189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1101 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
1462 aa  2771    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.66 
 
 
6885 aa  218  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  29.14 
 
 
9585 aa  207  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  31.34 
 
 
2170 aa  187  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  38.27 
 
 
680 aa  174  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  35.18 
 
 
1628 aa  167  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  29.48 
 
 
1695 aa  141  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  29.67 
 
 
741 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  26.04 
 
 
1351 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  26.87 
 
 
5743 aa  102  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  30.56 
 
 
803 aa  97.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  27.93 
 
 
3325 aa  95.9  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  35.38 
 
 
1199 aa  94.4  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  32.46 
 
 
428 aa  93.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  29.95 
 
 
560 aa  90.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4034  fibronectin type III domain-containing protein  26.07 
 
 
454 aa  88.6  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  28.3 
 
 
1221 aa  87  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  29.37 
 
 
841 aa  86.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  36.71 
 
 
3802 aa  84.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2773  Fibronectin type III domain protein  28.47 
 
 
690 aa  84.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000670095 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  34.76 
 
 
456 aa  83.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3451  hypothetical protein  25 
 
 
687 aa  83.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00623821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  31.06 
 
 
782 aa  82.8  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  32.81 
 
 
455 aa  83.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  34.41 
 
 
458 aa  83.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011654  BCAH187_D0017  fibronectin type III domain protein  25.58 
 
 
481 aa  82.4  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  31.65 
 
 
836 aa  82.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  32.47 
 
 
480 aa  82.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  38.98 
 
 
743 aa  80.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  32.81 
 
 
455 aa  80.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  23.96 
 
 
1042 aa  79.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1219  fibronectin type III domain-containing protein  23.61 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  31.18 
 
 
455 aa  79  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  28.16 
 
 
4430 aa  79  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  31.72 
 
 
455 aa  79  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  31.72 
 
 
455 aa  79  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  30.08 
 
 
667 aa  77.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  30.71 
 
 
6310 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  32.29 
 
 
458 aa  77.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  31.33 
 
 
692 aa  77.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0640  Fibronectin type III domain protein  27.89 
 
 
404 aa  76.6  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0196  fibronectin, type III  28.4 
 
 
354 aa  76.3  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  32.26 
 
 
456 aa  75.5  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  33.45 
 
 
647 aa  75.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  32.8 
 
 
455 aa  75.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0017  fibronectin type III domain protein  33.17 
 
 
207 aa  75.1  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.857049  normal  0.0757173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  29.35 
 
 
1401 aa  74.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  28.34 
 
 
1879 aa  75.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  30.11 
 
 
455 aa  73.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  30.21 
 
 
455 aa  74.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  31.11 
 
 
455 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  29.47 
 
 
8064 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  30.11 
 
 
455 aa  73.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  35.4 
 
 
465 aa  73.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  36.36 
 
 
1067 aa  73.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  34.97 
 
 
464 aa  73.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  32.98 
 
 
459 aa  72.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  30.56 
 
 
455 aa  72  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  40.4 
 
 
762 aa  72  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0446  fibronectin type III domain-containing protein  23.5 
 
 
409 aa  70.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  30.12 
 
 
2067 aa  70.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1295  fibronectin type III domain-containing protein  24 
 
 
410 aa  69.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  34.05 
 
 
683 aa  69.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  36.97 
 
 
1550 aa  68.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  31.1 
 
 
1401 aa  68.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  35.26 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  26.1 
 
 
804 aa  68.6  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1415  fibronectin type III domain-containing protein  23.43 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1288  fibronectin type III domain-containing protein  22.69 
 
 
394 aa  68.2  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  26.32 
 
 
2193 aa  67.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  34.87 
 
 
648 aa  67.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  34.32 
 
 
1230 aa  67.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  36.04 
 
 
1160 aa  67  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  28.83 
 
 
2052 aa  66.6  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  29.05 
 
 
5451 aa  65.9  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  26.38 
 
 
1847 aa  65.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  35.8 
 
 
973 aa  65.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0610  fibronectin type III domain protein  22.34 
 
 
404 aa  64.3  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  28.76 
 
 
903 aa  64.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  41.43 
 
 
680 aa  63.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  35.71 
 
 
539 aa  63.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  29.25 
 
 
2286 aa  63.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  30.93 
 
 
1973 aa  62.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  27.55 
 
 
2552 aa  62.4  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  34.05 
 
 
598 aa  62  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 
1363 aa  61.6  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  38.33 
 
 
2927 aa  60.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0784  fibronectin, type III  22.22 
 
 
444 aa  61.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  38.41 
 
 
1209 aa  60.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.6 
 
 
795 aa  60.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  29.91 
 
 
1242 aa  60.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.36 
 
 
1448 aa  59.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3437  fibronectin type III domain-containing protein  29.74 
 
 
1135 aa  59.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230863  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  28.73 
 
 
864 aa  59.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.09 
 
 
809 aa  58.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  25.82 
 
 
2656 aa  58.9  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1446  fibronectin, type III domain-containing protein  31.44 
 
 
1089 aa  58.5  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  36.41 
 
 
561 aa  58.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  33.63 
 
 
670 aa  58.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  28.73 
 
 
3562 aa  57.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>