56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33430 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33430  Ig-like domain-containing protein  100 
 
 		 3230 aa  5868    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  26.62 
 
 		 3562 aa  256  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  30.6 
 
 		 6715 aa  216  7.999999999999999e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  30.8 
 
 		 2704 aa  194  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  28.61 
 
 		 4689 aa  174  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  25.7 
 
 		 4874 aa  162  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  27.19 
 
 		 1461 aa  147  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  25.57 
 
 		 3824 aa  134  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  25.82 
 
 		 3824 aa  135  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  26.2 
 
 		 3721 aa  132  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  25.82 
 
 		 3824 aa  130  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  29.88 
 
 		 4678 aa  124  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  27.25 
 
 		 3325 aa  122  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  28.27 
 
 		 3314 aa  118  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  25.98 
 
 		 3739 aa  117  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  24.48 
 
 		 5559 aa  117  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  24.3 
 
 		 5559 aa  116  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  24.2 
 
 		 5561 aa  113  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  28.01 
 
 		 2456 aa  109  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  28.33 
 
 		 8064 aa  99.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  28.72 
 
 		 5451 aa  97.8  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  27.34 
 
 		 2625 aa  96.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  24.07 
 
 		 5561 aa  95.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  23.9 
 
 		 5561 aa  93.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  29.35 
 
 		 5337 aa  88.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  27.54 
 
 		 3923 aa  87.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.54 
 
 		 800 aa  84.7  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  28.4 
 
 		 6310 aa  85.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  26.19 
 
 		 8918 aa  82.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  32.49 
 
 		 4672 aa  81.3  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  26.79 
 
 		 6779 aa  69.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  27.66 
 
 		 1152 aa  66.2  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  27.65 
 
 		 2839 aa  66.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  28.46 
 
 		 4106 aa  65.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  26.65 
 
 		 6662 aa  64.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.86 
 
 		 6683 aa  64.7  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  30.15 
 
 		 5171 aa  63.9  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  27.1 
 
 		 850 aa  61.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  31.45 
 
 		 739 aa  61.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1912  hypothetical protein  32.64 
 
 		 709 aa  59.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0466434  normal  0.0319715 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.46 
 
 		 3552 aa  56.2  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3516  hypothetical protein  27.12 
 
 		 575 aa  55.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154986  normal  0.302137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3383  conserved repeat domain protein  27.31 
 
 		 888 aa  55.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2448  hypothetical protein  29.05 
 
 		 567 aa  55.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  33.12 
 
 		 747 aa  54.3  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  26.7 
 
 		 4791 aa  53.5  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3261  hypothetical protein  34.43 
 
 		 823 aa  52.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1285  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  28.27 
 
 		 376 aa  51.2  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  36.32 
 
 		 747 aa  50.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  28.88 
 
 		 2262 aa  50.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17070  hypothetical protein  30.86 
 
 		 610 aa  50.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.089568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  30.48 
 
 		 4953 aa  47.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3936  Cna B domain-containing protein  28.46 
 
 		 330 aa  47.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0567855  normal  0.0675553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  27.48 
 
 		 683 aa  47.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  28.57 
 
 		 759 aa  47  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  28.22 
 
 		 1532 aa  46.6  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>