  24.57 
 
 		 3923 aa  128  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  26.27 
 
 		 2552 aa  126  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  24.76 
 
 		 6310 aa  117  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  24.92 
 
 		 8064 aa  114  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0783  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.04 
 
 		 3323 aa  113  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  25.49 
 
 		 4480 aa  109  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  34 
 
 		 2768 aa  97.8  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.06 
 
 		 1586 aa  87  0.000000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3383  conserved repeat domain protein  23.91 
 
 		 888 aa  87  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  22.95 
 
 		 5743 aa  85.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  29.04 
 
 		 635 aa  84  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  25.45 
 
 		 1219 aa  84  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33430  Ig-like domain-containing protein  25.42 
 
 		 3230 aa  82.4  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  28.57 
 
 		 744 aa  81.6  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3150  hypothetical protein  32.08 
 
 		 959 aa  80.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  26.12 
 
 		 2402 aa  79.3  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  26.03 
 
 		 4214 aa  76.3  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  27.92 
 
 		 3333 aa  76.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  32.51 
 
 		 606 aa  75.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  24.73 
 
 		 3925 aa  75.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  26.57 
 
 		 1152 aa  75.1  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  23.7 
 
 		 1695 aa  75.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  25.23 
 
 		 3586 aa  72.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  34.62 
 
 		 1869 aa  73.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  23.81 
 
 		 1332 aa  69.7  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  30.46 
 
 		 1529 aa  68.6  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.43 
 
 		 2812 aa  66.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  26.48 
 
 		 6715 aa  63.9  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  27.07 
 
 		 2839 aa  62.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  28.65 
 
 		 739 aa  62.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  26.43 
 
 		 2802 aa  61.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  25.88 
 
 		 1047 aa  61.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  27.7 
 
 		 7284 aa  61.6  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  26.04 
 
 		 500 aa  61.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  23.91 
 
 		 1951 aa  60.8  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  25.47 
 
 		 850 aa  60.8  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  23.34 
 
 		 1570 aa  60.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  30.96 
 
 		 1597 aa  59.3  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  26.58 
 
 		 1141 aa  58.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  27.97 
 
 		 1092 aa  58.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.2 
 
 		 1919 aa  58.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  23.53 
 
 		 1570 aa  58.2  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  24.91 
 
 		 913 aa  58.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  27.61 
 
 		 549 aa  57.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  27.86 
 
 		 1787 aa  57.4  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1457 aa  57  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  24.73 
 
 		 1096 aa  57  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  26.3 
 
 		 916 aa  54.7  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  25.3 
 
 		 898 aa  54.3  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  31.25 
 
 		 4672 aa  54.3  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  23.04 
 
 		 937 aa  54.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  26.67 
 
 		 341 aa  53.9  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0593  lipoprotein (VmcD)  29.67 
 
 		 309 aa  53.1  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1439 aa  53.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  23.84 
 
 		 6109 aa  53.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  28.8 
 
 		 3758 aa  53.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  29.82 
 
 		 3391 aa  52.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1526 aa  52.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2987  Fibronectin type III domain protein  26.99 
 
 		 1301 aa  52  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0839301 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>