83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0899 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  100 
 
 
5080 aa  10020    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  27.03 
 
 
3739 aa  524  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  29.47 
 
 
4106 aa  461  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  27.99 
 
 
3824 aa  450  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  27.73 
 
 
3824 aa  437  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  27.31 
 
 
3325 aa  432  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  26.84 
 
 
3721 aa  429  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.51 
 
 
3552 aa  400  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  27.8 
 
 
2704 aa  382  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  29.23 
 
 
3824 aa  297  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  26.53 
 
 
3516 aa  297  4e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  26.61 
 
 
2625 aa  290  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  27.9 
 
 
3562 aa  273  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  26.43 
 
 
2456 aa  258  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.8 
 
 
1586 aa  228  3e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  25.6 
 
 
2911 aa  218  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  25.08 
 
 
3204 aa  216  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  25.36 
 
 
4430 aa  216  7.999999999999999e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  26.94 
 
 
2927 aa  198  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  25.74 
 
 
6779 aa  192  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.67 
 
 
6683 aa  188  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  25.32 
 
 
5559 aa  186  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  25.57 
 
 
5559 aa  185  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  25.45 
 
 
5561 aa  184  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  25.67 
 
 
5561 aa  182  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  26.91 
 
 
5561 aa  169  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0015  hypothetical protein  66.18 
 
 
1073 aa  166  9e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  25.53 
 
 
6662 aa  166  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2158  hypothetical protein  44.52 
 
 
1808 aa  162  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  25.71 
 
 
8064 aa  142  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  25.21 
 
 
5451 aa  142  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  25.36 
 
 
6310 aa  140  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  24.93 
 
 
3923 aa  136  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  24.22 
 
 
4480 aa  128  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0007  putative lipoprotein  47.85 
 
 
981 aa  120  5e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.949934  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  25.86 
 
 
3314 aa  117  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  34.68 
 
 
1278 aa  116  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  24 
 
 
4689 aa  113  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  26.02 
 
 
4791 aa  109  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  26.5 
 
 
7149 aa  108  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  26.81 
 
 
5442 aa  100  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  45.39 
 
 
1787 aa  98.2  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  26.69 
 
 
4214 aa  97.1  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.56 
 
 
5839 aa  95.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  27.07 
 
 
16322 aa  95.1  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  23.57 
 
 
1461 aa  94  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  24.77 
 
 
5171 aa  87.8  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0230  hypothetical protein  37.86 
 
 
657 aa  82.4  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.924729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  24.5 
 
 
4874 aa  80.5  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  27.41 
 
 
2839 aa  73.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  32.56 
 
 
635 aa  70.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  27.49 
 
 
3586 aa  70.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3150  hypothetical protein  32.73 
 
 
959 aa  69.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  33.18 
 
 
1695 aa  66.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  23.75 
 
 
500 aa  66.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  29.11 
 
 
1538 aa  66.6  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  30.57 
 
 
739 aa  65.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  27.59 
 
 
606 aa  64.3  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  26.2 
 
 
1529 aa  63.9  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  36.51 
 
 
1806 aa  61.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  36.51 
 
 
1350 aa  61.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  35.71 
 
 
1597 aa  60.8  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  33.56 
 
 
1792 aa  60.5  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.4 
 
 
5216 aa  60.8  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  25.87 
 
 
2768 aa  58.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  25.29 
 
 
747 aa  57.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  29.81 
 
 
747 aa  57  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  23.35 
 
 
5444 aa  53.9  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0568  hypothetical protein  30.2 
 
 
1766 aa  53.9  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694762  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0010  hypothetical protein  36.84 
 
 
178 aa  53.5  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  32.43 
 
 
1869 aa  53.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  35 
 
 
2542 aa  52  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  41.67 
 
 
4672 aa  50.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  38.18 
 
 
4678 aa  49.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4418  hypothetical protein  31.43 
 
 
1207 aa  48.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.535259  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  24.34 
 
 
3925 aa  48.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0418  hypothetical protein  27.92 
 
 
670 aa  48.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  32.32 
 
 
2524 aa  47.8  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  43.08 
 
 
4748 aa  47.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  31.1 
 
 
6715 aa  47.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  26.43 
 
 
1566 aa  47.8  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2688  peptidoglycan-binding LysM  29.55 
 
 
361 aa  47.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00047104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3383  conserved repeat domain protein  22.7 
 
 
888 aa  47.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466034  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>