161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1001 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  40.14 
 
 		 4106 aa  1224    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  34.96 
 
 		 3824 aa  891    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  34.6 
 
 		 3824 aa  891    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  34.5 
 
 		 3739 aa  859    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.38 
 
 		 3552 aa  779    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  35.65 
 
 		 3562 aa  1002    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  34.11 
 
 		 4430 aa  728    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  100 
 
 		 3325 aa  6364    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  34.3 
 
 		 3721 aa  897    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  37.75 
 
 		 2704 aa  784    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  34.63 
 
 		 3824 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  31.88 
 
 		 3516 aa  600  1e-169  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  32.42 
 
 		 2456 aa  532  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  33.79 
 
 		 3204 aa  522  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  31.7 
 
 		 2625 aa  524  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  31.6 
 
 		 6662 aa  516  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  31.54 
 
 		 6779 aa  514  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.54 
 
 		 6683 aa  513  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  27.83 
 
 		 5559 aa  459  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  27.64 
 
 		 5559 aa  457  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  27.69 
 
 		 5561 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  27.87 
 
 		 5561 aa  457  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  26.84 
 
 		 5080 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  27.92 
 
 		 5561 aa  451  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  35.97 
 
 		 2927 aa  434  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  31.95 
 
 		 2911 aa  411  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  32.01 
 
 		 4480 aa  392  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  28.01 
 
 		 4874 aa  320  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  32.59 
 
 		 3314 aa  319  6e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  31.65 
 
 		 6715 aa  316  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  28.82 
 
 		 7149 aa  313  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  46.45 
 
 		 1278 aa  299  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  28.49 
 
 		 4689 aa  266  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  28.13 
 
 		 3736 aa  250  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  27.64 
 
 		 3734 aa  241  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  31.75 
 
 		 5171 aa  240  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  26.89 
 
 		 8064 aa  236  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  27.57 
 
 		 5451 aa  229  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  27.22 
 
 		 6310 aa  224  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  30.21 
 
 		 1461 aa  216  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  27.47 
 
 		 3923 aa  201  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  42.91 
 
 		 5769 aa  192  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  35.94 
 
 		 2839 aa  183  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  28.77 
 
 		 4791 aa  162  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  26.31 
 
 		 4678 aa  160  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  29.87 
 
 		 3586 aa  154  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.8 
 
 		 5216 aa  154  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  31.08 
 
 		 3333 aa  130  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.63 
 
 		 5839 aa  127  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  27.03 
 
 		 500 aa  116  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  34.89 
 
 		 635 aa  113  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  39.6 
 
 		 1586 aa  101  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  31.49 
 
 		 739 aa  98.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  39.13 
 
 		 1869 aa  95.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  29.02 
 
 		 1529 aa  94.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  25.63 
 
 		 1951 aa  94.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  34.45 
 
 		 606 aa  90.9  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  26.13 
 
 		 5743 aa  89.7  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  27.83 
 
 		 1462 aa  89  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.85 
 
 		 6885 aa  89.4  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  31.38 
 
 		 2768 aa  88.2  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  33.62 
 
 		 1792 aa  88.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  27.33 
 
 		 5442 aa  88.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3150  hypothetical protein  31.29 
 
 		 959 aa  87.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  27.42 
 
 		 850 aa  84.7  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  26.36 
 
 		 1096 aa  84.7  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.68 
 
 		 2812 aa  84.3  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  27.51 
 
 		 1219 aa  82  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  25.44 
 
 		 1695 aa  81.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  26.97 
 
 		 1152 aa  80.9  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  33.33 
 
 		 1092 aa  79.3  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  33.33 
 
 		 3758 aa  78.2  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  24.51 
 
 		 1332 aa  76.6  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  27.64 
 
 		 1428 aa  76.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1061 aa  75.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  24.11 
 
 		 2552 aa  74.7  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  29.64 
 
 		 1424 aa  73.6  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  27.93 
 
 		 937 aa  72.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  24.08 
 
 		 2402 aa  72  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33430  Ig-like domain-containing protein  26.05 
 
 		 3230 aa  70.1  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2918  hypothetical protein  31.97 
 
 		 714 aa  69.3  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  32 
 
 		 1526 aa  68.6  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.4 
 
 		 2239 aa  68.6  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  27.26 
 
 		 898 aa  67.4  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  25.87 
 
 		 913 aa  67  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  41.67 
 
 		 726 aa  66.6  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  27.96 
 
 		 3925 aa  66.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  31.71 
 
 		 6678 aa  65.9  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  36.81 
 
 		 747 aa  66.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  27.33 
 
 		 675 aa  66.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  30.2 
 
 		 1047 aa  64.3  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3383  conserved repeat domain protein  29.64 
 
 		 888 aa  64.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  25.3 
 
 		 2715 aa  64.3  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  28.37 
 
 		 4214 aa  63.9  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  32.21 
 
 		 747 aa  63.2  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  21.88 
 
 		 744 aa  62.4  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.72 
 
 		 1919 aa  62.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  30.46 
 
 		 899 aa  62.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1452 aa  62  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  29.67 
 
 		 696 aa  62  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>