51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4208 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  100 
 
 
3333 aa  6543    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  26.21 
 
 
6211 aa  220  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  25.29 
 
 
3263 aa  206  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  25.83 
 
 
5123 aa  159  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  28.95 
 
 
4874 aa  146  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  32.71 
 
 
1461 aa  144  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  30.48 
 
 
3325 aa  128  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  32.81 
 
 
3314 aa  103  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0729  hemolysin-type calcium-binding region  24.63 
 
 
7072 aa  101  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.971517 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  28.99 
 
 
5444 aa  100  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  30.18 
 
 
4678 aa  100  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  28.51 
 
 
4689 aa  95.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  30.49 
 
 
2839 aa  90.9  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  25 
 
 
2125 aa  89.4  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  24.59 
 
 
4748 aa  82.4  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2545  hemolysin-type calcium-binding region  23.53 
 
 
4451 aa  77  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.15154 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  27.97 
 
 
5561 aa  76.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  27.92 
 
 
5561 aa  76.3  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  27.92 
 
 
5561 aa  76.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  28.29 
 
 
5559 aa  75.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  28.29 
 
 
5559 aa  74.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.3 
 
 
2812 aa  73.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.8 
 
 
6683 aa  72.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  30.66 
 
 
4214 aa  72.8  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  30.02 
 
 
6662 aa  72.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  29.82 
 
 
6779 aa  70.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  25.18 
 
 
5769 aa  66.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.14 
 
 
5098 aa  65.1  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  25.1 
 
 
5442 aa  64.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  28.47 
 
 
606 aa  64.7  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  26.9 
 
 
7149 aa  62  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.1 
 
 
5839 aa  60.1  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  28.04 
 
 
4791 aa  59.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.92 
 
 
4106 aa  59.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  27.48 
 
 
2768 aa  59.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  28.89 
 
 
739 aa  58.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1846  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.04 
 
 
4876 aa  57  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  30.88 
 
 
2715 aa  56.6  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  30.84 
 
 
2353 aa  56.6  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  22.55 
 
 
7233 aa  55.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  25.26 
 
 
500 aa  54.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1662  von Willebrand factor type A  26.75 
 
 
6006 aa  53.9  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3319  structural toxin protein RtxA  23.85 
 
 
2159 aa  51.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  26.08 
 
 
2625 aa  51.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  28.68 
 
 
16322 aa  50.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2918  hypothetical protein  27.12 
 
 
714 aa  50.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2503  hypothetical protein  30.03 
 
 
2489 aa  48.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.260274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  30.34 
 
 
1166 aa  48.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.49 
 
 
3396 aa  47  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  27.94 
 
 
3586 aa  47  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  30.6 
 
 
7919 aa  46.2  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>