17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0230 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0230  hypothetical protein  100 
 
 
657 aa  1295    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.924729  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0015  hypothetical protein  42.94 
 
 
1073 aa  102  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0007  putative lipoprotein  49.65 
 
 
981 aa  93.6  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.949934  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2158  hypothetical protein  42.77 
 
 
1808 aa  90.1  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  40.48 
 
 
1586 aa  68.9  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  36.43 
 
 
5080 aa  67.4  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  40.91 
 
 
1787 aa  63.9  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  32.59 
 
 
589 aa  58.9  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  28.12 
 
 
1141 aa  54.7  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  26.07 
 
 
1538 aa  51.6  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  30.77 
 
 
1895 aa  50.4  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  35.11 
 
 
2667 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1794  hypothetical protein  35.92 
 
 
480 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0931  hemolysin-type calcium-binding region  36.46 
 
 
484 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0749025  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1403  hemolysin-type calcium-binding region  41.27 
 
 
482 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0016  hypothetical protein  30.56 
 
 
468 aa  44.7  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  34.19 
 
 
3314 aa  44.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>